115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2791 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2791  methylaspartate mutase, S subunit  100 
 
 		 149 aa  296  5e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2980  methylaspartate mutase subunit S  76.76 
 
 		 146 aa  220  4.9999999999999996e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1594  methylaspartate mutase, S subunit  76.76 
 
 		 146 aa  219  7e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3334  methylaspartate mutase, S subunit  73.94 
 
 		 151 aa  207  3e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1347  methylaspartate mutase subunit S  52.63 
 
 		 137 aa  156  7e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15460  methylaspartate mutase subunit S  52.21 
 
 		 146 aa  148  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4403  methylaspartate mutase subunit S  49.62 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2692  methylaspartate mutase subunit S  50 
 
 		 144 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0752  methylaspartate mutase subunit S  45.86 
 
 		 149 aa  129  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0832  methylaspartate mutase subunit S  45.11 
 
 		 149 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1023  methylaspartate mutase subunit S  44.19 
 
 		 139 aa  120  8e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0266173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3405  methylaspartate mutase, E subunit  33.33 
 
 		 646 aa  79.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4358  cobalamin B12-binding domain protein  38.17 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.554272  normal  0.47471 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4872  cobalamin B12-binding domain protein  38.04 
 
 		 210 aa  63.9  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2951  methylaspartate mutase subunit S  38.79 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0872778  normal  0.0119232 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6168  hypothetical protein  34.35 
 
 		 164 aa  60.1  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.807131  decreased coverage  0.00427364 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1835  cobalamin B12-binding domain protein  34.95 
 
 		 212 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0388  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.94 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000031654  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15360  Methionine synthase  31.03 
 
 		 210 aa  50.4  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  29.63 
 
 		 218 aa  50.4  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3053  B12-dependent methionine synthase  30.68 
 
 		 1251 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.453999 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3149  B12-dependent methionine synthase  30.68 
 
 		 1220 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3211  B12-dependent methionine synthase  30.68 
 
 		 1264 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.509178 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0538  methylmalonyl-CoA mutase C-terminal domain-containing protein  26.67 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000893241 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  29.89 
 
 		 607 aa  48.1  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3161  B12-dependent methionine synthase  30.68 
 
 		 1264 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.95608 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2026  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.2 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113125  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2929  cobalamin B12-binding domain protein  30.85 
 
 		 216 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000012726  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3949  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.58 
 
 		 248 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25850  predicted cobalamin binding protein  29.46 
 
 		 217 aa  48.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2310  trimethylamine corrinoid protein  33.71 
 
 		 216 aa  47.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00299987  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1316  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  33.71 
 
 		 207 aa  47.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.518339 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1368  trimethylamine corrinoid protein  31.09 
 
 		 216 aa  47.4  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000818926  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1170  D-Lysine 56-aminomutase alpha subunit  31.13 
 
 		 745 aa  47.4  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000101599  decreased coverage  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19540  predicted cobalamin binding protein  27.91 
 
 		 219 aa  47.8  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109769  hitchhiker  0.00000629767 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  25.69 
 
 		 213 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0387  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  33.71 
 
 		 207 aa  47  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.682962  normal  0.201782 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  29.36 
 
 		 210 aa  47.4  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3199  Methionine synthase B12-binding module cap domain protein  28.41 
 
 		 212 aa  47.4  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1574  methylmalonyl-CoA mutase-like  27.86 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000332572  normal  0.305791 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  28.41 
 
 		 1251 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1578  B12-binding protein  25 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.432317  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  29.36 
 
 		 224 aa  46.2  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  29.23 
 
 		 1156 aa  46.6  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6322  hypothetical protein  29.41 
 
 		 204 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1206  cobalamin B12-binding  35 
 
 		 224 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4360  cobalamin B12-binding domain protein  26.67 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.36975  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2664  beta-lysine 5,6-aminomutase beta subunit / D-lysine 5,6-aminomutase beta subunit  32.35 
 
 		 251 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.438749  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1041  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.34 
 
 		 211 aa  45.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.388992 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5018  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.4 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1110  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.83 
 
 		 208 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0539  cobalamin B12-binding domain protein  33.33 
 
 		 218 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4611  cobalamin B12-binding domain protein  30.11 
 
 		 210 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.855843  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3658  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.09 
 
 		 210 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1107  cobalamin B12-binding domain protein  27.93 
 
 		 210 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1729  Methionine synthase  28.18 
 
 		 210 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2368  cobalamin B12-binding domain protein  33.33 
 
 		 213 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  29.13 
 
 		 210 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1548  cobalamin B12-binding domain protein  27.78 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166361 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1732  Methionine synthase  28.18 
 
 		 210 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0510  cobalamin B12-binding domain protein  30.3 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal  0.90311 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2104  cobalamin B12-binding domain protein  30 
 
 		 228 aa  45.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0454156  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  33.9 
 
 		 1158 aa  44.3  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2157  2-methyleneglutarate mutase  31.87 
 
 		 616 aa  44.7  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.937034  normal  0.527767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  32.2 
 
 		 1173 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2691  cobalamin B12-binding domain protein  26.98 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0118523  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1503  dimethylamine corrinoid protein  30.08 
 
 		 217 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.153126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1541  methylmalonyl-CoA mutase, alpha subunit  26.87 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0770461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2784  cobalamin B12-binding protein  34.48 
 
 		 221 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0108719  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2332  methylmalonyl-CoA mutase  22.4 
 
 		 1146 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3188  Methylmalonyl-CoA mutase  33.83 
 
 		 725 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.36577  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1481  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.83 
 
 		 734 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00108773  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2612  methionine synthase  27.59 
 
 		 894 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.268969 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1895  cobalamin B12-binding domain protein  28.09 
 
 		 209 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  30.51 
 
 		 1193 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1989  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.12 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1359  cobalamin B12-binding domain protein  23.08 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000160657  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  29.55 
 
 		 1168 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2567  cobalamin B12-binding domain protein  28.74 
 
 		 206 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474708  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  25.78 
 
 		 1181 aa  42.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  35.59 
 
 		 1189 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2116  corrinoid methyltransferase  32.2 
 
 		 209 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00601394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1769  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.32 
 
 		 134 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00734137  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2266  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.19 
 
 		 260 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220263  normal  0.0873813 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1487  cobalamin B12-binding domain protein  23.7 
 
 		 135 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.40083  normal  0.12756 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2028  cobalamin B12-binding domain protein  26.56 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  31.03 
 
 		 212 aa  41.6  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1832  methylmalonyl-CoA mutase  26.56 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436511  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0037  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  24.14 
 
 		 873 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0357424  normal  0.645269 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2098  cobalamin B12-binding domain protein  26.56 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21070  cobalamin B12-binding domain protein  28.71 
 
 		 730 aa  41.2  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2142  corrinoid protein  30.37 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0142295  normal  0.350048 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  27.78 
 
 		 1208 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2144  methionine synthase  27.27 
 
 		 1243 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.212238  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  29.31 
 
 		 1178 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2472  cobalamin B12-binding domain protein  26.52 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1501  dimethylamine corrinoid protein  26.27 
 
 		 208 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000126339  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  32.2 
 
 		 1223 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  26.61 
 
 		 804 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1085  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.14 
 
 		 265 aa  40.8  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>