28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3906 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_3906  Ricin B lectin  100 
 
 
744 aa  1496    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0306743  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3900  hypothetical protein  37.74 
 
 
731 aa  380  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.020807  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3897  Parallel beta-helix repeat protein  37.31 
 
 
414 aa  169  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00247458  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  33.53 
 
 
582 aa  154  8e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  31.07 
 
 
560 aa  144  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  29.87 
 
 
563 aa  138  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1869  parallel beta-helix repeat protein  32.11 
 
 
384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08927  conserved hypothetical protein  28.03 
 
 
355 aa  121  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.096319 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  35.62 
 
 
566 aa  73.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  29.73 
 
 
411 aa  64.3  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  32.39 
 
 
1413 aa  60.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  36.73 
 
 
510 aa  53.5  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  32.17 
 
 
436 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  26.71 
 
 
695 aa  52  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  27.22 
 
 
1139 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  28.77 
 
 
503 aa  49.7  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  27.78 
 
 
503 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.45 
 
 
472 aa  48.1  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  28.15 
 
 
664 aa  47.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  34.09 
 
 
863 aa  47.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  30.14 
 
 
537 aa  46.2  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  30.11 
 
 
2073 aa  46.6  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  24.49 
 
 
737 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  25.18 
 
 
494 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  31.71 
 
 
982 aa  45.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  33.66 
 
 
392 aa  45.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  28.83 
 
 
576 aa  44.3  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2560  Ricin B lectin  37.04 
 
 
656 aa  43.9  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.257771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>