226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1667 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1667  AFG1 family ATPase  100 
 
 		 345 aa  707    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.368599  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1660  AFG1-family ATPase  88.12 
 
 		 345 aa  630  1e-179  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000156302 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10730  predicted ATPase  66.38 
 
 		 351 aa  446  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0117112  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23980  predicted ATPase  55.91 
 
 		 349 aa  378  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669926  normal  0.124447 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3078  AFG1-family ATPase  58.43 
 
 		 356 aa  378  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal  0.0545755 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3542  AFG1-family ATPase  56.76 
 
 		 333 aa  376  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000203163  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1581  AFG1-family ATPase  58.38 
 
 		 335 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7388  AFG1-family ATPase  56.18 
 
 		 363 aa  362  7.0000000000000005e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1899  AFG1-family ATPase  54.79 
 
 		 343 aa  360  2e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1346  AFG1-like ATPase  51.87 
 
 		 390 aa  355  5e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1388  AFG1-family ATPase  53.91 
 
 		 352 aa  347  2e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.629214  normal  0.139105 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2272  AFG1-family ATPase  51.79 
 
 		 337 aa  338  5.9999999999999996e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16620  predicted ATPase  53.33 
 
 		 372 aa  335  9e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.24763 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2491  AFG1 family ATPase  51.47 
 
 		 345 aa  329  4e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12685  hypothetical protein  51.42 
 
 		 369 aa  328  8e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000506976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2220  AFG1-like ATPase  51.32 
 
 		 349 aa  325  8.000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2266  AFG1 family ATPase  51.32 
 
 		 349 aa  325  8.000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2209  AFG1 family ATPase  51.32 
 
 		 349 aa  325  8.000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0757112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1883  AFG1-family ATPase  53.22 
 
 		 358 aa  324  1e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.927457  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3912  AFG1 family ATPase  52.05 
 
 		 349 aa  323  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0771393  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13800  predicted ATPase  50 
 
 		 353 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.908748  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1740  AFG1-family ATPase  51.91 
 
 		 363 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.137438 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1968  AFG1-family ATPase  52.11 
 
 		 354 aa  297  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.486857  decreased coverage  0.0000116257 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2019  AFG1-like protein ATPase  44.61 
 
 		 350 aa  263  4.999999999999999e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.842851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0149  AFG1-family ATPase  43.11 
 
 		 325 aa  253  3e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.842308  normal  0.156894 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  28.99 
 
 		 367 aa  98.2  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  28.99 
 
 		 367 aa  98.2  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  27.27 
 
 		 368 aa  95.9  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  28.22 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  28.42 
 
 		 364 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  28.42 
 
 		 364 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  29.08 
 
 		 365 aa  94  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3976  AFG1 family ATPase  30.77 
 
 		 371 aa  92.8  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.605596  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  27.9 
 
 		 364 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  28.7 
 
 		 339 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  27.47 
 
 		 364 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  26.37 
 
 		 367 aa  88.6  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  27.05 
 
 		 364 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  27.99 
 
 		 364 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  27.6 
 
 		 367 aa  87.4  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2621  AFG1-like ATPase  29.04 
 
 		 367 aa  87  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3496  AFG1 family ATPase  28.19 
 
 		 367 aa  86.7  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170583  normal  0.858132 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  26.35 
 
 		 368 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  26.97 
 
 		 368 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  28.95 
 
 		 365 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  27.91 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  28.95 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  28.95 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  28.49 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  26.08 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  28.7 
 
 		 383 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  28.19 
 
 		 365 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  26.87 
 
 		 364 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  26.25 
 
 		 388 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0843  AFG1 family ATPase  28.61 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  26.44 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  25.34 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  27.89 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  27.89 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  25.98 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  27.89 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  27.89 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  27.89 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  27.89 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  27.89 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  26.59 
 
 		 364 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  27.51 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  25.92 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  27.41 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  26.9 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  26.8 
 
 		 365 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  26.02 
 
 		 370 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  26.51 
 
 		 365 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  26.02 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  26.29 
 
 		 370 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  26.29 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  26.35 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1393  AFG1 family ATPase  27.6 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1433  AFG1 family ATPase  27.6 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0379447  normal  0.0822065 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1744  AFG1 family ATPase  27.3 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067746 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  25.65 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0298  AFG1-family ATPase  25.34 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000565805  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2044  AFG1-like ATPase  25.47 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136156  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2009  hypothetical protein  27.22 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314691 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  26.23 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  26.05 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  25.14 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  28.38 
 
 		 365 aa  75.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1096  AFG1 family ATPase  26.69 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.352008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  27 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  28.01 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  24.79 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  27.51 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0505  AFG1-like ATPase  26.97 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013161  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  25.14 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0291  AFG1-family ATPase  25.13 
 
 		 383 aa  72.8  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00126781  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  25.69 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0418  AFG1-like ATPase  26.7 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0205439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  26.72 
 
 		 361 aa  72  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  27.55 
 
 		 366 aa  72  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>