44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1560 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1560  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  479  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4289  hypothetical protein  52.97 
 
 		 217 aa  181  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.817777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2527  hypothetical protein  36.41 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103788 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2257  hypothetical protein  37.43 
 
 		 270 aa  93.2  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  35.55 
 
 		 243 aa  87  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5034  hypothetical protein  34.67 
 
 		 253 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4574  hypothetical protein  34.67 
 
 		 253 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  33.33 
 
 		 244 aa  85.5  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5092  hypothetical protein  35.15 
 
 		 260 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.821944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3565  hypothetical protein  30.65 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  33.89 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2004  hypothetical protein  31.46 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  29.94 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3265  hypothetical protein  35.35 
 
 		 327 aa  78.6  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0071  hypothetical protein  32 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0081  hypothetical protein  33.53 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1536  hypothetical protein  36.26 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3470  hypothetical protein  40.13 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.795645  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1333  hypothetical protein  31.63 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  34.62 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2985  hypothetical protein  32.8 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5203  hypothetical protein  37.3 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  34.69 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2668  hypothetical protein  35.98 
 
 		 278 aa  71.6  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681944  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  35.05 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3023  hypothetical protein  32.77 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.281163 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1731  hypothetical protein  32.75 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  31.51 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1901  hypothetical protein  29.95 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  34.09 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  37.34 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1121  hypothetical protein  37.41 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3767  hypothetical protein  32.37 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  32.97 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1829  hypothetical protein  30.73 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3892  hypothetical protein  28.64 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0691561 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  31.61 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  35.44 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3807  hypothetical protein  32.76 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10779  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4216  hypothetical protein  30.86 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1073  hypothetical protein  34 
 
 		 317 aa  55.5  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.245832 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2012  hypothetical protein  32.45 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4463  hypothetical protein  32.68 
 
 		 259 aa  45.4  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2826  hypothetical protein  25.14 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.473489  normal  0.673375 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>