More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1303 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 105 aa  206  6e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 105 aa  206  6e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  74.76 
 
 		 107 aa  161  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  69.9 
 
 		 106 aa  152  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  65.38 
 
 		 104 aa  147  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  68.93 
 
 		 106 aa  147  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  63.46 
 
 		 105 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  65.05 
 
 		 107 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  63.21 
 
 		 110 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  61.17 
 
 		 106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  58.82 
 
 		 109 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0090  50S ribosomal protein L24  65.05 
 
 		 107 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661954 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  56.73 
 
 		 109 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2246  50S ribosomal protein L24  62.5 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00124934  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  61.54 
 
 		 107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  55.34 
 
 		 106 aa  124  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  57.28 
 
 		 103 aa  124  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  60.78 
 
 		 106 aa  123  7e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  61.54 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  59.62 
 
 		 103 aa  121  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  55.34 
 
 		 108 aa  120  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  58.82 
 
 		 104 aa  121  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  55.34 
 
 		 103 aa  120  5e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  55.34 
 
 		 103 aa  120  7e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0726  ribosomal protein L24  57.14 
 
 		 105 aa  120  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_428  ribosomal protein L24  55.34 
 
 		 103 aa  120  7e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  57.84 
 
 		 104 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2054  50S ribosomal protein L24  59.22 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00180393  normal  0.0527176 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  53.64 
 
 		 110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  57.69 
 
 		 103 aa  117  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  56.31 
 
 		 106 aa  116  7.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  57.69 
 
 		 103 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  56.73 
 
 		 103 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  55.77 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  55.77 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  55.77 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  55.77 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  55.77 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  55.77 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  55.77 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  55.77 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  55.77 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  52.73 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  55.56 
 
 		 112 aa  114  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  55.56 
 
 		 107 aa  114  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  54.9 
 
 		 112 aa  114  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  60.61 
 
 		 105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4015  50S ribosomal protein L24  52.73 
 
 		 110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0135425  hitchhiker  0.0000188954 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0671  50S ribosomal protein L24  56.6 
 
 		 110 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.367854  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2763  50S ribosomal protein L24  53.85 
 
 		 109 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154774  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 105 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  55.88 
 
 		 105 aa  110  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  55.88 
 
 		 105 aa  110  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2914  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 		 116 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0719  50S ribosomal protein L24  56.44 
 
 		 108 aa  110  9e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172071  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  55.88 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  50.98 
 
 		 105 aa  109  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0469  50S ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 106 aa  107  8.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  55.88 
 
 		 105 aa  106  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  52.88 
 
 		 108 aa  105  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0334  ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000366107  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2608  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 		 109 aa  105  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000338096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2158  ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 104 aa  105  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0775088  normal  0.23262 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2313  50S ribosomal protein L24  55.34 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000126749  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 108 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0970  50S ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 105 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000143141  hitchhiker  0.000000947265 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 		 104 aa  105  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 108 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2313  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 105 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.103377  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0778  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 		 104 aa  103  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0177963  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0169  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 104 aa  104  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000484148  hitchhiker  0.000323291 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 108 aa  103  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 105 aa  103  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0338  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 106 aa  103  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.530632  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0769  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 116 aa  103  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000440948  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0195  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000100309  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0242  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 105 aa  103  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 106 aa  103  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 119 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09890  50S ribosomal protein L24  52.43 
 
 		 105 aa  103  7e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00648346  hitchhiker  0.00000717269 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0210  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216375  unclonable  0.0000000000129617 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0205  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0210  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745945  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  53.92 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3001  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 122 aa  103  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.445857  hitchhiker  0.00605598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>