More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4570 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 340 aa  668    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  73.11 
 
 		 308 aa  414  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  74.56 
 
 		 356 aa  399  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  62.17 
 
 		 304 aa  376  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4311  cation diffusion facilitator family transporter  70.27 
 
 		 307 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4444  cation diffusion facilitator family transporter  64.55 
 
 		 305 aa  365  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2626  cation diffusion facilitator family transporter  58.22 
 
 		 313 aa  347  2e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208162  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3334  cation diffusion facilitator family transporter  63.82 
 
 		 305 aa  346  3e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36700  cation diffusion facilitator family transporter  66.88 
 
 		 313 aa  335  5e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.761376 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19860  cation diffusion facilitator family transporter  53.33 
 
 		 308 aa  280  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.163356  decreased coverage  0.00158825 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  48.87 
 
 		 308 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0166  Co/Zn/Cd efflux system component protein  49.47 
 
 		 312 aa  271  9e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.157738  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0425  cation diffusion facilitator family transporter  50.81 
 
 		 308 aa  263  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  54.13 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1344  cation diffusion facilitator family transporter  52.92 
 
 		 307 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.123489  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0669  cation diffusion facilitator family transporter  50.71 
 
 		 343 aa  253  3e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1221  cation diffusion facilitator family transporter  48.29 
 
 		 306 aa  251  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  46.91 
 
 		 306 aa  249  6e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  50 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  48.81 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2900  cation diffusion facilitator family transporter  50.83 
 
 		 303 aa  228  9e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.726586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  43.15 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  44.83 
 
 		 312 aa  226  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  38.61 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  41.58 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  38.49 
 
 		 299 aa  223  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 		 301 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  39.86 
 
 		 301 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 		 301 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 		 301 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  39.14 
 
 		 299 aa  222  7e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  38.28 
 
 		 299 aa  219  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  43.49 
 
 		 299 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  40.2 
 
 		 326 aa  215  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  40.14 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  42.12 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  42.12 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.09 
 
 		 304 aa  211  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  38.28 
 
 		 299 aa  209  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  38.06 
 
 		 315 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  39.53 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  39.53 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  41.81 
 
 		 314 aa  206  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.51 
 
 		 299 aa  205  7e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  38.41 
 
 		 342 aa  205  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  41.94 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.51 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  40.62 
 
 		 299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  39.67 
 
 		 302 aa  200  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  39.03 
 
 		 295 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  39.66 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 316 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  40 
 
 		 316 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  39.76 
 
 		 305 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  39.8 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  41.23 
 
 		 304 aa  195  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  35.52 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  41.28 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  44.67 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4510  cation diffusion facilitator family transporter  45.68 
 
 		 247 aa  189  8e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  39.02 
 
 		 303 aa  188  9e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  36.07 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  40.07 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  42.28 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  38.65 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  39.58 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  33.55 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  39.58 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  39.58 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  37.63 
 
 		 305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  37.63 
 
 		 305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  40.36 
 
 		 378 aa  182  7e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  38.38 
 
 		 327 aa  182  9.000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2216  cation diffusion facilitator family transporter  39.94 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  36.69 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  38.63 
 
 		 327 aa  179  7e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  29.83 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  34.71 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  36.49 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  34.08 
 
 		 312 aa  176  6e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  38.13 
 
 		 312 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  37.37 
 
 		 297 aa  176  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  38.13 
 
 		 312 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  43.46 
 
 		 316 aa  175  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  38.13 
 
 		 312 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  38.13 
 
 		 312 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1735  cation diffusion facilitator family transporter  38.24 
 
 		 342 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.912037  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  37.79 
 
 		 312 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  33.79 
 
 		 317 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  30.58 
 
 		 300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  36.77 
 
 		 321 aa  173  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  39.79 
 
 		 313 aa  172  5.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2104  cation diffusion facilitator family transporter  38.53 
 
 		 342 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.20697  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  35.02 
 
 		 347 aa  172  9e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  38.63 
 
 		 307 aa  172  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  34.14 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  31.95 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  34.14 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3473  cation diffusion facilitator family transporter  40.48 
 
 		 319 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  37.29 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>