166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0338 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0338  Camphor resistance CrcB protein  100 
 
 
118 aa  213  9.999999999999999e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2563  CrcB protein  45.87 
 
 
116 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  37.82 
 
 
123 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  36.75 
 
 
133 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 
129 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0520  CrcB protein  48.96 
 
 
118 aa  59.7  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0519  Camphor resistance CrcB protein  46.15 
 
 
128 aa  57.8  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  36.29 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0930  camphor resistance CrcB protein  37.86 
 
 
119 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.942183  hitchhiker  0.00352151 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  42.86 
 
 
139 aa  55.1  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2708  hypothetical protein  35.71 
 
 
119 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288842  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0372  CrcB protein  49.41 
 
 
120 aa  54.3  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 
130 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0818  camphor resistance protein CrcB  44.09 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  32.28 
 
 
128 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 
127 aa  51.2  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  34.78 
 
 
129 aa  50.8  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  39.67 
 
 
124 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  27.1 
 
 
118 aa  50.4  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 
124 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  37.39 
 
 
117 aa  50.4  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01601  hypothetical protein  32.48 
 
 
117 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  35.34 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  36.75 
 
 
125 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  38.27 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  30.63 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  35.59 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  34.96 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  34.96 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2562  Camphor resistance CrcB protein  40.71 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  38.27 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  37.04 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  34.96 
 
 
127 aa  48.9  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  32.23 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  30.83 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  38.52 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  36.54 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  36.54 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  36.54 
 
 
124 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  31.33 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  31.58 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  36.54 
 
 
124 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0925  CrcB protein  36.89 
 
 
124 aa  47.8  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  32.23 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  36.29 
 
 
122 aa  47.8  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  37.04 
 
 
122 aa  47.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  32.26 
 
 
129 aa  47.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  30.77 
 
 
128 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  36 
 
 
121 aa  47.4  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  32.8 
 
 
127 aa  47.4  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0493  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
122 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  32.08 
 
 
119 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  37.12 
 
 
136 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  36.05 
 
 
130 aa  47  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06970  hypothetical protein  32.99 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  28.07 
 
 
118 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0457  Camphor resistance CrcB protein  37.17 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.973479  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  33.33 
 
 
124 aa  46.2  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  36.05 
 
 
130 aa  47  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0903  CrcB protein  35.92 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17581  hypothetical protein  35.9 
 
 
120 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.195056  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  26.13 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0243  Camphor resistance CrcB protein  38.53 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  28.07 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  28.07 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  37.89 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  37.89 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  37.21 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  30 
 
 
162 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3962  CrcB protein  36.61 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  28.07 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1416  camphor resistance protein CrcB  38.82 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0277002  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  34.31 
 
 
126 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  30.09 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  35.92 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  26.32 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0037  CrcB protein  28.46 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000769905  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  35.83 
 
 
122 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  29.46 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0525  camphor resistance protein CrcB  40.4 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000215561  normal  0.935924 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  33.6 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  35.58 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1762  camphor resistance protein CrcB  32.17 
 
 
126 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0494  camphor resistance protein CrcB  37.04 
 
 
126 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.971623  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56980  camphor resistance protein CrcB  36 
 
 
127 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2955  camphor resistance protein CrcB  38.82 
 
 
117 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433823  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  31.25 
 
 
127 aa  45.1  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  28.83 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  29.63 
 
 
126 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  34 
 
 
114 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  37.84 
 
 
126 aa  44.3  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  38.3 
 
 
124 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  29.63 
 
 
126 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  26.32 
 
 
120 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  33.93 
 
 
166 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>