183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2019 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2019  AFG1-like protein ATPase  100 
 
 		 350 aa  713    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.842851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0149  AFG1-family ATPase  48.65 
 
 		 325 aa  293  3e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.842308  normal  0.156894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3542  AFG1-family ATPase  45.81 
 
 		 333 aa  276  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000203163  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23980  predicted ATPase  45.61 
 
 		 349 aa  271  9e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669926  normal  0.124447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7388  AFG1-family ATPase  46.96 
 
 		 363 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2272  AFG1-family ATPase  43.94 
 
 		 337 aa  266  5.999999999999999e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1581  AFG1-family ATPase  45.56 
 
 		 335 aa  262  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1667  AFG1 family ATPase  44.61 
 
 		 345 aa  263  4.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.368599  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2491  AFG1 family ATPase  45.21 
 
 		 345 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1899  AFG1-family ATPase  41.89 
 
 		 343 aa  262  6.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10730  predicted ATPase  42.2 
 
 		 351 aa  260  2e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0117112  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3912  AFG1 family ATPase  44.51 
 
 		 349 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0771393  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1660  AFG1-family ATPase  43.41 
 
 		 345 aa  259  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000156302 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3078  AFG1-family ATPase  44.76 
 
 		 356 aa  253  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal  0.0545755 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2220  AFG1-like ATPase  44.71 
 
 		 349 aa  252  7e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2266  AFG1 family ATPase  44.71 
 
 		 349 aa  252  7e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2209  AFG1 family ATPase  44.71 
 
 		 349 aa  252  7e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0757112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12685  hypothetical protein  43.58 
 
 		 369 aa  248  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000506976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13800  predicted ATPase  43.53 
 
 		 353 aa  242  7.999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.908748  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1883  AFG1-family ATPase  44.14 
 
 		 358 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.927457  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1346  AFG1-like ATPase  40.96 
 
 		 390 aa  235  9e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16620  predicted ATPase  42.9 
 
 		 372 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.24763 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1740  AFG1-family ATPase  43.29 
 
 		 363 aa  228  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.137438 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1388  AFG1-family ATPase  41.14 
 
 		 352 aa  224  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.629214  normal  0.139105 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1968  AFG1-family ATPase  42.6 
 
 		 354 aa  209  8e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.486857  decreased coverage  0.0000116257 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  26.1 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  25.41 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  25.41 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  26.35 
 
 		 367 aa  73.2  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  25.99 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  28.28 
 
 		 375 aa  72  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3538  ATPase, AFG1 family  25.07 
 
 		 374 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  28.28 
 
 		 375 aa  72  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  28.28 
 
 		 375 aa  72  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  25.75 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4350  AFG1 family ATPase  26.73 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000166753  hitchhiker  0.003638 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0291  AFG1-family ATPase  26.84 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00126781  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  25.49 
 
 		 364 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2586  hypothetical protein  26.2 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3667  AFG1 family ATPase  26.13 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000159924  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  24.34 
 
 		 367 aa  69.3  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2713  hypothetical protein  25 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0298  AFG1-family ATPase  25.85 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000565805  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  25.31 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  25.62 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  24.93 
 
 		 364 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  25.94 
 
 		 339 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  25.36 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  25.75 
 
 		 375 aa  66.2  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  25.22 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  24.45 
 
 		 364 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  24.19 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  28.11 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3640  AFG1-family ATPase  26.09 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0569436  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  25.14 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  25.42 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3715  AFG1 family ATPase  25.42 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708287  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  25.42 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  22.4 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  25.33 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  25.33 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  25.82 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  25.33 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  25.33 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1767  AFG1 family ATPase  26.25 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  24.77 
 
 		 364 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  25.33 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  28.73 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  27.78 
 
 		 393 aa  62.8  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0407  ATPase  25.91 
 
 		 392 aa  62.8  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2009  hypothetical protein  25.89 
 
 		 365 aa  62  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314691 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2117  AFG1-family ATPase  28.88 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  27.71 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  22.54 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0546  AFG1-like ATPase  27.22 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.420567  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  24.61 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  23.96 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0418  AFG1-like ATPase  25.79 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0205439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  23.16 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  24.42 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1302  AFG1 family ATPase  27.38 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  26.19 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  27.27 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  24.09 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  23.92 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  24.58 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  24.42 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  24.52 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  24.67 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  23.81 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  24.43 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  23.33 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  23.96 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  23.33 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  23.43 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  23.43 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  23.43 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  25.17 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1121  AFG1-family ATPase  28.18 
 
 		 416 aa  57  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133658  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  24.83 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>