More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3725 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3725  luciferase family protein  100 
 
 		 316 aa  610  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.290268  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2778  Luciferase-like monooxygenase  57.58 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00690  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  56.91 
 
 		 331 aa  288  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.889784  normal  0.0731127 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3359  Luciferase-like, subgroup  56.27 
 
 		 318 aa  257  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0118033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2621  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  41.75 
 
 		 278 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4112  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  37.37 
 
 		 344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2862  Luciferase-like monooxygenase  47.67 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.628513 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2003  Luciferase-like, subgroup  48.63 
 
 		 288 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749975 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3798  Luciferase-like monooxygenase  41.14 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.535605  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5617  luciferase-like protein  41.06 
 
 		 323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.54 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.77 
 
 		 328 aa  102  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4412  luciferase-like  31.21 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  34.56 
 
 		 318 aa  99.8  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.9 
 
 		 345 aa  91.3  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.33 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.5 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.56 
 
 		 333 aa  85.9  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.72 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.03 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  30.65 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  28.44 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4431  coenzyme F420-dependent N(5),N(10)-methenyltetrahydromethanopterin  29.12 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4047  luciferase family protein  29.22 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  0.465581 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.61 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  30.28 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0327  methylenetetrahydromethanopterin reductase  22.44 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.585505 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2257  methylenetetrahydromethanopterin reductase  22.74 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0217  luciferase-like protein  31.61 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  27.39 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0783  luciferase family protein  27.19 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0447629  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  28.32 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5643  hypothetical protein  29.41 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.72 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  21.45 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  28.35 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0528  methylenetetrahydromethanopterin reductase  21.98 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1533  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.49 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0482478  normal  0.0346737 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0157  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.52 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0724  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.16 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.2 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  28.32 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  29.01 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  27.56 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  22.19 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  22.52 
 
 		 368 aa  65.9  0.0000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0076  methylenetetrahydromethanopterin reductase  22.53 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0321839 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1132  Luciferase-like monooxygenase  29.89 
 
 		 332 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0557  methylenetetrahydromethanopterin reductase  22.87 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0316712  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1861  Luciferase-like monooxygenase  27.17 
 
 		 335 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0213  putative F420-dependent oxidoreductase  29.94 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0757  luciferase family protein  33.14 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  0.787392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.89 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1071  hypothetical protein  29.73 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2439  Luciferase-like monooxygenase  29.63 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000186799  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.09 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0497  hypothetical protein  27.88 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  27.94 
 
 		 360 aa  62.4  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0508  hypothetical protein  27.88 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0486  hypothetical protein  27.88 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.24 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.24 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  30.59 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4944  luciferase family protein  31.07 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5223  luciferase family protein  31.07 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.018076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4855  luciferase-like protein  31.07 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  26.32 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  26.44 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.21 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3644  hypothetical protein  29.67 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  31.74 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1544  luciferase family protein  28.95 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0708084  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4328  luciferase family protein  27.23 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.01 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  27.22 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  27.22 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2018  luciferase family protein  28.32 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784882 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.22 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  26.85 
 
 		 335 aa  58.9  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  33.11 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  29.1 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.1 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4778  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.01 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1774  luciferase-like protein  28.32 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.64 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  26.07 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  37.62 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  25.99 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  25.99 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1793  luciferase-like protein  28.32 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1840  luciferase family protein  28.32 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.175999  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  39.29 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  23.75 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  27.12 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1341  luciferase family protein  31.46 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.973005 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  22.51 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  38.82 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4525  luciferase-like protein  30 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>