88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1174 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1174  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 257 aa  488  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834262  normal  0.168848 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3798  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.83 
 
 		 263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00159012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2832  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.56 
 
 		 260 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313269  decreased coverage  0.00271528 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0330  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.17 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0263555  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2507  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.66 
 
 		 260 aa  153  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366976  normal  0.0314465 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0808  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.31 
 
 		 257 aa  149  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.555445  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2356  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.15 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400478  normal  0.0671284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0929  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.13 
 
 		 259 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.23 
 
 		 255 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0962  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.23 
 
 		 255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.23 
 
 		 255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4386  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.31 
 
 		 269 aa  142  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0040  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.15 
 
 		 329 aa  115  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3480  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.93 
 
 		 276 aa  91.3  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.69 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.93 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  32.21 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.52 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.51 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.52 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11000  metal-dependent hydrolase  33.16 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.13 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.45 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.27 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.94 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2394  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.28 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.48 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.08 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.08 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.33 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.71 
 
 		 808 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.44 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.3 
 
 		 312 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.95 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.68 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.79 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2766  hypothetical protein  31.42 
 
 		 281 aa  53.5  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.35 
 
 		 266 aa  52.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.94 
 
 		 263 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.94 
 
 		 263 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.5 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.41 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.2 
 
 		 264 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.08 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.62 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.27 
 
 		 246 aa  50.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.05 
 
 		 283 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.05 
 
 		 265 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3930  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.17 
 
 		 247 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1299  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.77 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  28.63 
 
 		 273 aa  49.3  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.81 
 
 		 242 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2228  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.08 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1350.1  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.52 
 
 		 324 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0665906  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2196  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.52 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1114  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.52 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.52 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187821  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0055  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.52 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322839  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.41 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.87 
 
 		 328 aa  47  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2361  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.52 
 
 		 286 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602573  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.4 
 
 		 837 aa  47  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2555  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.41 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.337597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.47 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.64 
 
 		 235 aa  46.2  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.34 
 
 		 245 aa  45.8  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4122  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.46 
 
 		 287 aa  45.8  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.06 
 
 		 328 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1208  hypothetical protein  31.11 
 
 		 289 aa  45.8  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1455  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.62 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271612  normal  0.540274 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.27 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.53 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1842  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.96 
 
 		 286 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.69 
 
 		 282 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.53 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5302  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.1 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.974618 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.89 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1072  hypothetical protein  27.02 
 
 		 270 aa  43.5  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.05 
 
 		 338 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  34.05 
 
 		 338 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.53 
 
 		 278 aa  42.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.05 
 
 		 242 aa  42.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4612  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 		 268 aa  42.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0765415  normal  0.0123856 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3567  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.04 
 
 		 286 aa  42  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.202667  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5119  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.71 
 
 		 284 aa  42  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533258  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>