More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_23690 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_23690  LSU ribosomal protein L24P  100 
 
 		 128 aa  257  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0826239  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2964  50S ribosomal protein L24  61.42 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00916066  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2676  50S ribosomal protein L24  60.63 
 
 		 120 aa  133  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20760  LSU ribosomal protein L24P  59.38 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17050  50S ribosomal protein L24  55.12 
 
 		 113 aa  127  7.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000932171  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2648  ribosomal protein L24  55.91 
 
 		 113 aa  122  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0699  50S ribosomal protein L24  55.73 
 
 		 123 aa  120  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0638  ribosomal protein L24  56.35 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3132  50S ribosomal protein L24  55.12 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  42.75 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0942  50S ribosomal protein L24  47.45 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  44 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  41.98 
 
 		 108 aa  97.4  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  45.08 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  45.08 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  45.08 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  45.08 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  45.08 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  45.08 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  45.08 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  45.08 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  45.08 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0317  50S ribosomal protein L24P  41.22 
 
 		 114 aa  97.1  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  45.08 
 
 		 103 aa  97.1  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1134  ribosomal protein L24  48.44 
 
 		 106 aa  97.1  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  45.9 
 
 		 103 aa  96.7  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10729  50S ribosomal protein L24  47.66 
 
 		 105 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433262 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  42.97 
 
 		 105 aa  96.3  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  42.62 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  43.44 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  45.31 
 
 		 104 aa  94  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  46.09 
 
 		 105 aa  94  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4496  ribosomal protein L24  45.31 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  45.97 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  42.4 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  42.4 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1718  50S ribosomal protein L24  44.35 
 
 		 111 aa  90.9  5e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  45.31 
 
 		 104 aa  90.9  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  46.28 
 
 		 105 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  40.62 
 
 		 106 aa  90.5  7e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1055  50S ribosomal protein L24  43.75 
 
 		 105 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00246743  normal  0.25202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  44.19 
 
 		 106 aa  89.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0263  ribosomal protein L24  43.55 
 
 		 111 aa  89.4  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1026  50S ribosomal protein L24  43.75 
 
 		 105 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000241129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1043  50S ribosomal protein L24  43.75 
 
 		 105 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000412031  normal  0.190352 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  44 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  41.41 
 
 		 106 aa  88.6  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3420  ribosomal protein L24  44 
 
 		 101 aa  89.4  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  42.62 
 
 		 106 aa  88.6  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  45.97 
 
 		 105 aa  87.8  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1196  50S ribosomal protein L24  40.62 
 
 		 104 aa  88.2  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  41.94 
 
 		 105 aa  87.8  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  44 
 
 		 112 aa  87.4  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  42.86 
 
 		 118 aa  87.4  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  45.24 
 
 		 101 aa  87  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1333  50S ribosomal protein L24  43.75 
 
 		 105 aa  87  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000196536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5036  50S ribosomal protein L24  42.97 
 
 		 105 aa  87  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000829626  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0598  ribosomal protein L24  45.53 
 
 		 116 aa  87  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  41.94 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  44.8 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  41.86 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1274  ribosomal protein L24  38.4 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  45.45 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4310  ribosomal protein L24  44.8 
 
 		 100 aa  85.1  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  43.8 
 
 		 103 aa  84.7  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19921  50S ribosomal protein L24  46.88 
 
 		 118 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  43.55 
 
 		 104 aa  84.7  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  39.2 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  45.45 
 
 		 105 aa  84.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  42.98 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  39.2 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  43.8 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  43.3 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  39.2 
 
 		 109 aa  83.6  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  40.8 
 
 		 105 aa  83.6  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  40.8 
 
 		 105 aa  83.6  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29630  LSU ribosomal protein L24P  48.11 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.750571 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  39.84 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2677  50S ribosomal protein L24  45.6 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.790603  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  35.16 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1118  50S ribosomal protein L24  45.83 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  39.84 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  40 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  42.4 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  40.5 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  39.52 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5135  ribosomal protein L24  42.86 
 
 		 101 aa  80.9  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.403421 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1843  50S ribosomal protein L24  44.19 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0348  50S ribosomal protein L24  44.19 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000772359  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1303  50S ribosomal protein L24  38.4 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0342  50S ribosomal protein L24  47.92 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0241  50S ribosomal protein L24  39.2 
 
 		 117 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0238  50S ribosomal protein L24  39.2 
 
 		 117 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2221  50S ribosomal protein L24  42.06 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  41.13 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  39.84 
 
 		 105 aa  80.1  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  41.13 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  45.92 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17541  50S ribosomal protein L24  42.57 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  34.92 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>