230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1581 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1581  AFG1-family ATPase  100 
 
 		 335 aa  664    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23980  predicted ATPase  70.8 
 
 		 349 aa  486  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669926  normal  0.124447 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2272  AFG1-family ATPase  64.55 
 
 		 337 aa  427  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3542  AFG1-family ATPase  65.37 
 
 		 333 aa  419  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000203163  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1899  AFG1-family ATPase  61.03 
 
 		 343 aa  409  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7388  AFG1-family ATPase  61.54 
 
 		 363 aa  393  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2220  AFG1-like ATPase  59.46 
 
 		 349 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2266  AFG1 family ATPase  59.46 
 
 		 349 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2209  AFG1 family ATPase  59.46 
 
 		 349 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0757112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1346  AFG1-like ATPase  59.3 
 
 		 390 aa  384  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2491  AFG1 family ATPase  58.66 
 
 		 345 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12685  hypothetical protein  59.05 
 
 		 369 aa  384  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000506976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3912  AFG1 family ATPase  58.26 
 
 		 349 aa  378  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0771393  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1667  AFG1 family ATPase  58.38 
 
 		 345 aa  376  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.368599  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1660  AFG1-family ATPase  58.38 
 
 		 345 aa  376  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000156302 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3078  AFG1-family ATPase  60.53 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal  0.0545755 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10730  predicted ATPase  59.52 
 
 		 351 aa  358  5e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0117112  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13800  predicted ATPase  53.71 
 
 		 353 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.908748  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16620  predicted ATPase  54.01 
 
 		 372 aa  334  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.24763 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1388  AFG1-family ATPase  53.59 
 
 		 352 aa  333  3e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.629214  normal  0.139105 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1883  AFG1-family ATPase  57.27 
 
 		 358 aa  332  5e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.927457  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1740  AFG1-family ATPase  56.5 
 
 		 363 aa  324  1e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.137438 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1968  AFG1-family ATPase  55.26 
 
 		 354 aa  314  1.9999999999999998e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.486857  decreased coverage  0.0000116257 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2019  AFG1-like protein ATPase  45.56 
 
 		 350 aa  262  4.999999999999999e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.842851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0149  AFG1-family ATPase  41.34 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.842308  normal  0.156894 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0291  AFG1-family ATPase  30.12 
 
 		 383 aa  105  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00126781  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  29.23 
 
 		 370 aa  103  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  29.51 
 
 		 386 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  29 
 
 		 364 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  29.51 
 
 		 388 aa  103  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  29.23 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0298  AFG1-family ATPase  29.28 
 
 		 383 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000565805  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  28.34 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  28.65 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  28.65 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  28.65 
 
 		 370 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  28.65 
 
 		 370 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  26.85 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  27.33 
 
 		 339 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  27.33 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  26.85 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  28.57 
 
 		 367 aa  98.6  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  27.95 
 
 		 364 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  27.99 
 
 		 368 aa  97.4  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  29.23 
 
 		 370 aa  96.7  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  26.58 
 
 		 364 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  28.71 
 
 		 376 aa  95.1  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  28.17 
 
 		 364 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  26.91 
 
 		 364 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  26.67 
 
 		 368 aa  93.2  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  26.63 
 
 		 364 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3640  AFG1-family ATPase  28.57 
 
 		 376 aa  92.4  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0569436  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  26.77 
 
 		 374 aa  91.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0505  AFG1-like ATPase  27.04 
 
 		 370 aa  91.3  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013161  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  27.12 
 
 		 393 aa  90.1  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  27.81 
 
 		 365 aa  89.4  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  27.78 
 
 		 366 aa  89.7  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  25.87 
 
 		 370 aa  89.4  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  31.56 
 
 		 360 aa  89.4  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  30.1 
 
 		 375 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  30.1 
 
 		 375 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  30.1 
 
 		 375 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  30.1 
 
 		 375 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  30.74 
 
 		 375 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  26.03 
 
 		 367 aa  89  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  30.1 
 
 		 374 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  30.1 
 
 		 375 aa  89  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  30.1 
 
 		 374 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  31.07 
 
 		 374 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  31.07 
 
 		 374 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  30.74 
 
 		 375 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  29.77 
 
 		 375 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  28.21 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  28.74 
 
 		 375 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  28.74 
 
 		 375 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3538  ATPase, AFG1 family  30.1 
 
 		 374 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  26.76 
 
 		 368 aa  87.4  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  28.74 
 
 		 375 aa  87.4  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3715  AFG1 family ATPase  29.77 
 
 		 375 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708287  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  25.72 
 
 		 368 aa  86.3  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  26.96 
 
 		 371 aa  85.9  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  26.84 
 
 		 367 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3667  AFG1 family ATPase  29.17 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000159924  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  28.78 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  27.86 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4350  AFG1 family ATPase  26.5 
 
 		 376 aa  82.4  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000166753  hitchhiker  0.003638 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  29.91 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  28.87 
 
 		 367 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  29.67 
 
 		 365 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  28.87 
 
 		 367 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  28.79 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2621  AFG1-like ATPase  29.08 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0870  AFG1-family ATPase  30.7 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  27.58 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  25.41 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3976  AFG1 family ATPase  29.46 
 
 		 371 aa  79.3  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.605596  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  29.8 
 
 		 372 aa  79.3  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3496  AFG1 family ATPase  27.99 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170583  normal  0.858132 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  28.16 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  26.84 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>