230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2266 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2220  AFG1-like ATPase  100 
 
 		 349 aa  704    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2266  AFG1 family ATPase  100 
 
 		 349 aa  704    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2209  AFG1 family ATPase  100 
 
 		 349 aa  704    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0757112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3912  AFG1 family ATPase  84.15 
 
 		 349 aa  587  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0771393  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2491  AFG1 family ATPase  85.07 
 
 		 345 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12685  hypothetical protein  80.52 
 
 		 369 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000506976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2272  AFG1-family ATPase  64.29 
 
 		 337 aa  442  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1899  AFG1-family ATPase  64.37 
 
 		 343 aa  439  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1581  AFG1-family ATPase  59.46 
 
 		 335 aa  388  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7388  AFG1-family ATPase  57.44 
 
 		 363 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23980  predicted ATPase  55.03 
 
 		 349 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669926  normal  0.124447 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3542  AFG1-family ATPase  58.18 
 
 		 333 aa  362  6e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000203163  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3078  AFG1-family ATPase  55.16 
 
 		 356 aa  347  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal  0.0545755 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1660  AFG1-family ATPase  51.91 
 
 		 345 aa  338  8e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000156302 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1346  AFG1-like ATPase  52.82 
 
 		 390 aa  331  9e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1667  AFG1 family ATPase  51.32 
 
 		 345 aa  325  8.000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.368599  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10730  predicted ATPase  51.45 
 
 		 351 aa  324  1e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0117112  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13800  predicted ATPase  50.88 
 
 		 353 aa  322  7e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.908748  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16620  predicted ATPase  50 
 
 		 372 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.24763 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1968  AFG1-family ATPase  53.17 
 
 		 354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.486857  decreased coverage  0.0000116257 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1883  AFG1-family ATPase  50.15 
 
 		 358 aa  294  2e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.927457  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1740  AFG1-family ATPase  51.37 
 
 		 363 aa  292  5e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.137438 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1388  AFG1-family ATPase  49.25 
 
 		 352 aa  290  2e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.629214  normal  0.139105 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0149  AFG1-family ATPase  43.41 
 
 		 325 aa  265  7e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.842308  normal  0.156894 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2019  AFG1-like protein ATPase  44.71 
 
 		 350 aa  252  7e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.842851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  27.01 
 
 		 361 aa  89  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  27.54 
 
 		 386 aa  89  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  27.54 
 
 		 386 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  27.54 
 
 		 388 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  27.96 
 
 		 370 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  27.96 
 
 		 370 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  27.43 
 
 		 370 aa  86.3  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  27.96 
 
 		 370 aa  86.3  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  26.96 
 
 		 365 aa  86.3  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  27.22 
 
 		 370 aa  85.9  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  25.54 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  25.63 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  28.37 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  26.1 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  26.93 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  26.72 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  26.03 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  26.97 
 
 		 370 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  26.91 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  23.77 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0298  AFG1-family ATPase  26.7 
 
 		 383 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000565805  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  26.92 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  26.63 
 
 		 364 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  26.06 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  28.92 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  28.16 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  27.07 
 
 		 339 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0505  AFG1-like ATPase  25.48 
 
 		 370 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013161  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3976  AFG1 family ATPase  27.18 
 
 		 371 aa  79.3  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.605596  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  24.56 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2621  AFG1-like ATPase  25.5 
 
 		 367 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  24.26 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0291  AFG1-family ATPase  26.14 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00126781  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  26.13 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  25.82 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  25.64 
 
 		 364 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  25.5 
 
 		 364 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  27.03 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  24.85 
 
 		 383 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  26.42 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  28.1 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  24.36 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  28.1 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  28.1 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  26.21 
 
 		 364 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  26.63 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  28.1 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3640  AFG1-family ATPase  25.57 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0569436  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  27.88 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  25.36 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  26.3 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  25.99 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  26.3 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  24.56 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  25.57 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  26.89 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  25.57 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  26.3 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  27.78 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  25.87 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  25.79 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  25 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  24.68 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  24.93 
 
 		 365 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1393  AFG1 family ATPase  24.26 
 
 		 365 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  28.1 
 
 		 375 aa  72.8  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  25.24 
 
 		 367 aa  72.8  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  25.56 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  24.26 
 
 		 365 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  24.26 
 
 		 365 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  24.85 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  27.56 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  24.85 
 
 		 365 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  25 
 
 		 360 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  24.85 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>