More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3259 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3259  xylulokinase  100 
 
 
533 aa  1058    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1235  xylulokinase  52.71 
 
 
480 aa  423  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.757817  normal  0.113808 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  46.15 
 
 
494 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  45.82 
 
 
493 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  45.57 
 
 
493 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  44.98 
 
 
493 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  45.77 
 
 
493 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  45.36 
 
 
493 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  45.15 
 
 
493 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  45.57 
 
 
493 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  45.57 
 
 
493 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  45.57 
 
 
493 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  46.88 
 
 
485 aa  368  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  46.3 
 
 
493 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  44.19 
 
 
484 aa  365  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  46.07 
 
 
490 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  46.07 
 
 
490 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  46.07 
 
 
490 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  46.07 
 
 
490 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  46.22 
 
 
481 aa  363  4e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  43.48 
 
 
489 aa  360  4e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  43.12 
 
 
487 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  46.11 
 
 
493 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  46.11 
 
 
493 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  46.11 
 
 
493 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  45.28 
 
 
478 aa  356  5e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  41.53 
 
 
494 aa  356  6.999999999999999e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  41.22 
 
 
492 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0756  xylulokinase  46.76 
 
 
479 aa  355  1e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  44.65 
 
 
491 aa  353  5e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6709  xylulokinase (xylulose kinase)  44.96 
 
 
481 aa  352  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566746  normal  0.0890509 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  42.86 
 
 
484 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  43.06 
 
 
484 aa  349  7e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2839  xylulokinase  45.07 
 
 
478 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  42.3 
 
 
483 aa  347  3e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1177  xylulose kinase  45.07 
 
 
478 aa  347  3e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  42.3 
 
 
483 aa  347  3e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  43.44 
 
 
485 aa  346  7e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  43.39 
 
 
484 aa  342  7e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  44.47 
 
 
488 aa  342  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  45.38 
 
 
492 aa  341  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  44.91 
 
 
492 aa  340  4e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  42.5 
 
 
482 aa  338  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  45.59 
 
 
492 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  45.59 
 
 
492 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  43.62 
 
 
486 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  44.97 
 
 
492 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  41.9 
 
 
495 aa  335  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  42.15 
 
 
484 aa  335  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  43.39 
 
 
496 aa  334  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  45.17 
 
 
492 aa  335  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  42.15 
 
 
484 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  43.42 
 
 
483 aa  333  4e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1997  xylose kinase  44.56 
 
 
480 aa  333  7.000000000000001e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0574625  normal  0.349837 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  41.94 
 
 
484 aa  332  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  43.71 
 
 
486 aa  331  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  42.74 
 
 
484 aa  330  3e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  43.36 
 
 
484 aa  329  7e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  41.49 
 
 
483 aa  329  9e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4208  xylulokinase  45.38 
 
 
492 aa  327  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0365818  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  42.41 
 
 
486 aa  325  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  42.18 
 
 
491 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  41.07 
 
 
496 aa  324  3e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  41.75 
 
 
484 aa  323  5e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  41.75 
 
 
484 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  41.96 
 
 
484 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  41.75 
 
 
484 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  41.75 
 
 
484 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  41.75 
 
 
484 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0853  xylulokinase  42.09 
 
 
492 aa  321  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985754  normal  0.66346 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  41.54 
 
 
484 aa  320  5e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  39.25 
 
 
486 aa  320  5e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  41.34 
 
 
484 aa  319  7.999999999999999e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  41.53 
 
 
485 aa  318  1e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  41.25 
 
 
484 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  41.25 
 
 
484 aa  317  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  41.46 
 
 
484 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  44.98 
 
 
486 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  45.54 
 
 
486 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2162  xylulokinase  43.21 
 
 
485 aa  314  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  41.04 
 
 
484 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1745  xylulokinase  44.74 
 
 
486 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  44.74 
 
 
486 aa  312  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3164  xylulokinase  43.22 
 
 
526 aa  311  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  42.86 
 
 
485 aa  310  5e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  44 
 
 
475 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  44 
 
 
475 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  44 
 
 
475 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  44 
 
 
475 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  41.18 
 
 
508 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  40.53 
 
 
496 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  35.93 
 
 
489 aa  303  7.000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  41.16 
 
 
483 aa  301  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  44.39 
 
 
488 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  44.39 
 
 
488 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  43.59 
 
 
488 aa  297  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  35.91 
 
 
500 aa  295  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  42.16 
 
 
498 aa  294  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  39.25 
 
 
511 aa  291  3e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3071  xylulokinase  42.96 
 
 
488 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>