More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3653 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
221 aa  419  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2300  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.56 
 
 
218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0697  metal ion ABC transporter permease  53.14 
 
 
228 aa  206  3e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.45 
 
 
220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0251  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.59 
 
 
220 aa  194  8.000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.63 
 
 
230 aa  188  5e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.898355 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04700  ABC-type metal ion transport system, permease component  53.2 
 
 
219 aa  184  8e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.69 
 
 
221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4961  ABC transporter, permease protein  50.72 
 
 
221 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0342  ABC transporter, permease protein  51.21 
 
 
221 aa  177  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0298  ABC transporter permease  51.21 
 
 
221 aa  177  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0285  ABC transporter, permease  51.21 
 
 
221 aa  177  9e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0386  ABC transporter, permease protein  51.21 
 
 
221 aa  177  9e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0313  ABC transporter permease  51.21 
 
 
221 aa  177  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0344  ABC transporter, permease protein  51.21 
 
 
221 aa  177  9e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.21 
 
 
221 aa  176  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0282  ABC transporter, permease  50.72 
 
 
221 aa  175  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.65 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23480  ABC-type metal ion transport system, permease component  57.62 
 
 
220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000057821  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0359  ABC transporter, permease protein  50.25 
 
 
200 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
222 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.82 
 
 
224 aa  141  9e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  38.89 
 
 
226 aa  141  9.999999999999999e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.92 
 
 
225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.68 
 
 
222 aa  132  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
222 aa  129  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.01 
 
 
236 aa  129  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.79 
 
 
224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  39.35 
 
 
224 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.39 
 
 
222 aa  124  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.918282  hitchhiker  0.000827956 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
216 aa  124  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.530157  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
215 aa  124  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0098  ABC transporter, permease protein  43.84 
 
 
219 aa  122  4e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.712322  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  42.92 
 
 
218 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  42.92 
 
 
218 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  42.92 
 
 
218 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  42.92 
 
 
218 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  42.92 
 
 
218 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  42.92 
 
 
218 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  40.58 
 
 
224 aa  121  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.58 
 
 
224 aa  121  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0175  ABC transporter permease  37.56 
 
 
222 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.713408  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0173  ABC transporter permease  37.56 
 
 
222 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  41.04 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.38 
 
 
219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  40.28 
 
 
225 aa  119  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.01 
 
 
219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000249965  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.01 
 
 
219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000207474  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.45 
 
 
221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.51 
 
 
218 aa  118  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393989  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0194  ABC transporter, permease protein  37.67 
 
 
222 aa  118  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0165  ABC transporter, permease  37.67 
 
 
222 aa  118  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.03 
 
 
218 aa  118  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.206806 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.03 
 
 
218 aa  118  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116542  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1055  ABC-type metal ion transport system, permease component  35.58 
 
 
228 aa  117  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0162881  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0195  ABC transporter, permease protein  37.56 
 
 
222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00533098  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.83 
 
 
217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.58 
 
 
223 aa  115  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.58 
 
 
213 aa  115  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  40 
 
 
218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  40 
 
 
218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0217  ABC transporter, permease protein  37.56 
 
 
222 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.81 
 
 
235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
217 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  38.81 
 
 
225 aa  114  7.999999999999999e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0159  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.6 
 
 
222 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.79 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.44 
 
 
220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  40.09 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  39.32 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.58 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.67 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0197  ABC transporter, permease protein  37.67 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.36 
 
 
219 aa  112  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.09 
 
 
218 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141892  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5128  ABC transporter, permease protein  36.61 
 
 
222 aa  112  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.28 
 
 
228 aa  112  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  38.68 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.28 
 
 
220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  37.93 
 
 
225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  38.68 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.91 
 
 
223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.42 
 
 
229 aa  112  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.799852  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.39 
 
 
221 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0216  D-methionine ABC transporter, permease protein  41.12 
 
 
217 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0413  D-methionine ABC transporter, permease protein  41.12 
 
 
217 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2557  D-methionine ABC transporter, permease protein  41.12 
 
 
217 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0933  D-methionine ABC transporter, permease protein  41.12 
 
 
217 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2930  D-methionine ABC transporter, permease protein  40.65 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1651  D-methionine ABC transporter, permease protein  40.65 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.25 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.09 
 
 
221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.25 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2869  D-methionine ABC transporter, permease protein  40.65 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.676084 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  39.25 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.09 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.38 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.622159 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.09 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>