More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1718 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1718  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 111 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0263  ribosomal protein L24  90.09 
 
 		 111 aa  192  1e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0638  ribosomal protein L24  57.14 
 
 		 113 aa  113  7.999999999999999e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2648  ribosomal protein L24  55.36 
 
 		 113 aa  110  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17050  50S ribosomal protein L24  56.25 
 
 		 113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000932171  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  57.01 
 
 		 102 aa  107  5e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0699  50S ribosomal protein L24  50.41 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  51.85 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2676  50S ribosomal protein L24  50.83 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  53.27 
 
 		 103 aa  100  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  52.34 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  52.34 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  52.34 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  52.34 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  52.34 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  52.34 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  52.34 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  52.34 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  52.34 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  54.21 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  54.21 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  52.34 
 
 		 103 aa  97.8  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  50.91 
 
 		 106 aa  97.1  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  52.34 
 
 		 105 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  50.93 
 
 		 105 aa  95.1  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  47.66 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3132  50S ribosomal protein L24  57.89 
 
 		 115 aa  94.4  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  48.15 
 
 		 106 aa  94.4  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  52.34 
 
 		 104 aa  94  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2964  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 119 aa  94  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00916066  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  49.53 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  51.85 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  49.07 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23690  LSU ribosomal protein L24P  44.35 
 
 		 128 aa  90.9  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0826239  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  48.6 
 
 		 103 aa  91.3  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  49.55 
 
 		 105 aa  90.1  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  52.27 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  45.95 
 
 		 112 aa  89.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  47.66 
 
 		 106 aa  87.8  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  49.52 
 
 		 103 aa  87.8  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  49.52 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0306  ribosomal protein L24  46.3 
 
 		 104 aa  87.4  6e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0004461  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0970  50S ribosomal protein L24  46.3 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000143141  hitchhiker  0.000000947265 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  47.22 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 		 103 aa  87  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  46.85 
 
 		 105 aa  86.7  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  47.22 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  47.75 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20760  LSU ribosomal protein L24P  46.96 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  48.15 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  43.12 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  47.22 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  45.79 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  43.52 
 
 		 107 aa  83.6  9e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  48.65 
 
 		 104 aa  83.6  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  44.44 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  47.71 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  47.37 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10729  50S ribosomal protein L24  48.65 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433262 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0726  ribosomal protein L24  54.88 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1134  ribosomal protein L24  48.25 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  41.07 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  40.54 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0598  ribosomal protein L24  49.54 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  50.94 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0432  50S ribosomal protein L24  42.59 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0323669  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  45.22 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0317  50S ribosomal protein L24P  45.54 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  44.86 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3327  50S ribosomal protein L24  45.28 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000922916  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1784  50S ribosomal protein L24P  52.29 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0499077  normal  0.110496 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  40.19 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  45.95 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  45.95 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1351  ribosomal protein L24  45.13 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  44.23 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0848  50S ribosomal protein L24  46.23 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08960  50S ribosomal protein L24  46.23 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0786471  normal  0.0497722 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  45.79 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  44.57 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3656  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 		 105 aa  80.1  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000160911  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  42.34 
 
 		 105 aa  80.1  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_428  ribosomal protein L24  44.57 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  44.57 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  45.95 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  49.09 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1196  50S ribosomal protein L24  43.24 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1843  50S ribosomal protein L24  42.86 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0386  50S ribosomal protein L24  45.37 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  45.95 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4496  ribosomal protein L24  47.75 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  45.05 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1851  50S ribosomal protein L24  48.11 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369616  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0348  50S ribosomal protein L24  42.86 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000772359  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29630  LSU ribosomal protein L24P  52.04 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.750571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>