More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1328 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0990  AMP-dependent synthetase and ligase  75.37 
 
 
670 aa  1057    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.274147  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2583  AMP-dependent synthetase and ligase  85.01 
 
 
674 aa  1212    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319993  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2056  AMP-dependent synthetase and ligase  75 
 
 
663 aa  1046    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1328  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
694 aa  1418    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1427  AMP-dependent synthetase and ligase  45.8 
 
 
663 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0770781  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1441  AMP-dependent synthetase and ligase  41.35 
 
 
642 aa  555  1e-157  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.692743  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2222  AMP-dependent synthetase and ligase  40.59 
 
 
641 aa  535  1e-150  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2292  acetate--CoA ligase (acetyl-CoA synthase)  39.79 
 
 
646 aa  519  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.365139  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2609  putative acetoacetyl-CoA synthase  39.94 
 
 
646 aa  519  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1808  AMP-dependent synthetase and ligase  39.35 
 
 
646 aa  520  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00809823  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2806  putative acetoacetyl-CoA synthase  40.18 
 
 
646 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.846139  hitchhiker  0.00209693 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2554  acetoacetyl-CoA synthase, putative  39.79 
 
 
646 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2376  acetoacetyl-CoA synthase  39.5 
 
 
646 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.381353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2333  acetate--CoA ligase (acetyl-CoA synthase)  39.79 
 
 
646 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2553  acetoacetyl-CoA synthase  39.5 
 
 
646 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2566  putative acetoacetyl-CoA synthase  39.79 
 
 
646 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000120954 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2517  putative acetoacetyl-CoA synthase  40.32 
 
 
646 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  38.8 
 
 
646 aa  512  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0926585  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  40.15 
 
 
650 aa  503  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  40.09 
 
 
650 aa  504  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7155  AMP-dependent synthetase and ligase  38.71 
 
 
668 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  43.29 
 
 
649 aa  486  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  39.14 
 
 
670 aa  485  1e-135  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2113  AMP-dependent synthetase and ligase  38.33 
 
 
643 aa  479  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  37.85 
 
 
653 aa  477  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  41.49 
 
 
638 aa  477  1e-133  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  41.6 
 
 
655 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  41.6 
 
 
655 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  38.83 
 
 
644 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3467  AMP-dependent synthetase and ligase  38.21 
 
 
670 aa  466  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  37.32 
 
 
659 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  37.77 
 
 
660 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  38.25 
 
 
660 aa  464  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  41.88 
 
 
667 aa  465  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  41.3 
 
 
666 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  41.03 
 
 
664 aa  461  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  37.3 
 
 
649 aa  456  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  40.85 
 
 
651 aa  455  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  40.67 
 
 
656 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  40.85 
 
 
657 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0866  AMP-dependent synthetase and ligase  34.92 
 
 
641 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0265876 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  39.86 
 
 
638 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  40.77 
 
 
666 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  41.3 
 
 
667 aa  449  1e-125  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  40.68 
 
 
667 aa  452  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  40.1 
 
 
667 aa  452  1e-125  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  39.46 
 
 
655 aa  449  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  36.57 
 
 
632 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  37.96 
 
 
639 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  36.73 
 
 
632 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  39.22 
 
 
648 aa  447  1.0000000000000001e-124  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  40.58 
 
 
649 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  36.57 
 
 
631 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  41.03 
 
 
661 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  37.55 
 
 
655 aa  446  1.0000000000000001e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  39.27 
 
 
666 aa  446  1.0000000000000001e-124  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0526  acetate/CoA ligase  37.91 
 
 
649 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  36.67 
 
 
631 aa  445  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  37.28 
 
 
636 aa  443  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  40.27 
 
 
668 aa  440  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  39.73 
 
 
661 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  36.97 
 
 
636 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  35.82 
 
 
664 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  40.61 
 
 
652 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  35.82 
 
 
664 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1099  acetate/CoA ligase  39.7 
 
 
700 aa  439  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1306  acetate/CoA ligase  37.7 
 
 
664 aa  437  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  39.36 
 
 
715 aa  436  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  36.5 
 
 
656 aa  438  1e-121  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0513  acetate/CoA ligase  40.24 
 
 
651 aa  436  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3168  acetate/CoA ligase  41.26 
 
 
670 aa  435  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0566588 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  36.33 
 
 
636 aa  434  1e-120  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  35.82 
 
 
655 aa  434  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  36.51 
 
 
639 aa  435  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  39.97 
 
 
663 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18230  acetyl-coenzyme A synthetase  39.49 
 
 
646 aa  431  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.276557  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  38.81 
 
 
661 aa  429  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  37.87 
 
 
656 aa  429  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  37.54 
 
 
658 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5331  acetate/CoA ligase  39.64 
 
 
656 aa  432  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.151979 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  37.37 
 
 
658 aa  429  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  38.76 
 
 
657 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  38.46 
 
 
670 aa  426  1e-118  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  40.92 
 
 
644 aa  429  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  37.36 
 
 
654 aa  427  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  36.07 
 
 
655 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  39.22 
 
 
656 aa  428  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0211  acetate/CoA ligase  40.91 
 
 
659 aa  428  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0067  acetate/CoA ligase  38.78 
 
 
651 aa  425  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118091  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  37.94 
 
 
666 aa  424  1e-117  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3916  acetate/CoA ligase  38.7 
 
 
648 aa  424  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  38.16 
 
 
663 aa  424  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  38.85 
 
 
658 aa  423  1e-117  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  35.34 
 
 
657 aa  423  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  39.53 
 
 
657 aa  425  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  39.07 
 
 
664 aa  424  1e-117  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  36.63 
 
 
658 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  38.86 
 
 
660 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  38.68 
 
 
657 aa  425  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  38.86 
 
 
660 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.151369 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>