222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1346 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1346  AFG1-like ATPase  100 
 
 		 390 aa  758    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23980  predicted ATPase  56.99 
 
 		 349 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669926  normal  0.124447 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1581  AFG1-family ATPase  59.3 
 
 		 335 aa  385  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3542  AFG1-family ATPase  57.6 
 
 		 333 aa  376  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000203163  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7388  AFG1-family ATPase  56.88 
 
 		 363 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3078  AFG1-family ATPase  56.91 
 
 		 356 aa  362  6e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal  0.0545755 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1660  AFG1-family ATPase  52.94 
 
 		 345 aa  360  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000156302 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1667  AFG1 family ATPase  51.87 
 
 		 345 aa  356  5e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.368599  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2272  AFG1-family ATPase  50.4 
 
 		 337 aa  348  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1899  AFG1-family ATPase  51.59 
 
 		 343 aa  346  4e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2220  AFG1-like ATPase  52.69 
 
 		 349 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2266  AFG1 family ATPase  52.69 
 
 		 349 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2209  AFG1 family ATPase  52.69 
 
 		 349 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0757112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2491  AFG1 family ATPase  52.04 
 
 		 345 aa  329  6e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12685  hypothetical protein  51.6 
 
 		 369 aa  328  7e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000506976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10730  predicted ATPase  50 
 
 		 351 aa  324  2e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0117112  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3912  AFG1 family ATPase  50.66 
 
 		 349 aa  324  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0771393  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16620  predicted ATPase  49.46 
 
 		 372 aa  310  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.24763 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1883  AFG1-family ATPase  49.6 
 
 		 358 aa  296  3e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.927457  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13800  predicted ATPase  46.61 
 
 		 353 aa  292  6e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.908748  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1388  AFG1-family ATPase  46.54 
 
 		 352 aa  291  1e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.629214  normal  0.139105 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1968  AFG1-family ATPase  51.63 
 
 		 354 aa  283  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.486857  decreased coverage  0.0000116257 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1740  AFG1-family ATPase  49.86 
 
 		 363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.137438 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2019  AFG1-like protein ATPase  40.96 
 
 		 350 aa  235  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.842851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0149  AFG1-family ATPase  38.75 
 
 		 325 aa  222  8e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.842308  normal  0.156894 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  27.86 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  27.86 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  27.86 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  27.49 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3667  AFG1 family ATPase  28.22 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000159924  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  28.76 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  27.49 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  27.49 
 
 		 374 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3538  ATPase, AFG1 family  27.49 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3640  AFG1-family ATPase  28.34 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0569436  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  27.41 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0291  AFG1-family ATPase  27.93 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00126781  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4350  AFG1 family ATPase  27.65 
 
 		 376 aa  79.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000166753  hitchhiker  0.003638 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  28.86 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  28.52 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  28.52 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  28.52 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  28.52 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  28.52 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  28.52 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  28.52 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  25.33 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  27.05 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2359  AFG1-family ATPase  29.55 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  25.33 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  27 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1096  AFG1 family ATPase  26.89 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.352008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  25.33 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  26.6 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  24.54 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0298  AFG1-family ATPase  27.19 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000565805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  25.16 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  28.01 
 
 		 367 aa  73.2  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3715  AFG1 family ATPase  28.19 
 
 		 375 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708287  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  24.8 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  30.85 
 
 		 366 aa  72.8  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0407  ATPase  28.71 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1767  AFG1 family ATPase  24.52 
 
 		 365 aa  72.4  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  27.33 
 
 		 367 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  25.61 
 
 		 365 aa  72.4  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  29.93 
 
 		 361 aa  72  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  24.84 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  25.67 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  25 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2909  hypothetical protein  28.99 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332775  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  28.71 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  28.71 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  26.09 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  28.71 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  28.71 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  27.27 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  28.71 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  28.71 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34230  hypothetical protein  28.45 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0422054  decreased coverage  0.00436044 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  28.71 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  28.71 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3496  AFG1 family ATPase  27.46 
 
 		 367 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170583  normal  0.858132 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  26.71 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  26.71 
 
 		 364 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  28.33 
 
 		 360 aa  69.3  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  26.42 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  28.67 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  28.25 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  25.58 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2878  AFG1 family ATPase  25.08 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.067299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  25.07 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  25.51 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  27.22 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  25.22 
 
 		 364 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  28 
 
 		 383 aa  67  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  23.95 
 
 		 366 aa  67  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3269  AFG1 family ATPase  36.13 
 
 		 369 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1433  AFG1 family ATPase  28.33 
 
 		 365 aa  67  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0379447  normal  0.0822065 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  26.33 
 
 		 367 aa  67  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  28.33 
 
 		 365 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>