236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1883 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1883  AFG1-family ATPase  100 
 
 
358 aa  706    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.927457  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16620  predicted ATPase  68.45 
 
 
372 aa  425  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.24763 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1740  AFG1-family ATPase  66.67 
 
 
363 aa  393  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.137438 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1388  AFG1-family ATPase  62.39 
 
 
352 aa  383  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.629214  normal  0.139105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7388  AFG1-family ATPase  60.11 
 
 
363 aa  364  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3078  AFG1-family ATPase  57.56 
 
 
356 aa  353  2e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal  0.0545755 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3542  AFG1-family ATPase  58.66 
 
 
333 aa  349  4e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000203163  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1968  AFG1-family ATPase  61.45 
 
 
354 aa  342  7e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.486857  decreased coverage  0.0000116257 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13800  predicted ATPase  55.52 
 
 
353 aa  340  2e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.908748  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23980  predicted ATPase  55.39 
 
 
349 aa  334  1e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669926  normal  0.124447 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1581  AFG1-family ATPase  57.27 
 
 
335 aa  332  6e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1660  AFG1-family ATPase  53.57 
 
 
345 aa  331  1e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000156302 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1667  AFG1 family ATPase  53.22 
 
 
345 aa  324  1e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.368599  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1899  AFG1-family ATPase  50.76 
 
 
343 aa  319  3.9999999999999996e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2272  AFG1-family ATPase  51.64 
 
 
337 aa  313  1.9999999999999998e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10730  predicted ATPase  53.2 
 
 
351 aa  313  2.9999999999999996e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0117112  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3912  AFG1 family ATPase  51.95 
 
 
349 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0771393  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2491  AFG1 family ATPase  50.44 
 
 
345 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12685  hypothetical protein  53.05 
 
 
369 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000506976  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1346  AFG1-like ATPase  49.87 
 
 
390 aa  296  4e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2220  AFG1-like ATPase  50.15 
 
 
349 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2266  AFG1 family ATPase  50.15 
 
 
349 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109131  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2209  AFG1 family ATPase  50.15 
 
 
349 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0757112  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2019  AFG1-like protein ATPase  44.14 
 
 
350 aa  240  2.9999999999999997e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.842851  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0149  AFG1-family ATPase  41.19 
 
 
325 aa  223  4.9999999999999996e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.842308  normal  0.156894 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  24.45 
 
 
364 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  26.43 
 
 
358 aa  72.8  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2621  AFG1-like ATPase  28.28 
 
 
367 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338976  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  35.14 
 
 
367 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  35.14 
 
 
367 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3496  AFG1 family ATPase  27.51 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170583  normal  0.858132 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  24.18 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  27.04 
 
 
375 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  25.96 
 
 
364 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  27.04 
 
 
375 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  27.04 
 
 
375 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3976  AFG1 family ATPase  34.18 
 
 
371 aa  70.5  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.605596  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  30.69 
 
 
358 aa  70.1  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  25.96 
 
 
364 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3640  AFG1-family ATPase  30.3 
 
 
376 aa  69.3  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0569436  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  23.17 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  28.57 
 
 
367 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5175  AFG1 family ATPase  30.77 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  26.85 
 
 
365 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  26.06 
 
 
339 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1096  AFG1 family ATPase  26.68 
 
 
361 aa  67  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.352008  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  29.58 
 
 
369 aa  67  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0291  AFG1-family ATPase  27.51 
 
 
383 aa  67  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00126781  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  33.78 
 
 
370 aa  67  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  30.32 
 
 
383 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1792  AFG1 family ATPase  28.95 
 
 
361 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  25.55 
 
 
364 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  29.74 
 
 
393 aa  66.6  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3675  AFG1-like ATPase  32.04 
 
 
377 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  31.68 
 
 
368 aa  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2044  AFG1-like ATPase  29.41 
 
 
365 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136156  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  29.79 
 
 
365 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  28.06 
 
 
391 aa  65.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  24.19 
 
 
374 aa  65.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34230  hypothetical protein  31.76 
 
 
384 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0422054  decreased coverage  0.00436044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58880  putative ATPase  28.84 
 
 
363 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0491345 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1952  AFG1 family ATPase  27.6 
 
 
356 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0330753 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0631  AFG1 family ATPase  30.57 
 
 
388 aa  65.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  29.26 
 
 
365 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  26.05 
 
 
368 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3269  AFG1 family ATPase  32.22 
 
 
369 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588106  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2673  AFG1-like ATPase  25.65 
 
 
354 aa  65.1  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  29.63 
 
 
371 aa  65.1  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  24.35 
 
 
364 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1541  AFG1 family ATPase  30.52 
 
 
341 aa  64.3  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.314892  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  29.59 
 
 
360 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  29.41 
 
 
365 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  26.1 
 
 
367 aa  64.3  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  26.9 
 
 
376 aa  64.7  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0407  ATPase  24.89 
 
 
392 aa  64.3  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  26.63 
 
 
377 aa  64.7  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  26.94 
 
 
367 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  26.6 
 
 
366 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  30.48 
 
 
366 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  30.48 
 
 
365 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  33.79 
 
 
370 aa  63.9  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  30.48 
 
 
366 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  30.48 
 
 
366 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  29.03 
 
 
358 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  30.48 
 
 
366 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  30.48 
 
 
366 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  30.48 
 
 
366 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  24.63 
 
 
365 aa  63.5  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  23.71 
 
 
364 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  30.48 
 
 
365 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2878  AFG1 family ATPase  23.41 
 
 
372 aa  63.5  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.067299  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  29.03 
 
 
358 aa  63.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0298  AFG1-family ATPase  29.29 
 
 
383 aa  63.2  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000565805  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4350  AFG1 family ATPase  26.56 
 
 
376 aa  63.2  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000166753  hitchhiker  0.003638 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  24.03 
 
 
364 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1767  AFG1 family ATPase  30.14 
 
 
365 aa  62.8  0.000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  23.43 
 
 
364 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  26.76 
 
 
368 aa  62.4  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2660  AFG1-like ATPase  32.88 
 
 
373 aa  62  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  30.69 
 
 
360 aa  62.4  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>