More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3013 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  100 
 
 
110 aa  220  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  83.64 
 
 
110 aa  193  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4015  50S ribosomal protein L24  82.73 
 
 
110 aa  191  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0135425  hitchhiker  0.0000188954 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  54.63 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  53.64 
 
 
105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  53.64 
 
 
105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  49.54 
 
 
103 aa  117  6e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  53.7 
 
 
106 aa  117  6e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0726  ribosomal protein L24  54.55 
 
 
105 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  48.62 
 
 
103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  53.64 
 
 
104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_428  ribosomal protein L24  48.62 
 
 
103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  52.73 
 
 
109 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  55.05 
 
 
106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  54.13 
 
 
106 aa  110  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  53.21 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  47.22 
 
 
106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  51.38 
 
 
110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  45.79 
 
 
109 aa  107  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
105 aa  106  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0671  50S ribosomal protein L24  47.22 
 
 
110 aa  104  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.367854  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  48.62 
 
 
102 aa  104  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  50.91 
 
 
103 aa  104  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0769  50S ribosomal protein L24  45.87 
 
 
116 aa  104  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000440948  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2313  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
105 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.103377  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  49.54 
 
 
106 aa  102  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  49.54 
 
 
108 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2914  50S ribosomal protein L24  45.95 
 
 
116 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  51.38 
 
 
106 aa  101  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 
106 aa  101  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
103 aa  100  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4925  ribosomal protein L24  55.67 
 
 
93 aa  100  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0021231  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  50.96 
 
 
106 aa  100  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  51.82 
 
 
108 aa  100  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  50.91 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  49.09 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  49.09 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  49.09 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  49.09 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  49.09 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  49.09 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  49.09 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  49.53 
 
 
104 aa  99.8  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  49.09 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  49.09 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  49.09 
 
 
103 aa  99.4  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  55.17 
 
 
105 aa  98.6  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 
104 aa  99.4  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  44.95 
 
 
103 aa  99  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  55.17 
 
 
105 aa  98.6  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  45.05 
 
 
107 aa  99  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0847  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
105 aa  99.4  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  48.18 
 
 
108 aa  98.2  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 
104 aa  98.6  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2391  50S ribosomal protein L24  49.54 
 
 
101 aa  98.2  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000223185  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  48.18 
 
 
108 aa  98.2  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  49.09 
 
 
103 aa  97.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 
104 aa  97.8  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1077  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
109 aa  97.1  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00115377  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  47.22 
 
 
112 aa  97.1  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  45.79 
 
 
106 aa  96.7  9e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  57.32 
 
 
102 aa  96.3  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0090  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661954 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  44.55 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2054  50S ribosomal protein L24  45.37 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00180393  normal  0.0527176 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2246  50S ribosomal protein L24  42.73 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00124934  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09890  50S ribosomal protein L24  47.71 
 
 
105 aa  95.1  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00648346  hitchhiker  0.00000717269 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2313  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
105 aa  94.4  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000126749  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  55.06 
 
 
101 aa  94.4  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2763  50S ribosomal protein L24  43.69 
 
 
109 aa  93.6  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154774  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0702  50S ribosomal protein L24  47.71 
 
 
117 aa  93.6  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000192817  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2570  50S ribosomal protein L24  47.27 
 
 
115 aa  93.2  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.949988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 
112 aa  93.2  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0878  50S ribosomal protein L24  49.07 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0510214  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0317  50S ribosomal protein L24P  46.73 
 
 
114 aa  92.8  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1357  50S ribosomal protein L24  47.22 
 
 
108 aa  93.2  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00374615  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  51.72 
 
 
105 aa  92.8  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  53.26 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  44.23 
 
 
107 aa  92  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2896  ribosomal protein L24  44.55 
 
 
113 aa  92  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2608  50S ribosomal protein L24  45.05 
 
 
109 aa  91.7  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000338096  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  45.87 
 
 
119 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3811  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 
104 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000390603  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  47.71 
 
 
101 aa  91.3  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0169  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 
104 aa  91.3  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000484148  hitchhiker  0.000323291 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  46.3 
 
 
104 aa  90.9  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  42.31 
 
 
106 aa  90.9  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0294  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 
104 aa  90.9  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000911949  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0594  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 
104 aa  90.9  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000014526  normal  0.407014 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4533  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 
104 aa  90.9  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114986  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3903  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 
104 aa  90.9  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000356583  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0469  50S ribosomal protein L24  43.52 
 
 
106 aa  90.9  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0238  50S ribosomal protein L24  45.87 
 
 
117 aa  90.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0241  50S ribosomal protein L24  45.87 
 
 
117 aa  90.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0606  50S ribosomal protein L24P  53.57 
 
 
89 aa  90.5  6e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000125199  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  47.71 
 
 
101 aa  90.9  6e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000004985  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0334  ribosomal protein L24  46.3 
 
 
107 aa  90.5  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000366107  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3990  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 
104 aa  90.5  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0024494  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0195  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 
104 aa  90.1  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000100309  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0334  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 
104 aa  90.1  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000849803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>