More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2648 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2648  ribosomal protein L24  100 
 
 
113 aa  217  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0638  ribosomal protein L24  81.42 
 
 
113 aa  184  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3132  50S ribosomal protein L24  82.61 
 
 
115 aa  165  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2964  50S ribosomal protein L24  68.91 
 
 
119 aa  157  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00916066  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17050  50S ribosomal protein L24  65.49 
 
 
113 aa  150  4e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000932171  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2676  50S ribosomal protein L24  63.56 
 
 
120 aa  145  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29630  LSU ribosomal protein L24P  72.92 
 
 
116 aa  143  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.750571 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0598  ribosomal protein L24  65.45 
 
 
116 aa  141  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0699  50S ribosomal protein L24  65.04 
 
 
123 aa  130  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0942  50S ribosomal protein L24  62.39 
 
 
122 aa  127  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0905403  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23690  LSU ribosomal protein L24P  55.91 
 
 
128 aa  122  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0826239  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20760  LSU ribosomal protein L24P  57.26 
 
 
119 aa  117  7.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10729  50S ribosomal protein L24  55.86 
 
 
105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.433262 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4496  ribosomal protein L24  54.95 
 
 
104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  55.86 
 
 
104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  54.95 
 
 
104 aa  113  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0317  50S ribosomal protein L24P  52.68 
 
 
114 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  52.25 
 
 
105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0263  ribosomal protein L24  54.87 
 
 
111 aa  111  3e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1134  ribosomal protein L24  53.15 
 
 
106 aa  110  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.479342  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1718  50S ribosomal protein L24  55.36 
 
 
111 aa  110  7.000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  53.15 
 
 
106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1196  50S ribosomal protein L24  51.35 
 
 
104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  48.65 
 
 
108 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  48.65 
 
 
108 aa  107  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1043  50S ribosomal protein L24  50.45 
 
 
105 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000412031  normal  0.190352 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1026  50S ribosomal protein L24  50.45 
 
 
105 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000241129  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1055  50S ribosomal protein L24  50.45 
 
 
105 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00246743  normal  0.25202 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1333  50S ribosomal protein L24  54.05 
 
 
105 aa  105  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000196536  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  50.45 
 
 
108 aa  106  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5036  50S ribosomal protein L24  51.35 
 
 
105 aa  105  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000829626  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3420  ribosomal protein L24  51.35 
 
 
101 aa  103  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  53.57 
 
 
112 aa  102  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3894  50S ribosomal protein L24  53.45 
 
 
123 aa  100  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  51.4 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  51.4 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  51.4 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  51.4 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  51.4 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  51.4 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  51.4 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  51.4 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  52.34 
 
 
103 aa  99.4  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  51.4 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  51.4 
 
 
103 aa  99.4  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  51.82 
 
 
106 aa  97.4  5e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  52.21 
 
 
104 aa  97.4  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  52.78 
 
 
106 aa  97.1  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
105 aa  94.7  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  50.45 
 
 
101 aa  95.1  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
105 aa  94.7  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  48.18 
 
 
103 aa  94.4  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
105 aa  94.4  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  51.4 
 
 
103 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  47.27 
 
 
103 aa  94.4  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  48.18 
 
 
103 aa  94.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  47.32 
 
 
105 aa  93.6  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  48.18 
 
 
106 aa  93.2  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  49.53 
 
 
103 aa  92  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  49.54 
 
 
105 aa  92.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5135  ribosomal protein L24  51.35 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.403421 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  51.35 
 
 
112 aa  92.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  52.29 
 
 
106 aa  92.8  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  49.53 
 
 
112 aa  92  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0847  50S ribosomal protein L24  55.56 
 
 
105 aa  91.7  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
105 aa  90.9  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4310  ribosomal protein L24  49.55 
 
 
100 aa  88.6  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  48.65 
 
 
105 aa  88.2  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  47.27 
 
 
103 aa  87.8  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1784  50S ribosomal protein L24P  53.57 
 
 
104 aa  87.8  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0499077  normal  0.110496 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  48.18 
 
 
102 aa  87.4  6e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  46.79 
 
 
105 aa  87  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  47.52 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1097  Ribosomal protein L24-like protein  58.57 
 
 
101 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4015  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 
110 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0135425  hitchhiker  0.0000188954 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  53.93 
 
 
104 aa  86.3  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  48.15 
 
 
104 aa  85.5  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 
106 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  48.18 
 
 
106 aa  85.5  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0778  ribosomal protein L24  46.08 
 
 
105 aa  85.1  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000331203  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0573  50S ribosomal protein L24  60 
 
 
105 aa  84.7  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  43.24 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  48.18 
 
 
110 aa  85.1  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  46.85 
 
 
105 aa  84.7  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  46.85 
 
 
105 aa  84.7  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  44.86 
 
 
110 aa  84.7  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  46.73 
 
 
102 aa  84.7  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  47.32 
 
 
107 aa  84.3  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  48.62 
 
 
105 aa  84  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  52.81 
 
 
104 aa  83.6  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  44.55 
 
 
106 aa  83.6  8e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 
104 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1556  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 
104 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  47.75 
 
 
105 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  45.45 
 
 
107 aa  83.2  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1843  50S ribosomal protein L24  45.45 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  43.64 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0348  50S ribosomal protein L24  45.45 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000772359  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  47.19 
 
 
104 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>