226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3542 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3542  AFG1-family ATPase  100 
 
 		 333 aa  668    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000203163  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1581  AFG1-family ATPase  65.37 
 
 		 335 aa  419  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23980  predicted ATPase  64.04 
 
 		 349 aa  412  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669926  normal  0.124447 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1899  AFG1-family ATPase  61.68 
 
 		 343 aa  408  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7388  AFG1-family ATPase  64.12 
 
 		 363 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2272  AFG1-family ATPase  58.61 
 
 		 337 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1660  AFG1-family ATPase  57.06 
 
 		 345 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000156302 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1346  AFG1-like ATPase  57.6 
 
 		 390 aa  375  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1667  AFG1 family ATPase  56.76 
 
 		 345 aa  376  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.368599  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2220  AFG1-like ATPase  58.18 
 
 		 349 aa  362  6e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2266  AFG1 family ATPase  58.18 
 
 		 349 aa  362  6e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2209  AFG1 family ATPase  58.18 
 
 		 349 aa  362  6e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0757112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2491  AFG1 family ATPase  56.44 
 
 		 345 aa  355  5.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3912  AFG1 family ATPase  56.97 
 
 		 349 aa  353  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0771393  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3078  AFG1-family ATPase  56.47 
 
 		 356 aa  352  5e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal  0.0545755 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1883  AFG1-family ATPase  58.66 
 
 		 358 aa  349  3e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.927457  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12685  hypothetical protein  55.09 
 
 		 369 aa  349  4e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000506976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10730  predicted ATPase  54.57 
 
 		 351 aa  347  1e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0117112  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16620  predicted ATPase  55.18 
 
 		 372 aa  331  1e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.24763 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1388  AFG1-family ATPase  54.35 
 
 		 352 aa  329  3e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.629214  normal  0.139105 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13800  predicted ATPase  52.98 
 
 		 353 aa  323  3e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.908748  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1968  AFG1-family ATPase  57.19 
 
 		 354 aa  321  9.999999999999999e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.486857  decreased coverage  0.0000116257 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1740  AFG1-family ATPase  54.29 
 
 		 363 aa  308  8e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.137438 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2019  AFG1-like protein ATPase  45.81 
 
 		 350 aa  276  3e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.842851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0149  AFG1-family ATPase  43.56 
 
 		 325 aa  257  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.842308  normal  0.156894 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  31.14 
 
 		 360 aa  97.4  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  26.57 
 
 		 360 aa  86.7  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1096  AFG1 family ATPase  29.59 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.352008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3976  AFG1 family ATPase  29.19 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.605596  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  27.67 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  28.06 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3496  AFG1 family ATPase  27.54 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170583  normal  0.858132 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  27.41 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  28.06 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2621  AFG1-like ATPase  27.66 
 
 		 367 aa  79.7  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  27.65 
 
 		 383 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  26.57 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  28.25 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  26.44 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  26.49 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  26.53 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  26.53 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  27.54 
 
 		 370 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  24.55 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  26.76 
 
 		 367 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  26.19 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  26.3 
 
 		 367 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  26.42 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  27 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  27.46 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  26.9 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  26.9 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  27.25 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  28.36 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  27.33 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  27.3 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  27.99 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  27.33 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  27.33 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  28.36 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  27.99 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  26.61 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  27.54 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  26.61 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  26.38 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  28.36 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2044  AFG1-like ATPase  27.8 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136156  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  24.92 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2673  AFG1-like ATPase  25.3 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1393  AFG1 family ATPase  26.61 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  26.95 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0631  AFG1 family ATPase  31.46 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  25.62 
 
 		 367 aa  72.8  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  27.7 
 
 		 375 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  27.05 
 
 		 365 aa  72.8  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  27.7 
 
 		 375 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  27.7 
 
 		 375 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  27.7 
 
 		 375 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  27.03 
 
 		 366 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  26.32 
 
 		 364 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  25.89 
 
 		 365 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  27.03 
 
 		 366 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  27.03 
 
 		 366 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  27.03 
 
 		 366 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  26.19 
 
 		 365 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  26.32 
 
 		 364 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  27.19 
 
 		 365 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  27.94 
 
 		 393 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0188  AFG1-family ATPase  26.63 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176309  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  26.05 
 
 		 370 aa  72  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  28.38 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  26.47 
 
 		 364 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  27.11 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  27.42 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  26.47 
 
 		 364 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  26.69 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  27.67 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  26.01 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  26.8 
 
 		 364 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  27.22 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>