55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_18970 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_18970  predicted membrane protein  100 
 
 
236 aa  469  1.0000000000000001e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129095  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18830  predicted membrane protein  97.35 
 
 
226 aa  407  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  40.51 
 
 
174 aa  108  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  37.59 
 
 
379 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39020  predicted membrane protein  36.41 
 
 
238 aa  102  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0449  DoxX family protein  40.71 
 
 
182 aa  99.4  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2554  DoxX family protein  36.99 
 
 
321 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225464  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2562  DoxX family protein  36.99 
 
 
321 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2517  DoxX  36.99 
 
 
321 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2652  DoxX family protein  38.61 
 
 
182 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000120854  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2385  DoxX family protein  37.63 
 
 
182 aa  90.9  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239673 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3403  DoxX family protein  34.48 
 
 
276 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351564  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3130  DoxX family protein  34.01 
 
 
315 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.470972  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0296  DoxX family protein  37.14 
 
 
271 aa  87.8  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1264  DoxX family protein  33.04 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal  0.163775 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  38.46 
 
 
119 aa  81.3  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1208  DoxX family protein  33.75 
 
 
182 aa  79  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5054  DoxX family protein  40.14 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1811  hypothetical protein  32.05 
 
 
161 aa  74.3  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4544  DoxX family protein  37.97 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1210  DoxX family protein  34.12 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2493  DoxX family protein  34.93 
 
 
158 aa  63.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3994  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09480  hypothetical protein  35.92 
 
 
192 aa  63.5  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2877  DoxX family protein  32.23 
 
 
136 aa  56.6  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  32.06 
 
 
155 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0868  DoxX family protein  32.14 
 
 
130 aa  52.8  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.879404  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  32.69 
 
 
137 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  32.39 
 
 
149 aa  52.8  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  32.69 
 
 
137 aa  52.4  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  31.3 
 
 
137 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0372  DoxX family protein  38.2 
 
 
133 aa  50.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  29.1 
 
 
137 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19460  hypothetical protein  26.45 
 
 
188 aa  50.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3707  DoxX family protein  31.34 
 
 
149 aa  49.7  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  28.47 
 
 
136 aa  48.5  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  29.01 
 
 
137 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  34.02 
 
 
137 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  37.14 
 
 
136 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0545  hypothetical protein  28.46 
 
 
175 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  37.88 
 
 
137 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3712  DoxX family protein  38.6 
 
 
190 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.803576  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2764  DoxX family protein  34.33 
 
 
136 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  35.48 
 
 
174 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  28.24 
 
 
137 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2498  DoxX  35.38 
 
 
149 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  25.76 
 
 
137 aa  43.5  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  25.19 
 
 
137 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  25.55 
 
 
142 aa  43.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2221  DoxX family protein  36.07 
 
 
135 aa  42.7  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4440  DoxX family protein  33.87 
 
 
139 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2341  DoxX  32.47 
 
 
152 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  0.120907 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1107  DoxX family protein  38.03 
 
 
168 aa  42.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.298421  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1365  DoxX family protein  28.1 
 
 
139 aa  42.4  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0662293  normal  0.0953632 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3976  DoxX family protein  33.87 
 
 
174 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603426  decreased coverage  0.00896237 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  30 
 
 
182 aa  42  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>