More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3937 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3937  pyrimidine utilization protein C  100 
 
 		 130 aa  270  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166806  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00762  endoribonuclease L-PSP family protein  65.08 
 
 		 127 aa  181  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1821  endoribonuclease L-PSP  65.08 
 
 		 128 aa  179  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623023  normal  0.012204 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1077  Endoribonuclease L-PSP  68.25 
 
 		 130 aa  178  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0180844  normal  0.0247338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1155  endoribonuclease L-PSP family protein  65.08 
 
 		 127 aa  176  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1582  endoribonuclease L-PSP  66.67 
 
 		 128 aa  176  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1736  endoribonuclease L-PSP  66.67 
 
 		 130 aa  173  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2055  Endoribonuclease L-PSP  66.67 
 
 		 130 aa  173  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120204 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01013  hypothetical protein  62.2 
 
 		 128 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2115  rutC protein  62.2 
 
 		 128 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2632  Endoribonuclease L-PSP  62.2 
 
 		 128 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.763803  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1125  rutC protein  62.2 
 
 		 128 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0997  endoribonuclease L-PSP  63.49 
 
 		 127 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01020  hypothetical protein  62.2 
 
 		 128 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2585  endoribonuclease L-PSP  62.2 
 
 		 128 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0607666 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1128  rutC protein  62.2 
 
 		 128 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4840  Endoribonuclease L-PSP  62.02 
 
 		 130 aa  171  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1523  endoribonuclease L-PSP  62.2 
 
 		 128 aa  171  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.383106 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3980  endoribonuclease L-PSP  61.9 
 
 		 129 aa  167  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 124 aa  100  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  38.52 
 
 		 127 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 126 aa  96.7  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 124 aa  95.1  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  37.7 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  37.7 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 126 aa  94.4  5e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 125 aa  90.5  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  39.66 
 
 		 125 aa  89.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 125 aa  87.8  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  36.07 
 
 		 124 aa  87.4  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  41.23 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 124 aa  85.9  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 123 aa  86.7  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 		 129 aa  85.5  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 126 aa  84  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  33.6 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  38.94 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  34.43 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4261  endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 125 aa  80.1  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  29.84 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  29.92 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4890  endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  33.6 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  37 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 127 aa  76.6  0.00000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  29.84 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4710  endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0704377  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  31.45 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  35.54 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3510  YjgF-family lipoprotein  32.48 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.14391 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  32.54 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  33.86 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  34.48 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  33.86 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  34.4 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06131  YjgF family translation initiation inhibitor  33.06 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.479171 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  36.59 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1888  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2337  putative endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0496  endoribonuclease L-PSP  33.6 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0676524  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>