More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1812 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1812  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
141 aa  278  1e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122614  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3444  transcriptional regulator, ArsR family  52.38 
 
 
132 aa  123  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3443  transcriptional regulator, ArsR family  50.79 
 
 
133 aa  120  7e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3344  transcriptional regulator, MarR family  52.38 
 
 
130 aa  120  7e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0667  putative transcriptional regulator, ArsR family  53.1 
 
 
128 aa  114  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1245  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.331226 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  37.61 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  32.8 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2845  transcriptional regulator, ArsR family  39.8 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 
120 aa  62.8  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2563  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 
112 aa  60.5  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000881945  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  33.93 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  37.23 
 
 
112 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  36.23 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
116 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 
118 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  43.08 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  39.73 
 
 
128 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
115 aa  57.4  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3096  transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 
121 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465743  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  39.13 
 
 
94 aa  57.4  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  40.62 
 
 
94 aa  57.4  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  33.94 
 
 
337 aa  57  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1301  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 
112 aa  57  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  46.03 
 
 
125 aa  57  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
123 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
317 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
258 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 
125 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 
125 aa  56.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 
125 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  37.33 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3682  regulatory protein, ArsR  42.53 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687886  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
123 aa  57  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  32.91 
 
 
95 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  40.79 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  36.78 
 
 
104 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.19 
 
 
113 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  38.94 
 
 
129 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
125 aa  55.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  45.95 
 
 
173 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  34.72 
 
 
117 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  44.44 
 
 
119 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  36.56 
 
 
125 aa  55.5  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 
122 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 
95 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 
120 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2434  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 
111 aa  55.1  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  40.3 
 
 
124 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  40.3 
 
 
124 aa  54.7  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2584  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
125 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  36.47 
 
 
125 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 
116 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
125 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
125 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
125 aa  54.7  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
125 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 
125 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
125 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 
125 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 
116 aa  54.7  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0187  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 
127 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6188  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
126 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  45 
 
 
112 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
90 aa  53.9  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1224  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 
118 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
125 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
125 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  40.62 
 
 
125 aa  53.9  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5319  regulatory protein, ArsR  44.09 
 
 
127 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5692  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 
127 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
125 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 
124 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  34.19 
 
 
119 aa  54.3  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
125 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  39.13 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
110 aa  53.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 
120 aa  53.9  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1492  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
127 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 
127 aa  53.9  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  34.44 
 
 
121 aa  53.5  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
114 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
132 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  45.31 
 
 
123 aa  53.5  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  44.74 
 
 
123 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 
117 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3238  Fis family transcriptional regulator  42.47 
 
 
127 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3738  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
116 aa  53.5  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  37.93 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  40.26 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>