More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1952 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1952  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
708 aa  1415    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0523217 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  37.86 
 
 
657 aa  422  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  37.44 
 
 
656 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.99 
 
 
657 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  36.39 
 
 
657 aa  395  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.16 
 
 
654 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  35.95 
 
 
657 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  36.43 
 
 
660 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.36 
 
 
662 aa  372  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.34 
 
 
570 aa  355  2e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  36.56 
 
 
576 aa  349  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  36.56 
 
 
575 aa  346  8e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  35.18 
 
 
729 aa  341  2.9999999999999998e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  35.73 
 
 
675 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  36.33 
 
 
583 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  36.24 
 
 
586 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.86 
 
 
703 aa  337  3.9999999999999995e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  35.69 
 
 
618 aa  336  7e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  37.03 
 
 
579 aa  336  7e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  36.63 
 
 
671 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  35.4 
 
 
632 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  35.4 
 
 
632 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  35.4 
 
 
632 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3821  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.73 
 
 
675 aa  335  2e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  36.58 
 
 
579 aa  333  5e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  35.06 
 
 
583 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  36.4 
 
 
579 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3905  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.56 
 
 
675 aa  332  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  34.9 
 
 
630 aa  332  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  35.8 
 
 
577 aa  331  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  37.61 
 
 
575 aa  331  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  34.9 
 
 
630 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  35.06 
 
 
580 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3765  peptidoglycan glycosyltransferase  40.38 
 
 
675 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870412  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  34.96 
 
 
690 aa  330  7e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  35.34 
 
 
594 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  35.1 
 
 
622 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.19 
 
 
654 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  35.52 
 
 
594 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  35.52 
 
 
594 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  35.37 
 
 
596 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  35.3 
 
 
613 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  34.88 
 
 
578 aa  328  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  35.48 
 
 
613 aa  327  4.0000000000000003e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  35.34 
 
 
594 aa  327  5e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  35.34 
 
 
594 aa  327  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  34.71 
 
 
631 aa  327  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  35.34 
 
 
594 aa  327  5e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  35.34 
 
 
594 aa  327  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  35.28 
 
 
553 aa  323  5e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  36.12 
 
 
597 aa  323  6e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  35.11 
 
 
553 aa  322  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  34.7 
 
 
601 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  34.53 
 
 
582 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  31.58 
 
 
695 aa  322  9.999999999999999e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.78 
 
 
571 aa  321  3e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  32.45 
 
 
705 aa  320  3.9999999999999996e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  34.37 
 
 
578 aa  320  5e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  35.37 
 
 
581 aa  320  6e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  37.28 
 
 
580 aa  319  9e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.66 
 
 
577 aa  319  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2199  peptidoglycan synthetase FtsI  37.2 
 
 
578 aa  318  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  34.47 
 
 
582 aa  317  4e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  34.17 
 
 
582 aa  316  8e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.7 
 
 
582 aa  316  9e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  34.6 
 
 
578 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  35.7 
 
 
582 aa  316  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  33.73 
 
 
578 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2650  peptidoglycan synthetase FtsI precursor (peptidoglycan glycosyltransferase 3) (penicillin-binding protein 3)  35.22 
 
 
579 aa  315  1.9999999999999998e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  34.04 
 
 
578 aa  314  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  36.49 
 
 
653 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.51 
 
 
614 aa  313  7.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  35.45 
 
 
607 aa  313  7.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
710 aa  313  9e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  34.84 
 
 
582 aa  312  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  34.96 
 
 
580 aa  312  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  35.04 
 
 
614 aa  311  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  33.91 
 
 
578 aa  311  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  34.9 
 
 
577 aa  311  4e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2097  peptidoglycan glycosyltransferase  36.24 
 
 
575 aa  310  5e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0375891  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  33.87 
 
 
631 aa  310  6.999999999999999e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1985  penicillin-binding protein 3  34.01 
 
 
580 aa  310  8e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  35 
 
 
570 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  33.87 
 
 
614 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  33.98 
 
 
580 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  32.65 
 
 
586 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  34.53 
 
 
548 aa  308  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  34.53 
 
 
552 aa  308  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1337  penicillin-binding protein  33.87 
 
 
614 aa  308  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  33.87 
 
 
614 aa  308  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2557  penicillin-binding protein  33.87 
 
 
614 aa  308  3e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  33.87 
 
 
614 aa  308  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  33.87 
 
 
614 aa  308  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  33.62 
 
 
578 aa  308  3e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  33.87 
 
 
614 aa  308  3e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  34.33 
 
 
587 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  33.87 
 
 
614 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  33.87 
 
 
621 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 
624 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.05 
 
 
621 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>