122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1294 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1294  Fe-S oxidoreductase-like protein  100 
 
 		 668 aa  1368    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.439517  normal  0.391395 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1693  radical SAM family protein  26.37 
 
 		 467 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1699  Radical SAM domain protein  23.91 
 
 		 424 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000206113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  23.53 
 
 		 424 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0920  radical SAM domain-containing protein  25.51 
 
 		 451 aa  76.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3236  Radical SAM domain protein  26.13 
 
 		 462 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1999  radical SAM domain-containing protein  23.49 
 
 		 506 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0779114  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3608  radical SAM domain-containing protein  27.83 
 
 		 459 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2566  radical SAM domain-containing protein  21.72 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.162584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1024  Radical SAM domain protein  23.62 
 
 		 467 aa  63.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0238  radical SAM domain-containing protein  23.76 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140637  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2195  Radical SAM domain protein  24.92 
 
 		 460 aa  60.1  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.565929  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  25.52 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1503  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.75 
 
 		 478 aa  56.6  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0448289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  25.37 
 
 		 529 aa  56.6  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 441 aa  56.6  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  29.88 
 
 		 518 aa  56.2  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0710  radical SAM domain-containing protein  23.92 
 
 		 516 aa  55.5  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0893  Radical SAM domain protein  25.51 
 
 		 681 aa  54.7  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.878222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1708  Radical SAM domain protein  30.43 
 
 		 473 aa  54.3  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.995289  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1320  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.57 
 
 		 472 aa  53.5  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0069427  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2203  cobalamin B12-binding domain protein  28.1 
 
 		 475 aa  53.5  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2351  Radical SAM domain protein  29.66 
 
 		 470 aa  53.5  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1690  radical SAM family protein  30.08 
 
 		 428 aa  52.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4478  radical SAM family protein  28.28 
 
 		 554 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140837  normal  0.22726 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1895  radical SAM domain-containing protein  29.85 
 
 		 476 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2116  Radical SAM domain protein  29.66 
 
 		 475 aa  53.1  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000436427  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1034  Radical SAM domain protein  30.25 
 
 		 474 aa  52.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0799  Elongator protein 3  22.49 
 
 		 526 aa  52  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2462  radical SAM domain-containing protein  29.66 
 
 		 480 aa  52  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0838  Radical SAM domain protein  29.27 
 
 		 472 aa  51.6  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.66 
 
 		 479 aa  51.6  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0840  cobalamin B12-binding domain protein  25.55 
 
 		 590 aa  51.6  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3359  Radical SAM domain protein  23.62 
 
 		 539 aa  50.8  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1598  Radical SAM domain protein  28.46 
 
 		 477 aa  50.8  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0241  BchE/P-methylase family protein  27.64 
 
 		 430 aa  50.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.222091  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1258  radical SAM family protein  27.34 
 
 		 529 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1134  putative Fe-S oxidoreductase  25 
 
 		 425 aa  49.7  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1626  Radical SAM domain protein  29.1 
 
 		 444 aa  49.7  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0832  Radical SAM domain protein  28.91 
 
 		 527 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1466  Radical SAM domain protein  31.11 
 
 		 467 aa  50.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0159808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0201  radical SAM domain-containing protein  24.72 
 
 		 484 aa  48.9  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1435  radical SAM domain-containing protein  22.37 
 
 		 631 aa  48.9  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0826343 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3611  radical SAM domain-containing protein  27.64 
 
 		 429 aa  48.9  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1516  Radical SAM domain protein  31.11 
 
 		 469 aa  48.9  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0112694  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2963  Radical SAM domain protein  20.92 
 
 		 522 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1180  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  22.44 
 
 		 647 aa  48.5  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0047  Fe-S oxidoreductase  22.44 
 
 		 647 aa  48.5  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0033  B12-binding/radical SAM domain-containing protein  22.44 
 
 		 647 aa  48.5  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0033  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  22.44 
 
