More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2167 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1306  acetate/CoA ligase  59.79 
 
 
664 aa  777    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2845  acetate/CoA ligase  75.34 
 
 
671 aa  1017    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0572041  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1099  acetate/CoA ligase  61.36 
 
 
700 aa  792    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2167  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
665 aa  1365    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0978  acetate/CoA ligase  56.99 
 
 
658 aa  713    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3358  AMP-dependent synthetase and ligase  52.11 
 
 
688 aa  697    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  52.01 
 
 
652 aa  654    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0976  acetate/CoA ligase  58.45 
 
 
659 aa  773    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3167  acetate/CoA ligase  58.05 
 
 
658 aa  764    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.678414  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1068  acetyl-coenzyme A synthetase  54.67 
 
 
713 aa  729    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0382222  normal  0.444835 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3169  acetate/CoA ligase  55.56 
 
 
662 aa  694    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745528  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  47.95 
 
 
649 aa  619  1e-176  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  47.83 
 
 
656 aa  598  1e-169  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  47.95 
 
 
649 aa  596  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  46.29 
 
 
660 aa  591  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  46.85 
 
 
643 aa  588  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  48.11 
 
 
648 aa  586  1e-166  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  46.48 
 
 
660 aa  578  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1140  acetate/CoA ligase  46.79 
 
 
665 aa  578  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224002  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  47.57 
 
 
667 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  46.91 
 
 
644 aa  570  1e-161  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  46.81 
 
 
638 aa  571  1e-161  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  46.29 
 
 
651 aa  569  1e-161  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  46.49 
 
 
668 aa  566  1e-160  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  46.78 
 
 
666 aa  565  1e-160  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  45.84 
 
 
658 aa  567  1e-160  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  46.76 
 
 
666 aa  567  1e-160  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  46.54 
 
 
656 aa  562  1.0000000000000001e-159  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  45.76 
 
 
655 aa  564  1.0000000000000001e-159  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12630  acetyl-coenzyme A synthetase  44.82 
 
 
658 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406293  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  45.89 
 
 
661 aa  559  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  45.35 
 
 
656 aa  557  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  45.16 
 
 
663 aa  558  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  45.88 
 
 
656 aa  557  1e-157  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  46.55 
 
 
670 aa  555  1e-156  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  43.9 
 
 
657 aa  553  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  44.28 
 
 
653 aa  553  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  45.47 
 
 
657 aa  555  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  44.93 
 
 
715 aa  552  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  44.94 
 
 
664 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  44.64 
 
 
664 aa  554  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  45.48 
 
 
657 aa  550  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  44.03 
 
 
664 aa  551  1e-155  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  45.25 
 
 
655 aa  548  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  44.93 
 
 
661 aa  547  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1576  acetate/CoA ligase  44.07 
 
 
648 aa  546  1e-154  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000882243  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  45.37 
 
 
649 aa  546  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  45.86 
 
 
661 aa  548  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  42.88 
 
 
660 aa  547  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  44.87 
 
 
667 aa  547  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  44.16 
 
 
652 aa  546  1e-154  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  44.66 
 
 
650 aa  544  1e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  44.8 
 
 
651 aa  545  1e-153  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  43.14 
 
 
638 aa  543  1e-153  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  43.59 
 
 
652 aa  542  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  42.64 
 
 
660 aa  545  1e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0526  acetate/CoA ligase  45.7 
 
 
649 aa  542  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0513  acetate/CoA ligase  45.44 
 
 
651 aa  540  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  44.68 
 
 
658 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  44.18 
 
 
655 aa  541  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5425  acetyl-CoA synthetase  44.51 
 
 
663 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  43.88 
 
 
666 aa  537  1e-151  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  43.57 
 
 
658 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  42.49 
 
 
660 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  42.24 
 
 
664 aa  537  1e-151  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  44.73 
 
 
661 aa  535  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0211  acetate/CoA ligase  45.48 
 
 
659 aa  537  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  42.34 
 
 
660 aa  538  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  42.38 
 
 
657 aa  537  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  44.87 
 
 
656 aa  536  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  44.1 
 
 
680 aa  533  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  44.39 
 
 
655 aa  533  1e-150  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  43.57 
 
 
658 aa  535  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  47.65 
 
 
654 aa  534  1e-150  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4841  acetate/CoA ligase  45.32 
 
 
653 aa  532  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  45.72 
 
 
661 aa  533  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  43.79 
 
 
657 aa  535  1e-150  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  42.08 
 
 
667 aa  535  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0067  acetate/CoA ligase  45.4 
 
 
651 aa  529  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118091  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2132  acetate/CoA ligase  43.44 
 
 
661 aa  530  1e-149  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000882017  normal  0.24992 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  44.84 
 
 
674 aa  530  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  42.47 
 
 
667 aa  531  1e-149  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1380  acetyl-CoA synthetase  44.97 
 
 
653 aa  530  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.110945  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0611  acetate/CoA ligase  44.68 
 
 
667 aa  529  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0726  acetate/CoA ligase  44.36 
 
 
655 aa  530  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  45.2 
 
 
632 aa  529  1e-149  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  42.73 
 
 
663 aa  531  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1499  acetate/CoA ligase  46.27 
 
 
661 aa  530  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00738243  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  42.28 
 
 
660 aa  531  1e-149  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  43.63 
 
 
658 aa  532  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  44.34 
 
 
636 aa  528  1e-148  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  44.2 
 
 
636 aa  528  1e-148  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1019  acetate--CoA ligase  44.11 
 
 
647 aa  527  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0706  acetate/CoA ligase  45.63 
 
 
663 aa  528  1e-148  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  42.36 
 
 
666 aa  526  1e-148  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  43.77 
 
 
655 aa  527  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  45.15 
 
 
645 aa  525  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  44.5 
 
 
654 aa  528  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  45.18 
 
 
652 aa  525  1e-148  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  43.77 
 
 
655 aa  527  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>