282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1315 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1315  MgtE integral membrane region  100 
 
 
211 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  44.39 
 
 
458 aa  159  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2180  MgtE integral membrane region  41.43 
 
 
345 aa  142  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241048  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  40 
 
 
442 aa  122  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0468  MgtE integral membrane region  40.21 
 
 
242 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  35.03 
 
 
451 aa  114  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1690  magnesium transporter  35.09 
 
 
452 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0394876 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2000  magnesium transporter  33.9 
 
 
454 aa  105  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0080  magnesium transporter  31.19 
 
 
438 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3524  magnesium transporter  36.36 
 
 
454 aa  104  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4147  magnesium transporter  36.36 
 
 
454 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.235845 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1159  magnesium transporter  32.2 
 
 
450 aa  102  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2728  divalent cation transporter  35.59 
 
 
456 aa  102  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2935  magnesium transporter  33.33 
 
 
457 aa  101  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  32.69 
 
 
460 aa  101  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1082  divalent cation transporter  37.35 
 
 
447 aa  101  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02891  magnesium transporter  31.64 
 
 
455 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3303  magnesium transporter  35.06 
 
 
461 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2001  magnesium transporter  35.76 
 
 
447 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0946  magnesium transporter  32.77 
 
 
457 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1801  divalent cation transporter  30.88 
 
 
460 aa  100  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1095  magnesium transporter  32.77 
 
 
457 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.20606  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3396  magnesium transporter  33.33 
 
 
457 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1056  magnesium transporter  33.91 
 
 
457 aa  98.6  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0801577  hitchhiker  0.0000813528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5457  magnesium transporter  34.66 
 
 
456 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.169675 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3521  magnesium transporter  33.91 
 
 
457 aa  98.6  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3300  magnesium transporter  33.91 
 
 
457 aa  98.6  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0971  magnesium transporter  32.77 
 
 
457 aa  97.8  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0876  magnesium transporter  34.48 
 
 
465 aa  97.1  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1145  magnesium transporter  32.95 
 
 
457 aa  96.7  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3903  magnesium transporter  31.79 
 
 
456 aa  96.7  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508399  normal  0.721995 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0822  magnesium transporter  34.48 
 
 
465 aa  97.1  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  32.52 
 
 
445 aa  97.1  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1342  divalent cation transporter  29.28 
 
 
447 aa  96.3  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.09733  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  34.57 
 
 
449 aa  95.9  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  32.17 
 
 
476 aa  95.5  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3944  magnesium transporter  34.1 
 
 
441 aa  95.5  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  32.52 
 
 
445 aa  95.1  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4054  magnesium transporter  34.1 
 
 
441 aa  94.7  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4087  magnesium transporter  34.1 
 
 
441 aa  94.7  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1691  magnesium transporter  32.39 
 
 
452 aa  94.4  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0276763 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1318  magnesium transporter  30.21 
 
 
458 aa  94.4  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  33.54 
 
 
453 aa  94.4  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0337  MgtE integral membrane region  33.33 
 
 
351 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  31.03 
 
 
482 aa  94  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4616  magnesium transporter  31.82 
 
 
456 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  decreased coverage  0.00267397 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01460  Mg2+ transporter MgtE  32.77 
 
 
452 aa  92.4  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  29.82 
 
 
444 aa  92.4  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3735  MgtE integral membrane region  33.89 
 
 
415 aa  92  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2441  magnesium transporter  32.46 
 
 
460 aa  92  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4800  magnesium transporter  31.11 
 
 
456 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.832783  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  29.63 
 
 
443 aa  90.9  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  31.28 
 
 
422 aa  90.5  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  31.67 
 
 
471 aa  90.5  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1454  magnesium transporter  35.58 
 
 
447 aa  90.1  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192338  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0331  magnesium transporter  33.91 
 
 
458 aa  89.7  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2099  magnesium transporter  32.57 
 
 
460 aa  89  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.168721  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  34.35 
 
 
462 aa  89  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  35.85 
 
 
450 aa  89  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1398  magnesium transport protein  32.2 
 
 
458 aa  89  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5582  magnesium transporter  39.39 
 
 
444 aa  88.6  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  33.92 
 
 
461 aa  88.6  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  33.92 
 
 
461 aa  88.6  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6729  magnesium transporter  37.5 
 
 
463 aa  88.2  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143213  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1825  magnesium transporter  34.03 
 
 
463 aa  88.2  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202182  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1994  divalent cation transporter  33.54 
 
 
442 aa  88.2  9e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  31.68 
 
 
446 aa  87.8  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1785  divalent cation transporter  32.16 
 
 
447 aa  87.8  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  29.94 
 
 
452 aa  87  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2520  magnesium transporter  33.13 
 
 
454 aa  87  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  30.64 
 
 
463 aa  87  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1742  magnesium transporter  34.44 
 
 
463 aa  87  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  27.45 
 
 
481 aa  86.7  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0582  Mg/Co/Ni transporter MgtE  28.87 
 
 
467 aa  85.9  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2060  magnesium transporter  30.88 
 
 
492 aa  85.9  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000417993  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  34.85 
 
 
462 aa  85.9  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0571  magnesium transporter  28.87 
 
 
467 aa  85.9  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30070  Mg2+ transporter MgtE  29.1 
 
 
461 aa  85.1  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  31.87 
 
 
453 aa  84  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2704  MgtE intracellular region  33.1 
 
 
456 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000714396  hitchhiker  0.000367704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2772  MgtE intracellular region  33.1 
 
 
456 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000125234  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2874  MgtE intracellular region  33.1 
 
 
456 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000391262  hitchhiker  0.000117357 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1301  magnesium transporter  33.1 
 
 
484 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1626  magnesium transporter  33.33 
 
 
454 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  30.69 
 
 
470 aa  83.6  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2199  divalent cation transporter  34.36 
 
 
465 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  33.79 
 
 
465 aa  83.6  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  29.45 
 
 
454 aa  84  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1060  MgtE intracellular region  29.29 
 
 
443 aa  84  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  31.21 
 
 
455 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  30.29 
 
 
463 aa  83.2  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  32.64 
 
 
461 aa  82.8  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1710  magnesium transporter  32.53 
 
 
459 aa  82.4  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000106288  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0320  divalent cation transporter  30.26 
 
 
460 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0139413 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  30.18 
 
 
454 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1565  magnesium transporter, putative  31.03 
 
 
456 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1890  magnesium transporter  32.46 
 
 
460 aa  82.4  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  31.33 
 
 
473 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  31.21 
 
 
454 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  28.35 
 
 
477 aa  82  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>