More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1097 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1097  Ribosomal protein L24-like protein  100 
 
 		 101 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0573  50S ribosomal protein L24  80.77 
 
 		 105 aa  153  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  64.29 
 
 		 108 aa  103  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  64.29 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1134  ribosomal protein L24  64.29 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  62.65 
 
 		 104 aa  98.6  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0942  50S ribosomal protein L24  60.98 
 
 		 122 aa  97.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0317  50S ribosomal protein L24P  58.62 
 
 		 114 aa  97.8  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  61.45 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3894  50S ribosomal protein L24  63.89 
 
 		 123 aa  94  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4496  ribosomal protein L24  55.95 
 
 		 104 aa  93.6  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  54.17 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5036  50S ribosomal protein L24  52.58 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000829626  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1333  50S ribosomal protein L24  56.63 
 
 		 105 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000196536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  51.72 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10729  50S ribosomal protein L24  58.33 
 
 		 105 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433262 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1196  50S ribosomal protein L24  55.42 
 
 		 104 aa  89.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  60 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1055  50S ribosomal protein L24  54.22 
 
 		 105 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00246743  normal  0.25202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1026  50S ribosomal protein L24  54.22 
 
 		 105 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000241129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1043  50S ribosomal protein L24  54.22 
 
 		 105 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000412031  normal  0.190352 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  58.67 
 
 		 103 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  58.67 
 
 		 103 aa  86.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  58.67 
 
 		 103 aa  86.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  58.67 
 
 		 103 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  58.67 
 
 		 103 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  58.67 
 
 		 103 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  58.67 
 
 		 103 aa  86.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  58.67 
 
 		 103 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  58.67 
 
 		 103 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  58.67 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2648  ribosomal protein L24  58.57 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4310  ribosomal protein L24  61.45 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  48.24 
 
 		 118 aa  85.5  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  57.33 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  62.34 
 
 		 101 aa  84.3  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  58.67 
 
 		 105 aa  83.6  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  58.67 
 
 		 106 aa  83.6  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  56 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  58.67 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  58.67 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  53.95 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  53.95 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  56 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  47.13 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  52 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17050  50S ribosomal protein L24  55.71 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000932171  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_428  ribosomal protein L24  49.47 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5135  ribosomal protein L24  54.55 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.403421 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  57.89 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  49.47 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  52.78 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29630  LSU ribosomal protein L24P  48.28 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.750571 
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  49.47 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  53.42 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  50.67 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0598  ribosomal protein L24  47.13 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0365  50S ribosomal protein L24  50.59 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.889516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4015  50S ribosomal protein L24  52.05 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0135425  hitchhiker  0.0000188954 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0638  ribosomal protein L24  54.93 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  57.53 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2391  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000223185  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  56 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  53.42 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  51.35 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3420  ribosomal protein L24  48.19 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  49.35 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  54.67 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1966  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2964  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00916066  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2676  50S ribosomal protein L24  48.68 
 
 		 120 aa  73.6  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0238  50S ribosomal protein L24  47.13 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0241  50S ribosomal protein L24  47.13 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0702  50S ribosomal protein L24  56.16 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000192817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  52.05 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2285  50S ribosomal protein L24  52 
 
 		 80 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000123735  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3001  50S ribosomal protein L24  44.09 
 
 		 122 aa  72  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.445857  hitchhiker  0.00605598 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2053  50S ribosomal protein L24  52 
 
 		 80 aa  72.8  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000596769  normal  0.391774 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  49.38 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1303  50S ribosomal protein L24  53.42 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  50 
 
 		 106 aa  72  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19921  50S ribosomal protein L24  45.88 
 
 		 118 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  49.32 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0192  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 		 80 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0726  ribosomal protein L24  54.17 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2218  50S ribosomal protein L24  50.67 
 
 		 80 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000567909  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20760  LSU ribosomal protein L24P  48.15 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2221  50S ribosomal protein L24  43.48 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  47.22 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  47.22 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  48.57 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 		 101 aa  70.1  0.000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000004985  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1077  50S ribosomal protein L24  49.32 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00115377  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  43.02 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  43.84 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0606  50S ribosomal protein L24P  45.74 
 
 		 89 aa  69.7  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000125199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>