231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1388 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1388  AFG1-family ATPase  100 
 
 		 352 aa  697    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.629214  normal  0.139105 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16620  predicted ATPase  63.64 
 
 		 372 aa  414  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.24763 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1883  AFG1-family ATPase  62.39 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.927457  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1740  AFG1-family ATPase  62.92 
 
 		 363 aa  378  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.137438 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1660  AFG1-family ATPase  52.16 
 
 		 345 aa  347  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000156302 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1667  AFG1 family ATPase  53.91 
 
 		 345 aa  347  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.368599  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3078  AFG1-family ATPase  51.7 
 
 		 356 aa  338  7e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal  0.0545755 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1968  AFG1-family ATPase  57.32 
 
 		 354 aa  333  2e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.486857  decreased coverage  0.0000116257 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1581  AFG1-family ATPase  53.59 
 
 		 335 aa  333  3e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10730  predicted ATPase  53.85 
 
 		 351 aa  330  2e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0117112  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3542  AFG1-family ATPase  54.35 
 
 		 333 aa  329  4e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000203163  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1899  AFG1-family ATPase  51.93 
 
 		 343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23980  predicted ATPase  51 
 
 		 349 aa  325  1e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669926  normal  0.124447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7388  AFG1-family ATPase  51.12 
 
 		 363 aa  320  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13800  predicted ATPase  51.63 
 
 		 353 aa  318  1e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.908748  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2272  AFG1-family ATPase  48.81 
 
 		 337 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3912  AFG1 family ATPase  48.96 
 
 		 349 aa  298  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0771393  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12685  hypothetical protein  49.41 
 
 		 369 aa  297  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000506976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2491  AFG1 family ATPase  48.4 
 
 		 345 aa  293  4e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2220  AFG1-like ATPase  49.25 
 
 		 349 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2266  AFG1 family ATPase  49.25 
 
 		 349 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2209  AFG1 family ATPase  49.25 
 
 		 349 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0757112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1346  AFG1-like ATPase  46.81 
 
 		 390 aa  289  6e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0149  AFG1-family ATPase  39.51 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.842308  normal  0.156894 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2019  AFG1-like protein ATPase  41.14 
 
 		 350 aa  224  1e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.842851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0407  ATPase  26.46 
 
 		 392 aa  86.3  8e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1767  AFG1 family ATPase  26.95 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  27.52 
 
 		 364 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  28.8 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  28.8 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  28.8 
 
 		 364 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  26.04 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1096  AFG1 family ATPase  28.43 
 
 		 361 aa  77.4  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.352008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  26.71 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  24.79 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  25.96 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  26.49 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  26.38 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  25 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  25.88 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2586  hypothetical protein  25.38 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1208  AFG1-like ATPase  27.54 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0843  AFG1 family ATPase  25.6 
 
 		 367 aa  73.2  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  26.88 
 
 		 364 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  26.14 
 
 		 367 aa  72.8  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  26.52 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  25.97 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1792  AFG1 family ATPase  27.74 
 
 		 361 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  25.33 
 
 		 364 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  26.22 
 
 		 364 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  25.91 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88075  predicted protein  29.23 
 
 		 462 aa  70.9  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.176065  normal  0.458743 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2878  AFG1 family ATPase  23.55 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.067299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  24.48 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  26.25 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  25.88 
 
 		 365 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  30.98 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  27.82 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  25.83 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  27.3 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  30.98 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  26.67 
 
 		 397 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3675  AFG1-like ATPase  26.36 
 
 		 377 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  26.69 
 
 		 365 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2359  AFG1-family ATPase  28.2 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  29.51 
 
 		 367 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  23.51 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  25.44 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  26.9 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  25.29 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  25 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  25.92 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  25.92 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3976  AFG1 family ATPase  32.11 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.605596  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  25.92 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  25.9 
 
 		 367 aa  67  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  24.18 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0298  AFG1-family ATPase  27.45 
 
 		 383 aa  67  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000565805  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  25.95 
 
 		 374 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4350  AFG1 family ATPase  27.62 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000166753  hitchhiker  0.003638 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2713  hypothetical protein  24.24 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2044  AFG1-like ATPase  23.85 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136156  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  29.14 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  25.5 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3640  AFG1-family ATPase  26.33 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0569436  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  25.95 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  25.42 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  26.76 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1393  AFG1 family ATPase  25.5 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34230  hypothetical protein  27.16 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0422054  decreased coverage  0.00436044 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  26.58 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1541  AFG1 family ATPase  31.21 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.314892  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  27.25 
 
 		 364 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  25.91 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58880  putative ATPase  28.28 
 
 		 363 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0491345 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  25.91 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  24.34 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  25.91 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  25.91 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  25.91 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>