36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4469 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013745  Htur_4469  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  311  1.9999999999999998e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155394  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3893  UspA domain protein  75.97 
 
 
161 aa  248  1e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4434  UspA domain protein  49.35 
 
 
154 aa  160  8.000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0155687  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2441  UspA domain protein  43.14 
 
 
152 aa  123  9e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186084  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0044  UspA domain protein  40.26 
 
 
160 aa  105  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.412949  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4670  hypothetical protein  38.31 
 
 
152 aa  98.6  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1174  UpsA domain-containing protein  39.74 
 
 
153 aa  95.5  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.514178  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0832  UspA domain protein  37.5 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  32.47 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  33.58 
 
 
151 aa  60.5  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  46.48 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  48.21 
 
 
142 aa  54.3  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  46.15 
 
 
162 aa  52.4  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  45.9 
 
 
135 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  27.89 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  36.36 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3934  UspA domain protein  41.07 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  28.97 
 
 
161 aa  47  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  45.45 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  32.04 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  41.67 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  45.83 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  34.67 
 
 
142 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  36.07 
 
 
173 aa  44.7  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  35.96 
 
 
130 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  38.71 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  51.06 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  43.9 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  38.46 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  55.56 
 
 
131 aa  42.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
130 aa  42.4  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  34.09 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  47.83 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  43.48 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  48.94 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  52.17 
 
 
136 aa  40.8  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>