More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1975 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1975  uridylate kinase  100 
 
 
230 aa  441  1e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1294  uridylate kinase  71.18 
 
 
239 aa  282  4.0000000000000003e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1510  uridylate kinase  65.64 
 
 
242 aa  261  4.999999999999999e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3479  uridylate kinase  63.88 
 
 
241 aa  255  4e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2386  uridylate kinase  63.04 
 
 
241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.110359  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  55.05 
 
 
234 aa  230  1e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1036  uridylate kinase, putative  49.11 
 
 
234 aa  189  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0788  uridylate kinase  47.77 
 
 
233 aa  188  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.020264 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1003  hypothetical protein  46.26 
 
 
235 aa  178  7e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.249631 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1051  uridylate kinase, putative  43.56 
 
 
236 aa  176  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.979226  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1372  uridylate kinase  42.98 
 
 
225 aa  169  4e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138786  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1964  uridylate kinase  45.87 
 
 
229 aa  168  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.082157  normal  0.015373 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1383  uridylate kinase  40.79 
 
 
225 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0559412  normal  0.859936 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0744  uridylate kinase  41.23 
 
 
225 aa  166  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0705972  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0760  uridylate kinase, putative  45.28 
 
 
234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.80494  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0525  uridylate kinase  41.67 
 
 
225 aa  159  3e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1253  uridylate kinase  41.67 
 
 
225 aa  158  9e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.262381  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1152  uridylate kinase, putative  45.98 
 
 
223 aa  149  4e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1705  uridylate kinase, putative  36.16 
 
 
227 aa  119  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.118956 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1763  uridylate kinase  37.62 
 
 
224 aa  115  6e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.538162 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1191  uridylate kinase  34.93 
 
 
224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0629  uridylate kinase, putative  32.48 
 
 
226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1955  uridylate kinase  35.19 
 
 
226 aa  109  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1804  uridylate kinase  37.11 
 
 
217 aa  100  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.513591 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0583  uridylate kinase  28.33 
 
 
229 aa  99.4  5e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0530  uridylate kinase  33.48 
 
 
217 aa  90.9  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.390373  normal  0.0202207 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0518  uridylate kinase, putative  35.4 
 
 
232 aa  90.5  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2085  uridylate kinase  29.18 
 
 
231 aa  90.1  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00820156  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1665  uridylate kinase  35.27 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0833917  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1613  uridylate kinase  33.04 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.52534  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38970  uridylate kinase  32.05 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  30.35 
 
 
237 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  27.16 
 
 
240 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  25.54 
 
 
235 aa  62.8  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  29.51 
 
 
242 aa  62.8  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  26.92 
 
 
240 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  30 
 
 
244 aa  62.8  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  29.09 
 
 
244 aa  62.4  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  26.84 
 
 
242 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  25.67 
 
 
235 aa  61.2  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0569  uridylate kinase  29.57 
 
 
239 aa  60.5  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0199156  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  29.26 
 
 
240 aa  60.5  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  28.57 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  27.71 
 
 
235 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  30.86 
 
 
238 aa  59.7  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3051  uridylate kinase  30.13 
 
 
247 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1485  uridylate kinase  29.49 
 
 
245 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  29.19 
 
 
240 aa  59.3  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0444  uridylate kinase  25 
 
 
235 aa  59.3  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.014483  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17080  uridylate kinase  29.49 
 
 
245 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  26.88 
 
 
241 aa  59.3  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  27.85 
 
 
240 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  28.38 
 
 
242 aa  58.9  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1188  uridylate kinase  26 
 
 
231 aa  58.9  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153255  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  30.95 
 
 
237 aa  58.9  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3266  uridylate kinase  30.43 
 
 
238 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623734  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1696  uridylate kinase  31.67 
 
 
238 aa  58.9  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  30.43 
 
 
245 aa  58.5  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  30.2 
 
 
253 aa  58.5  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1148  uridylate kinase  27.36 
 
 
247 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  26.34 
 
 
246 aa  58.5  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  27.93 
 
 
241 aa  58.5  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  28.57 
 
 
239 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1593  uridylate kinase  29.49 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.556866  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4184  uridylate kinase  29.49 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  27.22 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1588  uridylate kinase  32.04 
 
 
250 aa  57.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  27.37 
 
 
245 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf053  uridylate kinase  23.9 
 
 
240 aa  56.6  0.0000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0596  UMP kinase  25.21 
 
 
235 aa  56.2  0.0000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2110  uridylate kinase  30.77 
 
 
246 aa  56.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  28.76 
 
 
246 aa  56.2  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1842  uridylate kinase  30.87 
 
 
241 aa  56.2  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.818163 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1319  uridylate kinase  29.79 
 
 
241 aa  55.8  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.169344 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1267  uridylate kinase  26.09 
 
 
231 aa  55.8  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.761618  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2595  uridylate kinase  30 
 
 
247 aa  55.8  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0151239  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2855  uridylate kinase  32.04 
 
 
238 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654259  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1536  uridylate kinase  31.41 
 
 
247 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1345  uridylate kinase  31.41 
 
 
246 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15269  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  27.87 
 
 
242 aa  55.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  26.34 
 
 
239 aa  55.1  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  27.71 
 
 
242 aa  55.1  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2031  uridylate kinase  31.93 
 
 
240 aa  55.1  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1274  uridylate kinase  27.37 
 
 
240 aa  54.3  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000592855  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1103  uridylate kinase  30.13 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.637012  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  24.41 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  25.41 
 
 
235 aa  54.7  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  26.74 
 
 
236 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4515  uridylate kinase  31.54 
 
 
238 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  28.49 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0243  uridylate kinase  29.57 
 
 
241 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0258  uridylate kinase  29.57 
 
 
241 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100769  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0256  uridylate kinase  29.57 
 
 
241 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.923917 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0709  uridylate kinase  29.57 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0908162  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0240  uridylate kinase  29.57 
 
 
241 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351644  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1673  uridylate kinase  26.37 
 
 
252 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  32.17 
 
 
373 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  25.96 
 
 
235 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13319  predicted protein  27.71 
 
 
239 aa  53.9  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.494059  normal  0.0799913 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4080  uridylate kinase  30.77 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.217226  normal  0.333914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>