More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_20160 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_20160  transposase  100 
 
 		 290 aa  600  1.0000000000000001e-171  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.204187  normal  0.0283567 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23540  transposase  99.31 
 
 		 290 aa  596  1e-169  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18720  transposase  97.24 
 
 		 290 aa  570  1.0000000000000001e-162  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4506  Integrase catalytic region  67.84 
 
 		 288 aa  377  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.126933 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3195  integrase catalytic subunit  63.31 
 
 		 285 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0240069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5959  integrase catalytic subunit  64.03 
 
 		 285 aa  374  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1094  integrase catalytic subunit  63.67 
 
 		 285 aa  367  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2595  Integrase catalytic region  62.94 
 
 		 295 aa  365  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03410  transposase  63.44 
 
 		 288 aa  363  3e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3178  integrase catalytic subunit  63.16 
 
 		 273 aa  361  8e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3240  integrase catalytic subunit  63.16 
 
 		 273 aa  361  8e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3190  integrase catalytic subunit  63.16 
 
 		 273 aa  361  8e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5589  integrase catalytic subunit  62.69 
 
 		 275 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5990  integrase catalytic subunit  62.69 
 
 		 275 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684507 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3211  integrase catalytic subunit  64.66 
 
 		 288 aa  359  3e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1932  integrase catalytic subunit  63.35 
 
 		 287 aa  352  5e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00436726  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3351  integrase catalytic subunit  63.35 
 
 		 287 aa  352  5e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2396  Integrase catalytic region  65.2 
 
 		 273 aa  331  7.000000000000001e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2849  Integrase catalytic region  65.2 
 
 		 273 aa  331  7.000000000000001e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2272  Integrase catalytic region  64.84 
 
 		 273 aa  329  3e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3645  Integrase catalytic region  64.26 
 
 		 286 aa  322  5e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0300  Integrase catalytic region  58 
 
 		 299 aa  305  4.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1438  Integrase catalytic region  58 
 
 		 299 aa  305  4.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1004  Integrase catalytic region  58 
 
 		 299 aa  305  4.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.217613  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0254  Integrase catalytic region  58 
 
 		 299 aa  305  4.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.59969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3955  Integrase catalytic region  58 
 
 		 299 aa  305  4.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2706  Integrase catalytic region  58 
 
 		 299 aa  305  4.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1429  Integrase catalytic region  58 
 
 		 299 aa  305  4.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0384  Integrase catalytic region  58 
 
 		 299 aa  305  4.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0277  Integrase catalytic region  58 
 
 		 299 aa  305  4.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3958  Integrase catalytic region  58 
 
 		 299 aa  305  4.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1485  Integrase catalytic region  58 
 
 		 299 aa  305  4.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0378  Integrase catalytic region  58 
 
 		 299 aa  305  4.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3497  Integrase catalytic region  52.96 
 
 		 293 aa  299  3e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000045245  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2066  Integrase catalytic region  52.96 
 
 		 293 aa  299  3e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000236626  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0131  Integrase catalytic region  52.96 
 
 		 293 aa  299  3e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0628  Integrase catalytic region  52.96 
 
 		 293 aa  299  3e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1242  Integrase catalytic region  52.96 
 
 		 293 aa  299  3e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0782123  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2873  Integrase catalytic region  52.96 
 
 		 293 aa  299  3e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000164052  normal  0.0134902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4462  Integrase catalytic region  52.96 
 
 		 293 aa  299  3e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06570  transposase  52.26 
 
 		 293 aa  295  6e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.246585  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10270  transposase  63.51 
 
 		 221 aa  278  9e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0801  Integrase catalytic region  45.89 
 
 		 291 aa  231  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1510  integrase catalytic subunit  44.61 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1533  integrase catalytic subunit  44.61 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2153  integrase catalytic subunit  44.61 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525672 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0615  transposase subunit  54.73 
 
 		 154 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1727  integrase  38.83 
 
 		 281 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0647864 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  36.57 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  36.57 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  35.82 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  35.82 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  35.82 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  35.82 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  35.82 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0603  integrase, catalytic region  64.29 
 
 		 131 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0604  transposase subunit  66.67 
 
 		 127 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  37.78 
 
 		 280 aa  162  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  37.78 
 
 		 280 aa  162  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  36.68 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  36.68 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  36.68 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  36.68 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  36.68 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  36.07 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1260  ISEhe3, transposase orfB  35.58 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0300091  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  36.86 
 
 		 286 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3970  ISEhe3, transposase orfB  35.58 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000757878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0435  ISEhe3, transposase orfB  35.58 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  35.58 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  35.58 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  35.58 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2788  ISEhe3, transposase orfB  35.58 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00739758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  35.58 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0326  ISEhe3, transposase orfB  35.58 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.148326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4529  ISEhe3, transposase orfB  35.58 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.313406  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  36.86 
 
 		 286 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  35.58 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  36.86 
 
 		 286 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0141  ISEhe3, transposase orfB  35.58 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000861887  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  36.86 
 
 		 286 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  36.86 
 
 		 286 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  36.53 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  36.53 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  36.53 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0741  integrase catalytic subunit  35.21 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  36.53 
 
 		 286 aa  156  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  36.16 
 
 		 286 aa  155  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  36.16 
 
 		 286 aa  155  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  36.16 
 
 		 286 aa  155  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  36.16 
 
 		 286 aa  155  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  36.16 
 
 		 286 aa  155  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  36.16 
 
 		 286 aa  155  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  36.16 
 
 		 286 aa  155  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  36.16 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  34.31 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3025  IS3, transposase orfB  33.45 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  33.9 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  33.9 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  33.9 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>