More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0721 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 
238 aa  482  1e-135  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  57.38 
 
 
239 aa  265  5.999999999999999e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  53.36 
 
 
249 aa  264  1e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  54.04 
 
 
246 aa  259  3e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  55.75 
 
 
278 aa  253  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  50.87 
 
 
238 aa  247  1e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  40.59 
 
 
247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  39.39 
 
 
237 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4674  amidotransferase, putative  37.72 
 
 
234 aa  106  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  37.88 
 
 
233 aa  104  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  34.95 
 
 
243 aa  98.6  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  43.54 
 
 
250 aa  99  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  30.45 
 
 
250 aa  97.8  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  37.07 
 
 
250 aa  96.3  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  37.18 
 
 
241 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  35.8 
 
 
243 aa  95.5  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  37.5 
 
 
258 aa  95.1  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  36.27 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  39.24 
 
 
245 aa  94.7  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  32.09 
 
 
231 aa  94.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  34.39 
 
 
235 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  37.59 
 
 
241 aa  93.2  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  37.57 
 
 
236 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  34.08 
 
 
231 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  28.92 
 
 
232 aa  89.4  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
240 aa  89  6e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
240 aa  88.6  8e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  39.53 
 
 
517 aa  87  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  39.53 
 
 
517 aa  87  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  41.09 
 
 
517 aa  87.4  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2622  GMP synthase  35.54 
 
 
521 aa  86.7  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  33.93 
 
 
275 aa  85.9  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1837  glutamine amidotransferase, class I  35.37 
 
 
226 aa  85.9  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0599314  normal  0.354168 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  37.59 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  35.75 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1772  GMP synthase  38.76 
 
 
505 aa  82.4  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.564322  hitchhiker  0.00463456 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  38.1 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1741  amidotransferase  29.35 
 
 
240 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  34.9 
 
 
240 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  30.9 
 
 
244 aa  81.6  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  39.53 
 
 
506 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1723  GMP synthase  36.43 
 
 
505 aa  81.3  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.734167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2398  glutamine amidotransferase class-I  37.19 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2063  GMP synthase, large subunit  35.26 
 
 
532 aa  79.7  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0340406 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  30.77 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  33.9 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  34.78 
 
 
220 aa  79.3  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  37.4 
 
 
520 aa  79.3  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2547  GMP synthase  34.59 
 
 
538 aa  79.3  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72593  hitchhiker  0.00733595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1451  amidotransferase  29.31 
 
 
244 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3868  amidotransferase  28.74 
 
 
244 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.160036 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  33.79 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3000  glutamine amidotransferase class-I  36.96 
 
 
243 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.372191  normal  0.238787 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1261  GMP synthase  34.59 
 
 
538 aa  78.6  0.00000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  33.33 
 
 
509 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  32.21 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1842  amidotransferase  28.74 
 
 
244 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  37.4 
 
 
520 aa  77.8  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  33.96 
 
 
225 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2587  amidotransferase  29.31 
 
 
241 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0493752 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  37.21 
 
 
528 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  32.58 
 
 
233 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1573  GMP synthase  31.85 
 
 
507 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3013  GMP synthase  33.96 
 
 
540 aa  78.2  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  38.28 
 
 
512 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0844  glutamine amidotransferase class-I  37.06 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  0.319271 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  37.21 
 
 
517 aa  77.4  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1047  GMP synthase  31.02 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3123  GMP synthase  34.06 
 
 
525 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  30.57 
 
 
511 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2184  GMP synthase, large subunit  43.43 
 
 
507 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255738  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  26.92 
 
 
229 aa  77  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1873  amidotransferase  27.75 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  37.8 
 
 
517 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  31.85 
 
 
540 aa  76.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 
230 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  36.72 
 
 
516 aa  77  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  39.25 
 
 
525 aa  77  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1420  amidotransferase  28.16 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1937  GMP synthase large subunit  42.42 
 
 
508 aa  75.9  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000487266 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  43.88 
 
 
534 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1516  GMP synthase  36.43 
 
 
505 aa  75.5  0.0000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  38.38 
 
 
516 aa  75.5  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  33.76 
 
 
510 aa  75.1  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  31.29 
 
 
227 aa  75.1  0.0000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0371  GMP synthase  37.01 
 
 
522 aa  75.1  0.0000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  36.49 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2694  amidotransferase  29.65 
 
 
233 aa  74.7  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0829  glutamine amidotransferase class-I  34.38 
 
 
232 aa  74.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135079  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  34.97 
 
 
228 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  34.38 
 
 
513 aa  74.3  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  34.97 
 
 
228 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.01 
 
 
510 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2606  glutamine amidotransferase class-I  33.8 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.672568  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1126  glutamine amidotransferase, class I  30.57 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42010  amidotransferase  28.16 
 
 
240 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  35.82 
 
 
233 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  34.38 
 
 
513 aa  74.3  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0869  GMP synthase subunit A  28.03 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143243  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3722  glutamine amidotransferase class-I  28.57 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.508189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>