 		 647 aa  48.5  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16191  Fe-S oxidoreductase  26.21 
 
 		 544 aa  48.5  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  26.47 
 
 		 428 aa  48.5  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0027  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  22.44 
 
 		 651 aa  48.1  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1460  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  22.44 
 
 		 651 aa  48.1  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  47.37 
 
 		 369 aa  48.1  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  47.37 
 
 		 369 aa  48.1  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3195  Radical SAM domain protein  22.9 
 
 		 552 aa  48.1  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554212 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0931  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.2 
 
 		 465 aa  47.8  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.988397  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25170  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG, TIGR01125  28.67 
 
 		 480 aa  47.8  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  47.37 
 
 		 369 aa  48.1  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4173  radical SAM domain-containing protein  21.77 
 
 		 513 aa  47.8  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1318  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.63 
 
 		 471 aa  47.8  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1602  radical SAM family Fe-S protein  24.31 
 
 		 487 aa  47.8  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  25.7 
 
 		 405 aa  47.4  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1644  radical SAM domain-containing protein  31.36 
 
 		 468 aa  47.4  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1535  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  22.05 
 
 		 651 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1125  Fe-S oxidoreductase  43.24 
 
 		 555 aa  47.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0407  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.69 
 
 		 466 aa  47  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3370  cobalamin B12-binding  26 
 
 		 618 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.818313  normal  0.0333946 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2074  radical SAM binding protein  27.32 
 
 		 598 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16781  Fe-S oxidoreductase  28.12 
 
 		 539 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0686  radical SAM domain-containing protein  41.46 
 
 		 378 aa  46.6  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2435  radical SAM domain-containing protein  24.76 
 
 		 524 aa  47  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000772503  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2283  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  30.95 
 
 		 442 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135903  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6080  radical SAM domain-containing protein  31.03 
 
 		 527 aa  47.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853304  hitchhiker  0.00330735 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1617  Radical SAM domain protein  31.97 
 
 		 469 aa  46.6  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0136432  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0030  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  26.67 
 
 		 647 aa  46.2  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0419  RNA modification protein  28.89 
 
 		 456 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.752325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0679  radical SAM domain-containing protein  25.18 
 
 		 532 aa  46.6  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.538704  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1735  cobalamin B12-binding domain protein  34.12 
 
 		 590 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1191  radical SAM domain-containing protein  35.16 
 
 		 551 aa  46.2  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000804505  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1062  radical SAM domain-containing protein  39.02 
 
 		 372 aa  46.2  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2939  radical SAM domain-containing protein  30.2 
 
 		 521 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.379543 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0502  hypothetical protein  29.9 
 
 		 433 aa  46.2  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1205  RNA modification protein  29.37 
 
 		 595 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00267373  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1264  radical SAM domain-containing protein  35.16 
 
 		 551 aa  46.2  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0215  Radical SAM domain protein  27.12 
 
 		 483 aa  46.2  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  27.46 
 
 		 377 aa  45.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1738  cobalamin B12-binding/radical SAM domain-containing Fe-S oxidoreductase  25.95 
 
 		 521 aa  45.4  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2035  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.27 
 
 		 518 aa  45.4  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1590  Fe-S oxidoreductase  20.83 
 
 		 539 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00141696  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1302  Radical SAM domain protein  30.43 
 
 		 540 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0143596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05330  Fe-S oxidoreductase  21.43 
 
 		 495 aa  45.4  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23771  Fe-S oxidoreductase  28.71 
 
 		 538 aa  45.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0282707 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2393  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 490 aa  45.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.386797  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2416  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 469 aa  45.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2302  Radical SAM domain protein  34.48 
 
 		 471 aa  45.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000207035  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 		 433 aa  44.7  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0308  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.14 
 
 		 529 aa  44.7  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17011  Fe-S oxidoreductase  26.8 
 
 		 539 aa  45.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>