More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2263 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0249  CheA signal transduction histidine kinase  49.13 
 
 		 649 aa  639    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818648  normal  0.0240332 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2263  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 741 aa  1419    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0131466 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0942  CheA signal transduction histidine kinase  50.14 
 
 		 670 aa  618  1e-175  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2888  CheA signal transduction histidine kinase  44.77 
 
 		 671 aa  543  1e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0958  CheA signal transduction histidine kinase  51.23 
 
 		 1286 aa  392  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 691 aa  383  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 713 aa  385  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 675 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1856  CheA signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 658 aa  364  4e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 666 aa  362  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 660 aa  360  4e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 681 aa  355  2e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  30.35 
 
 		 677 aa  354  2.9999999999999997e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  30.35 
 
 		 692 aa  352  2e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0943  CheA signal transduction histidine kinases  33.11 
 
 		 660 aa  348  2e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 770 aa  345  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 697 aa  343  9e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  30.44 
 
 		 673 aa  334  4e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 696 aa  330  6e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 653 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1336  CheA signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 657 aa  327  3e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280744  normal  0.428976 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  28.74 
 
 		 667 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  28.74 
 
 		 667 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1547  CheA signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 656 aa  326  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  28.71 
 
 		 672 aa  324  4e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  28.71 
 
 		 667 aa  323  5e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 679 aa  323  5e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  28.51 
 
 		 670 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3650  chemotaxis protein CheA  28.84 
 
 		 667 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  28.61 
 
 		 670 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 666 aa  316  8e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  29.08 
 
 		 801 aa  316  9e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  29.96 
 
 		 685 aa  311  2.9999999999999997e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2284  CheA signal transduction histidine kinases  28.51 
 
 		 702 aa  310  6.999999999999999e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 729 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 695 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1414  CheA signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 664 aa  305  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 		 687 aa  302  2e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0059  CheA signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 675 aa  300  5e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.850831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 699 aa  298  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 957 aa  296  7e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 		 920 aa  294  4e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0361  CheW-like protein  38.61 
 
 		 897 aa  293  8e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30104  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  37.53 
 
 		 919 aa  293  1e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  37.5 
 
 		 1010 aa  291  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0766  CheA signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 802 aa  292  2e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 747 aa  289  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 		 919 aa  288  2e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 		 743 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 		 747 aa  287  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 686 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 701 aa  286  1.0000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 		 739 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 673 aa  285  3.0000000000000004e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  37.16 
 
 		 785 aa  284  4.0000000000000003e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  30.36 
 
 		 758 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  38.46 
 
 		 748 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  37.97 
 
 		 748 aa  282  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  38.46 
 
 		 753 aa  282  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  36.62 
 
 		 783 aa  281  2e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 691 aa  281  3e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  37.97 
 
 		 758 aa  281  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.72 
 
 		 754 aa  281  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  39.02 
 
 		 1089 aa  281  4e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2327  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.97 
 
 		 862 aa  280  6e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 760 aa  280  8e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0988  CheA signal transduction histidine kinases  37.47 
 
 		 734 aa  280  9e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581275 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0810  CheA signal transduction histidine kinases  28.25 
 
 		 715 aa  280  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 737 aa  279  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 655 aa  279  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  38.02 
 
 		 754 aa  278  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  36.72 
 
 		 767 aa  278  4e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4461  CheA signal transduction histidine kinase  41.77 
 
 		 662 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 709 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 		 715 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0474  CheA signal transduction histidine kinases  37.13 
 
 		 739 aa  275  3e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  35.39 
 
 		 774 aa  274  4.0000000000000004e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1209  CheA signal transduction histidine kinases  31.05 
 
 		 697 aa  273  6e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0984  chemotaxis sensor histidine kinase  36.39 
 
 		 598 aa  273  8.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 954 aa  273  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  36.45 
 
 		 736 aa  272  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 746 aa  273  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 674 aa  273  1e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 694 aa  272  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 		 694 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  36.64 
 
 		 806 aa  271  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  36.75 
 
 		 785 aa  271  2.9999999999999997e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 598 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  35.98 
 
 		 751 aa  270  7e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  36.7 
 
 		 734 aa  270  7e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  34.59 
 
 		 770 aa  270  8e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 		 733 aa  270  8.999999999999999e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 733 aa  269  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  36.32 
 
 		 601 aa  269  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 		 759 aa  268  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 741 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  37.07 
 
 		 610 aa  267  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0721  CheA signal transduction histidine kinase  36.66 
 
 		 544 aa  267  4e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159017  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  35.98 
 
 		 762 aa  268  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  34.99 
 
 		 714 aa  267  5.999999999999999e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>