More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1306 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2845  acetate/CoA ligase  56.63 
 
 
671 aa  729    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0572041  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  52.43 
 
 
648 aa  656    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  50.38 
 
 
658 aa  647    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  51.27 
 
 
660 aa  679    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0976  acetate/CoA ligase  75.87 
 
 
659 aa  1035    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1306  acetate/CoA ligase  100 
 
 
664 aa  1352    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  51.13 
 
 
649 aa  670    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  51.58 
 
 
656 aa  665    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  51.38 
 
 
644 aa  637    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3167  acetate/CoA ligase  74.55 
 
 
658 aa  1028    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.678414  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  50.52 
 
 
649 aa  656    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3169  acetate/CoA ligase  64.97 
 
 
662 aa  852    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745528  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  51.14 
 
 
643 aa  662    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2167  AMP-dependent synthetase and ligase  59.79 
 
 
665 aa  766    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1099  acetate/CoA ligase  75.31 
 
 
700 aa  1001    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  61.23 
 
 
652 aa  802    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0978  acetate/CoA ligase  67.34 
 
 
658 aa  874    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  51.58 
 
 
660 aa  655    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  49.39 
 
 
660 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  49.47 
 
 
655 aa  631  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1140  acetate/CoA ligase  50 
 
 
665 aa  630  1e-179  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224002  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  48.87 
 
 
660 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  48.39 
 
 
663 aa  625  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  48.58 
 
 
660 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  49.55 
 
 
656 aa  624  1e-177  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  50.22 
 
 
651 aa  623  1e-177  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  49.63 
 
 
661 aa  624  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  49.93 
 
 
656 aa  620  1e-176  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  47.98 
 
 
660 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0211  acetate/CoA ligase  51.67 
 
 
659 aa  619  1e-176  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  48.96 
 
 
715 aa  620  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1068  acetyl-coenzyme A synthetase  47.91 
 
 
713 aa  621  1e-176  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0382222  normal  0.444835 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2132  acetate/CoA ligase  50.37 
 
 
661 aa  621  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000882017  normal  0.24992 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  48.56 
 
 
658 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  50.08 
 
 
657 aa  618  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  48.27 
 
 
653 aa  615  1e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  50.07 
 
 
655 aa  616  1e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  48.64 
 
 
658 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  49.77 
 
 
661 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  49.18 
 
 
656 aa  615  9.999999999999999e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0513  acetate/CoA ligase  48.69 
 
 
651 aa  612  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  48.94 
 
 
655 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  48.94 
 
 
655 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  49.33 
 
 
657 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  47.6 
 
 
658 aa  609  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  49.31 
 
 
666 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  49.33 
 
 
655 aa  611  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  50.15 
 
 
673 aa  610  1e-173  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  50.71 
 
 
661 aa  611  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  49.31 
 
 
660 aa  609  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  48.72 
 
 
658 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3168  acetate/CoA ligase  50.15 
 
 
670 aa  611  1e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0566588 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  49.31 
 
 
660 aa  609  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  49.47 
 
 
667 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  48.49 
 
 
652 aa  607  9.999999999999999e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4841  acetate/CoA ligase  50.23 
 
 
653 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5425  acetyl-CoA synthetase  49.09 
 
 
663 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  46.74 
 
 
664 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  46.91 
 
 
657 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0346  acetyl-CoA synthetase  49.85 
 
 
664 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  49.55 
 
 
661 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  45.65 
 
 
657 aa  600  1e-170  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  48.16 
 
 
664 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  46.79 
 
 
657 aa  599  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  48.88 
 
 
657 aa  601  1e-170  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1380  acetyl-CoA synthetase  47.93 
 
 
653 aa  599  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.110945  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  48.73 
 
 
664 aa  601  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0526  acetate/CoA ligase  48.85 
 
 
649 aa  602  1e-170  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  49.11 
 
 
661 aa  602  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1499  acetate/CoA ligase  48.93 
 
 
661 aa  597  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00738243  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  46.1 
 
 
666 aa  598  1e-169  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  48.05 
 
 
657 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  48.12 
 
 
652 aa  597  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  49.17 
 
 
655 aa  595  1e-169  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12630  acetyl-coenzyme A synthetase  47.42 
 
 
658 aa  597  1e-169  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406293  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  45.5 
 
 
667 aa  596  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  48.04 
 
 
650 aa  593  1e-168  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  48.46 
 
 
654 aa  594  1e-168  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3358  AMP-dependent synthetase and ligase  46.57 
 
 
688 aa  593  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  48.71 
 
 
649 aa  593  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13698  acetyl-CoA synthetase  48.93 
 
 
651 aa  594  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.037981 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1576  acetate/CoA ligase  47.26 
 
 
648 aa  593  1e-168  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000882243  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18230  acetyl-coenzyme A synthetase  48.33 
 
 
646 aa  592  1e-168  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.276557  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  48 
 
 
674 aa  590  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  45.44 
 
 
667 aa  591  1e-167  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  47.2 
 
 
663 aa  590  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  47.3 
 
 
680 aa  590  1e-167  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  47.74 
 
 
638 aa  592  1e-167  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0726  acetate/CoA ligase  47.12 
 
 
655 aa  588  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  47.24 
 
 
651 aa  587  1e-166  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  45.69 
 
 
667 aa  588  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  47.63 
 
 
649 aa  582  1.0000000000000001e-165  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  47.47 
 
 
654 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5331  acetate/CoA ligase  47.26 
 
 
656 aa  585  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.151979 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01080  acetyl-coenzyme A synthetase  51.05 
 
 
650 aa  582  1.0000000000000001e-165  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1019  acetate--CoA ligase  48.4 
 
 
647 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  46.9 
 
 
670 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1708  acetyl-CoA synthetase  47.22 
 
 
657 aa  579  1e-164  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.224049  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  47.58 
 
 
666 aa  579  1e-164  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4507  acetate/CoA ligase  48.25 
 
 
663 aa  581  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424676  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>