141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0339 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0339  Camphor resistance CrcB protein  100 
 
 
115 aa  211  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0232711 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  37.96 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2562  Camphor resistance CrcB protein  44.34 
 
 
126 aa  62.8  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1416  camphor resistance protein CrcB  40.78 
 
 
125 aa  61.6  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0277002  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  40.35 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1098  camphor resistance CrcB protein  34.23 
 
 
140 aa  57.4  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.25603  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0519  Camphor resistance CrcB protein  47.12 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  32.43 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  37.61 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0373  Camphor resistance CrcB protein  43.36 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 
125 aa  55.1  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0526  Camphor resistance CrcB protein  39.17 
 
 
143 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0550808  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  44.04 
 
 
124 aa  53.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  44.04 
 
 
124 aa  53.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  46.25 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  40.35 
 
 
122 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0846  CrcB protein  44.05 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  34.21 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  43.21 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 
118 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0931  camphor resistance CrcB protein  35.65 
 
 
124 aa  51.2  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.683731  hitchhiker  0.00174486 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  33.93 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  36.36 
 
 
162 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 
118 aa  50.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  38.1 
 
 
122 aa  50.8  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  44.58 
 
 
131 aa  50.4  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  34.26 
 
 
130 aa  50.1  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  43.9 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  43.9 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  33.91 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  37.27 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0520  CrcB protein  41.76 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  31.03 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  35.05 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  40.45 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0027  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0257719 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  37.39 
 
 
125 aa  48.9  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  30.77 
 
 
124 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  30.77 
 
 
124 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  30.77 
 
 
124 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  39.08 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  38.55 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  39.08 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  34.71 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  30.28 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  38.32 
 
 
124 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  41.56 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  39.6 
 
 
107 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  34.26 
 
 
132 aa  47  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  39.33 
 
 
124 aa  47.4  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2563  CrcB protein  43.75 
 
 
116 aa  47  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  41.56 
 
 
122 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  30.65 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0494  camphor resistance protein CrcB  37.8 
 
 
126 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.971623  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2183  Camphor resistance CrcB protein  48 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.324197  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  33.33 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  39.33 
 
 
124 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 
130 aa  47  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  41.77 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  40.48 
 
 
124 aa  46.2  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  38.95 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0903  CrcB protein  32.26 
 
 
127 aa  46.2  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  38.26 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  41.56 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 
122 aa  45.4  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  35.63 
 
 
125 aa  45.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2392  Camphor resistance CrcB protein  38.75 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00145973 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2061  Camphor resistance CrcB protein  37.72 
 
 
133 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000432443  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  35.96 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  38.16 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  39.47 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  39.74 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  38.16 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  38.1 
 
 
124 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  37.72 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  35.79 
 
 
126 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0493  camphor resistance protein CrcB  38.89 
 
 
122 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  33.88 
 
 
124 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24000  Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation  47.95 
 
 
129 aa  44.7  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.517865  normal  0.770223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  39.39 
 
 
166 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  37.89 
 
 
124 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  41.1 
 
 
117 aa  44.3  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0191  Camphor resistance CrcB protein  39.64 
 
 
159 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0375679  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1088  camphor resistance protein CrcB  28.21 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.97219  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3565  camphor resistance protein CrcB  28.21 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00692175  normal  0.464407 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1142  camphor resistance protein CrcB  28.21 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.747152  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  32.5 
 
 
126 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0149  crcB protein  36.36 
 
 
126 aa  43.9  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>