More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1304 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0976  acetate/CoA ligase  61.31 
 
 
659 aa  808    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1099  acetate/CoA ligase  65.15 
 
 
700 aa  833    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
652 aa  1300    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0978  acetate/CoA ligase  64.79 
 
 
658 aa  833    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1306  acetate/CoA ligase  61.23 
 
 
664 aa  802    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3167  acetate/CoA ligase  60.75 
 
 
658 aa  803    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.678414  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3169  acetate/CoA ligase  66.72 
 
 
662 aa  857    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745528  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2167  AMP-dependent synthetase and ligase  52.01 
 
 
665 aa  624  1e-177  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2845  acetate/CoA ligase  51.62 
 
 
671 aa  613  9.999999999999999e-175  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0572041  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1140  acetate/CoA ligase  49.53 
 
 
665 aa  602  1.0000000000000001e-171  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224002  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  49.31 
 
 
656 aa  601  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  48.43 
 
 
660 aa  595  1e-169  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  47.62 
 
 
643 aa  587  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  47.41 
 
 
649 aa  587  1e-166  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  49.37 
 
 
649 aa  581  1e-164  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  48.95 
 
 
638 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  48.54 
 
 
658 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  48.13 
 
 
663 aa  573  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  49.27 
 
 
648 aa  568  1e-161  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  48.67 
 
 
661 aa  570  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  49.45 
 
 
660 aa  571  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  49.45 
 
 
644 aa  572  1e-161  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0726  acetate/CoA ligase  48.67 
 
 
655 aa  571  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12630  acetyl-coenzyme A synthetase  47.29 
 
 
658 aa  568  1e-161  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406293  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  48.43 
 
 
649 aa  567  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  49.07 
 
 
661 aa  567  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13698  acetyl-CoA synthetase  47.81 
 
 
651 aa  565  1e-160  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.037981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1068  acetate--CoA ligase  50.74 
 
 
673 aa  564  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  46.96 
 
 
657 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  48.06 
 
 
654 aa  564  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  48.43 
 
 
657 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  48.92 
 
 
661 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  47.1 
 
 
656 aa  558  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  47.93 
 
 
658 aa  559  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  48.77 
 
 
674 aa  561  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3663  acetyl-coenzyme A synthetase  50.99 
 
 
667 aa  560  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  47.77 
 
 
658 aa  558  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  47.4 
 
 
652 aa  560  1e-158  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  46.33 
 
 
655 aa  558  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0513  acetate/CoA ligase  47.02 
 
 
651 aa  558  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  46.26 
 
 
657 aa  558  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  48.51 
 
 
651 aa  555  1e-157  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  48.34 
 
 
655 aa  555  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  47.34 
 
 
657 aa  553  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  47.28 
 
 
667 aa  553  1e-156  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  44.53 
 
 
660 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  48.29 
 
 
656 aa  554  1e-156  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  47.41 
 
 
650 aa  553  1e-156  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  46.83 
 
 
660 aa  555  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  48.34 
 
 
655 aa  555  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  45.67 
 
 
664 aa  552  1e-156  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  46.83 
 
 
666 aa  554  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  46.83 
 
 
660 aa  555  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5425  acetyl-CoA synthetase  47.28 
 
 
663 aa  553  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  47.17 
 
 
655 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1576  acetate/CoA ligase  44.03 
 
 
648 aa  549  1e-155  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000882243  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  46.49 
 
 
667 aa  551  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  46.79 
 
 
657 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  49.09 
 
 
667 aa  547  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  46.43 
 
 
661 aa  545  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  47.03 
 
 
680 aa  546  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1380  acetyl-CoA synthetase  47.29 
 
 
653 aa  548  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.110945  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  46.31 
 
 
667 aa  546  1e-154  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0611  acetate/CoA ligase  48.17 
 
 
667 aa  547  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  45.95 
 
 
660 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  45.54 
 
 
660 aa  547  1e-154  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  47.65 
 
 
715 aa  547  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  45.67 
 
 
655 aa  547  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3168  acetate/CoA ligase  47.34 
 
 
670 aa  545  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0566588 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  45.85 
 
 
666 aa  544  1e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  45.87 
 
 
658 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01080  acetyl-coenzyme A synthetase  48.52 
 
 
650 aa  543  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0318  acetate/CoA ligase  49.3 
 
 
665 aa  543  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184252  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  46.65 
 
 
656 aa  545  1e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  47.8 
 
 
656 aa  544  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  46.33 
 
 
658 aa  545  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1068  acetyl-coenzyme A synthetase  47.01 
 
 
713 aa  542  1e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0382222  normal  0.444835 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  45.92 
 
 
652 aa  543  1e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  43.74 
 
 
651 aa  540  9.999999999999999e-153  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2132  acetate/CoA ligase  47.1 
 
 
661 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000882017  normal  0.24992 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  47.34 
 
 
670 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  46.33 
 
 
664 aa  539  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3916  acetate/CoA ligase  47.35 
 
 
648 aa  536  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  48.28 
 
 
661 aa  538  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  46.55 
 
 
664 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  45.08 
 
 
657 aa  536  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0211  acetate/CoA ligase  48.6 
 
 
659 aa  538  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  44.35 
 
 
660 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4507  acetate/CoA ligase  47.52 
 
 
663 aa  532  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424676  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  46.02 
 
 
673 aa  533  1e-150  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  46.04 
 
 
653 aa  533  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18230  acetyl-coenzyme A synthetase  46.48 
 
 
646 aa  534  1e-150  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.276557  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  46.24 
 
 
666 aa  533  1e-150  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  46.03 
 
 
663 aa  534  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  46.47 
 
 
668 aa  534  1e-150  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4841  acetate/CoA ligase  47.49 
 
 
653 aa  532  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  48.92 
 
 
655 aa  531  1e-149  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  45.61 
 
 
649 aa  529  1e-149  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  45.21 
 
 
667 aa  530  1e-149  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0067  acetate/CoA ligase  47.2 
 
 
651 aa  526  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118091  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>