More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1568 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1568  ribosome small subunit-dependent GTPase A  100 
 
 		 321 aa  658    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  37.22 
 
 		 354 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  37.22 
 
 		 354 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  37.46 
 
 		 354 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  36.59 
 
 		 354 aa  209  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  37.13 
 
 		 347 aa  206  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0386  ribosome-associated GTPase  35.51 
 
 		 349 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  35.51 
 
 		 354 aa  203  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0630  GTPase EngC  38.18 
 
 		 340 aa  203  4e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000140785  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  36.71 
 
 		 353 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002251  ribosome small subunit-stimulated GTPase EngC  38.13 
 
 		 354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00154868  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  35.52 
 
 		 343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0475  ribosome-associated GTPase  37.25 
 
 		 349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  37.29 
 
 		 352 aa  200  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  36.03 
 
 		 354 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  36.15 
 
 		 350 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  36.03 
 
 		 354 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  36.03 
 
 		 354 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  36.03 
 
 		 340 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  35.91 
 
 		 350 aa  199  7e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  35.91 
 
 		 350 aa  199  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  35.91 
 
 		 350 aa  199  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.4 
 
 		 350 aa  198  9e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  35.4 
 
 		 350 aa  198  9e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  35.4 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  35.4 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  35.4 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  35.4 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  35.4 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  35.4 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  35.59 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3482  ribosome-associated GTPase  35.54 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.845882  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3754  ribosome-associated GTPase  35.81 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  36.66 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  35.09 
 
 		 350 aa  196  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00113  ribosome-associated GTPase  37.46 
 
 		 372 aa  196  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0423  ribosome-associated GTPase  36.39 
 
 		 349 aa  196  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000942768  hitchhiker  0.000000790004 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  35.02 
 
 		 352 aa  195  7e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  35.12 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3932  ribosome-associated GTPase  36.15 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  38.05 
 
 		 347 aa  192  5e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  36.36 
 
 		 350 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  36.36 
 
 		 350 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  36.36 
 
 		 350 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1503  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.33 
 
 		 334 aa  192  9e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  36.36 
 
 		 350 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  35.79 
 
 		 343 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  36.05 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  34.78 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  36.05 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  36.05 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  34.73 
 
 		 353 aa  187  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  34.69 
 
 		 344 aa  187  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0347  ribosome-associated GTPase  35.25 
 
 		 358 aa  186  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0044619  unclonable  0.00000256254 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  34.9 
 
 		 354 aa  186  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0537  hypothetical protein  36.82 
 
 		 299 aa  186  6e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1078  ribosome-associated GTPase  37.11 
 
 		 289 aa  186  7e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2742  ribosome-associated GTPase  34.76 
 
 		 353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201123  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  34.88 
 
 		 351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  34.67 
 
 		 343 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  34.67 
 
 		 343 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  33.23 
 
 		 343 aa  182  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4380  ribosome-associated GTPase  32.88 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2668  hypothetical protein  33.44 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2799  hypothetical protein  32.82 
 
 		 325 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0626  ribosome-associated GTPase  32.51 
 
 		 343 aa  176  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1269  ribosome-associated GTPase  37.58 
 
 		 340 aa  172  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65420  ribosome-associated GTPase  33.45 
 
 		 339 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.672753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5681  ribosome-associated GTPase  33.11 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1850  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.15 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.055373 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  33.23 
 
 		 351 aa  165  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  34.84 
 
 		 289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3154  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.72 
 
 		 346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000496758 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2576  ribosome-associated GTPase  32.51 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2914  putative ATP/GTP-binding protein  34.77 
 
 		 304 aa  156  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.589504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1553  putative sigma-54 interacting protein  30.62 
 
 		 367 aa  155  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818297  normal  0.17654 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.54 
 
 		 319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0394  ribosome-associated GTPase  35.43 
 
 		 314 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10588  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0237  ribosome-associated GTPase  35.43 
 
 		 314 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2537  ribosome-associated GTPase  35.43 
 
 		 314 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.394286  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0910  ribosome-associated GTPase  35.43 
 
 		 314 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0882  ribosome-associated GTPase  33.23 
 
 		 315 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.493781 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0940  ribosome-associated GTPase  35.43 
 
 		 318 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0176411 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1735  GTPase EngC  30.9 
 
 		 367 aa  151  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.216603  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0811  ribosome-associated GTPase  33.23 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0905  ribosome-associated GTPase  34.97 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569285  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2850  ribosome-associated GTPase  35.88 
 
 		 314 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2910  ribosome-associated GTPase  35.88 
 
 		 314 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2960  ribosome-associated GTPase  35.1 
 
 		 314 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804771  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2227  ribosome-associated GTPase  36.03 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1035  ribosome-associated GTPase  33.44 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1668  ribosome-associated GTPase  35.64 
 
 		 316 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34029  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0776  ribosome-associated GTPase  32.55 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0597  ribosome-associated GTPase  34.08 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1076  ribosome-associated GTPase  34.08 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4190  ribosome-associated GTPase  34.01 
 
 		 313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.503952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0956  ribosome-associated GTPase  34.01 
 
 		 313 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0952  ribosome-associated GTPase  34.01 
 
 		 313 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.47 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0523  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.56 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.22589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>