229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7388 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7388  AFG1-family ATPase  100 
 
 		 363 aa  708    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23980  predicted ATPase  62.32 
 
 		 349 aa  409  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669926  normal  0.124447 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3542  AFG1-family ATPase  64.12 
 
 		 333 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000203163  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1581  AFG1-family ATPase  61.54 
 
 		 335 aa  393  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1899  AFG1-family ATPase  56.52 
 
 		 343 aa  391  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16620  predicted ATPase  60.23 
 
 		 372 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.24763 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2272  AFG1-family ATPase  58.98 
 
 		 337 aa  382  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3078  AFG1-family ATPase  61 
 
 		 356 aa  380  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal  0.0545755 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2491  AFG1 family ATPase  58.02 
 
 		 345 aa  378  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2220  AFG1-like ATPase  57.44 
 
 		 349 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13800  predicted ATPase  58.19 
 
 		 353 aa  372  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.908748  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2266  AFG1 family ATPase  57.44 
 
 		 349 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3912  AFG1 family ATPase  56.53 
 
 		 349 aa  373  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0771393  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2209  AFG1 family ATPase  57.44 
 
 		 349 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0757112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1346  AFG1-like ATPase  57.14 
 
 		 390 aa  370  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1660  AFG1-family ATPase  56.05 
 
 		 345 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000156302 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1883  AFG1-family ATPase  60.11 
 
 		 358 aa  364  1e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.927457  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1667  AFG1 family ATPase  56.18 
 
 		 345 aa  362  8e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.368599  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12685  hypothetical protein  54.57 
 
 		 369 aa  356  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000506976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1740  AFG1-family ATPase  59.88 
 
 		 363 aa  351  1e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.137438 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10730  predicted ATPase  53.45 
 
 		 351 aa  346  3e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0117112  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1968  AFG1-family ATPase  58.91 
 
 		 354 aa  337  9.999999999999999e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.486857  decreased coverage  0.0000116257 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1388  AFG1-family ATPase  51.12 
 
 		 352 aa  320  1.9999999999999998e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.629214  normal  0.139105 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2019  AFG1-like protein ATPase  46.96 
 
 		 350 aa  270  2.9999999999999997e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.842851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0149  AFG1-family ATPase  45.07 
 
 		 325 aa  266  5e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.842308  normal  0.156894 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  27.75 
 
 		 367 aa  98.6  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  29.62 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  29.62 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  28.65 
 
 		 368 aa  94.7  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  29.62 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0298  AFG1-family ATPase  28.61 
 
 		 383 aa  93.6  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000565805  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  29.19 
 
 		 370 aa  92  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  30.87 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3640  AFG1-family ATPase  27.32 
 
 		 376 aa  90.5  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0569436  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0291  AFG1-family ATPase  28.75 
 
 		 383 aa  90.5  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00126781  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  28.98 
 
 		 377 aa  90.1  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  26.86 
 
 		 368 aa  89.7  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  29.8 
 
 		 386 aa  90.1  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  29.31 
 
 		 388 aa  89.7  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  28.61 
 
 		 370 aa  89.7  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  28.32 
 
 		 365 aa  88.6  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  27.89 
 
 		 367 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  29.38 
 
 		 410 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  29.31 
 
 		 386 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2878  AFG1 family ATPase  24.58 
 
 		 372 aa  88.2  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.067299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  27.68 
 
 		 367 aa  87.8  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  28.32 
 
 		 360 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  27.68 
 
 		 367 aa  87.8  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  29.24 
 
 		 369 aa  87.4  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  27.42 
 
 		 368 aa  86.7  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  28.81 
 
 		 365 aa  86.7  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  28.03 
 
 		 339 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  28.1 
 
 		 374 aa  86.3  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  27.68 
 
 		 365 aa  85.9  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  28.32 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4350  AFG1 family ATPase  29.93 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000166753  hitchhiker  0.003638 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  28.32 
 
 		 370 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  27.74 
 
 		 364 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  28.32 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  28.43 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  27.75 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2621  AFG1-like ATPase  28.05 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0843  AFG1 family ATPase  27.91 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  26.06 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  27.42 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3667  AFG1 family ATPase  27.71 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000159924  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  28.24 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  27.48 
 
 		 371 aa  82.8  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  28.45 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  28.06 
 
 		 365 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  27.11 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3496  AFG1 family ATPase  27.73 
 
 		 367 aa  81.6  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170583  normal  0.858132 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3976  AFG1 family ATPase  28.12 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.605596  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  28.45 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  28.21 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  28.09 
 
 		 364 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2009  hypothetical protein  28.19 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  28.3 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3538  ATPase, AFG1 family  28.45 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  28.16 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  26.32 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  28.66 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  27.89 
 
 		 383 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  28.99 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  28.99 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  26.02 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  28.01 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  27.33 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  29.26 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  28.19 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  28.19 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  27.62 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  27.3 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  26.02 
 
 		 364 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  28.19 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  28.19 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  28.19 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  28.19 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  28.19 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  28.11 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>