60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1706 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1706  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0821668  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0416  hypothetical protein  68 
 
 
242 aa  287  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000286057  normal  0.0207815 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  41.03 
 
 
242 aa  166  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  42.08 
 
 
242 aa  165  5.9999999999999996e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  38.89 
 
 
240 aa  152  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  39.21 
 
 
240 aa  151  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  41.3 
 
 
240 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  36.09 
 
 
244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5062  hypothetical protein  39.25 
 
 
241 aa  139  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  36.29 
 
 
247 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  36.29 
 
 
247 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  36.29 
 
 
247 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  36.29 
 
 
247 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  35.22 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  34.71 
 
 
246 aa  132  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  34.6 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0440  hypothetical protein  42.06 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.871963  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  34.6 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  34.6 
 
 
247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  35.02 
 
 
247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  35.02 
 
 
247 aa  129  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  36.02 
 
 
238 aa  128  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  35.43 
 
 
241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3553  hypothetical protein  35.19 
 
 
246 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767129  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0620  hypothetical protein  35.65 
 
 
244 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  34.93 
 
 
245 aa  123  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0676  hypothetical protein  36.02 
 
 
236 aa  122  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119238  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  33.94 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1019  hypothetical protein  38.12 
 
 
240 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.132736  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0033  protein of unknown function DUF81  35.44 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.37483 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1919  hypothetical protein  37.1 
 
 
268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1751  protein of unknown function DUF81  34.86 
 
 
240 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.138812  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2191  hypothetical protein  35.34 
 
 
243 aa  108  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.496448 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  36.7 
 
 
251 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3303  hypothetical protein  33.62 
 
 
257 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4529  hypothetical protein  32.09 
 
 
235 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  36.32 
 
 
261 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2275  hypothetical protein  35.61 
 
 
235 aa  93.6  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2292  hypothetical protein  29.03 
 
 
249 aa  89.7  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353248  normal  0.347992 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4204  hypothetical protein  36.94 
 
 
174 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3844  hypothetical protein  34.41 
 
 
235 aa  83.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1737  hypothetical protein  24.28 
 
 
241 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593381  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  24.68 
 
 
241 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  23.24 
 
 
241 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1794  hypothetical protein  23.55 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1943  hypothetical protein  33.57 
 
 
247 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1716  hypothetical protein  23.65 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1649  hypothetical protein  23.65 
 
 
241 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1495  membrane protein  23.75 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1530  hypothetical protein  23.65 
 
 
241 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4518  hypothetical protein  30.92 
 
 
255 aa  46.2  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.535232 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  25.33 
 
 
239 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1504  membrane protein  23.24 
 
 
241 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123127  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2506  hypothetical protein  30.37 
 
 
239 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000601102  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  24.76 
 
 
249 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  28.21 
 
 
247 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1535  hypothetical protein  23.98 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.671723  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1149  protein of unknown function DUF81  29.39 
 
 
297 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702872 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  22.81 
 
 
248 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50390  DUF81 family membrane protein  35.29 
 
 
246 aa  42  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.599192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>