More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1173 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  100 
 
 
107 aa  210  5.999999999999999e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  61.32 
 
 
110 aa  124  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  61.54 
 
 
105 aa  122  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  61.54 
 
 
105 aa  122  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  57.55 
 
 
106 aa  121  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  57.14 
 
 
105 aa  121  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  57.69 
 
 
104 aa  120  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  54.81 
 
 
106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  53.4 
 
 
108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  53.4 
 
 
107 aa  115  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  50 
 
 
109 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 
106 aa  114  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  56.31 
 
 
103 aa  114  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  54.72 
 
 
107 aa  113  6.9999999999999995e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  54.81 
 
 
109 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 
106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  55 
 
 
106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  52.88 
 
 
103 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  55.77 
 
 
106 aa  110  7.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  55.56 
 
 
107 aa  110  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 
106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 
103 aa  108  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 
103 aa  108  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 
103 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 
103 aa  108  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 
103 aa  108  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 
103 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 
103 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 
103 aa  108  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 
103 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 
103 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 
103 aa  107  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0769  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 
116 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000440948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 
103 aa  106  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09890  50S ribosomal protein L24  52.88 
 
 
105 aa  105  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00648346  hitchhiker  0.00000717269 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 
107 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 
102 aa  104  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2608  50S ribosomal protein L24  48.6 
 
 
109 aa  103  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000338096  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  53 
 
 
105 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  53 
 
 
105 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 
102 aa  102  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2896  ribosomal protein L24  46.6 
 
 
113 aa  101  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  52 
 
 
105 aa  100  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 
104 aa  100  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0719  50S ribosomal protein L24  48.51 
 
 
108 aa  100  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172071  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 
104 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  45.28 
 
 
112 aa  98.6  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 
106 aa  98.6  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 
105 aa  98.6  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 
115 aa  97.8  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2763  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 
109 aa  97.4  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154774  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2914  50S ribosomal protein L24  45.71 
 
 
116 aa  97.8  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  46 
 
 
106 aa  97.4  6e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 
103 aa  96.7  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 
103 aa  95.9  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_428  ribosomal protein L24  45.63 
 
 
103 aa  96.7  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0090  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
107 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661954 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 
108 aa  95.5  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 
110 aa  95.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  46.15 
 
 
104 aa  94.7  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 
108 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  50.51 
 
 
112 aa  94  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3151  50S ribosomal protein L24  44.12 
 
 
111 aa  93.6  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  50.51 
 
 
105 aa  93.6  8e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
105 aa  92.8  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  40 
 
 
110 aa  92.8  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3656  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 
105 aa  92.8  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000160911  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2246  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00124934  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4015  50S ribosomal protein L24  40 
 
 
110 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0135425  hitchhiker  0.0000188954 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  47.62 
 
 
112 aa  91.7  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0238  50S ribosomal protein L24  44.66 
 
 
117 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  44.76 
 
 
106 aa  91.3  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2054  50S ribosomal protein L24  45.19 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00180393  normal  0.0527176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0241  50S ribosomal protein L24  44.66 
 
 
117 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04510  50S ribosomal protein L24  45.87 
 
 
105 aa  90.9  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0040022  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0505  50S ribosomal protein L24  45.71 
 
 
110 aa  91.3  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0612161  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  48.08 
 
 
108 aa  90.9  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  44.66 
 
 
119 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4925  ribosomal protein L24  51.69 
 
 
93 aa  90.5  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0021231  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  46.15 
 
 
108 aa  90.5  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  46.15 
 
 
108 aa  90.5  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  42 
 
 
110 aa  90.1  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0671  50S ribosomal protein L24  48.11 
 
 
110 aa  90.5  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.367854  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  44.95 
 
 
118 aa  90.1  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0726  ribosomal protein L24  45.19 
 
 
105 aa  88.6  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  43 
 
 
112 aa  89  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  43.69 
 
 
108 aa  88.6  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1077  50S ribosomal protein L24  46.15 
 
 
109 aa  88.2  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00115377  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  43.81 
 
 
105 aa  88.2  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3001  50S ribosomal protein L24  42.72 
 
 
122 aa  87.8  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.445857  hitchhiker  0.00605598 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0444  50S ribosomal protein L24  44.76 
 
 
105 aa  87.4  6e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0162317  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0276  50S ribosomal protein L24  47.27 
 
 
118 aa  87  8e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000858967  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0386  50S ribosomal protein L24  44.23 
 
 
104 aa  86.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5776  ribosomal protein L24  43.81 
 
 
118 aa  86.3  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0501804  normal  0.536525 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1196  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 
104 aa  86.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  46.3 
 
 
104 aa  85.9  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3327  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 
105 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000922916  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0330  50S ribosomal protein L24  47.17 
 
 
106 aa  85.9  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.5069e-23  unclonable  0.0000000479114 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0416  50S ribosomal protein L24P  49.04 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000110454  normal  0.227235 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  40.38 
 
 
115 aa  85.5  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>