More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1398 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0946  magnesium transporter  70.09 
 
 		 457 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1095  magnesium transporter  69.87 
 
 		 457 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.20606  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1398  magnesium transport protein  100 
 
 		 458 aa  922    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02891  magnesium transporter  63.04 
 
 		 455 aa  538  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0822  magnesium transporter  60.7 
 
 		 465 aa  530  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0876  magnesium transporter  60.7 
 
 		 465 aa  530  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3303  magnesium transporter  60.7 
 
 		 461 aa  528  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2728  divalent cation transporter  60.19 
 
 		 456 aa  526  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3524  magnesium transporter  61.11 
 
 		 454 aa  528  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4800  magnesium transporter  61.43 
 
 		 456 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.832783  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4616  magnesium transporter  61.86 
 
 		 456 aa  514  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  decreased coverage  0.00267397 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5457  magnesium transporter  61.16 
 
 		 456 aa  513  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169675 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3903  magnesium transporter  60.93 
 
 		 456 aa  510  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508399  normal  0.721995 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4147  magnesium transporter  56.02 
 
 		 454 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.235845 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0331  magnesium transporter  54.65 
 
 		 458 aa  474  1e-132  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4087  magnesium transporter  48.19 
 
 		 441 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4054  magnesium transporter  48.19 
 
 		 441 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1318  magnesium transporter  43.02 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3944  magnesium transporter  47.96 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  43.52 
 
 		 460 aa  346  5e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  43.45 
 
 		 463 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0914  magnesium transporter  45.03 
 
 		 460 aa  327  3e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1890  magnesium transporter  40.89 
 
 		 460 aa  322  9.999999999999999e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2002  magnesium transporter  43.43 
 
 		 458 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.493999  normal  0.0929187 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2099  magnesium transporter  39.29 
 
 		 460 aa  318  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.168721  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1801  divalent cation transporter  39.72 
 
 		 460 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2441  magnesium transporter  40 
 
 		 460 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0320  divalent cation transporter  39.96 
 
 		 460 aa  306  6e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0139413 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0080  magnesium transporter  47.48 
 
 		 438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2058  magnesium transporter  40.09 
 
 		 460 aa  297  3e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6729  magnesium transporter  37.61 
 
 		 463 aa  293  6e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  34.89 
 
 		 463 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01460  Mg2+ transporter MgtE  34.03 
 
 		 452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  30.44 
 
 		 452 aa  233  5e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  34.2 
 
 		 468 aa  232  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  33.63 
 
 		 449 aa  231  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2496  magnesium transporter  33.57 
 
 		 442 aa  230  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  35.88 
 
 		 466 aa  229  7e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1785  divalent cation transporter  34.81 
 
 		 447 aa  228  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  32.11 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  32.04 
 
 		 444 aa  223  6e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0891  magnesium transporter  32.5 
 
 		 449 aa  219  8.999999999999998e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182098 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1342  divalent cation transporter  31.04 
 
 		 447 aa  218  1e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.09733  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1159  magnesium transporter  32.44 
 
 		 450 aa  217  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  30.84 
 
 		 449 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  32.4 
 
 		 463 aa  217  4e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2000  magnesium transporter  32.5 
 
 		 454 aa  216  8e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  31.25 
 
 		 442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2001  magnesium transporter  33.09 
 
 		 447 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2520  magnesium transporter  36.21 
 
 		 454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0507  hypothetical protein  31.63 
 
 		 463 aa  214  3.9999999999999995e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.593937 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30070  Mg2+ transporter MgtE  31.62 
 
 		 461 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  33.18 
 
 		 451 aa  211  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  32.14 
 
 		 462 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  33.49 
 
 		 450 aa  211  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1691  magnesium transporter  31.91 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0276763 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  32.35 
 
 		 462 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  30.86 
 
 		 456 aa  208  1e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  30.96 
 
 		 453 aa  207  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  30.37 
 
 		 454 aa  207  4e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1082  divalent cation transporter  30.16 
 
 		 447 aa  206  9e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  32.79 
 
 		 465 aa  204  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  29.26 
 
 		 445 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  30.02 
 
 		 449 aa  204  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1703  magnesium transporter  32.19 
 
 		 445 aa  204  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1454  magnesium transporter  30.5 
 
 		 447 aa  204  3e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192338  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0337  MgtE integral membrane region  34.63 
 
 		 351 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  32.65 
 
 		 468 aa  203  5e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  32.65 
 
 		 468 aa  202  8e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  30.38 
 
 		 451 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1690  magnesium transporter  31.86 
 
 		 452 aa  202  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0394876 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  33.1 
 
 		 469 aa  200  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  33.1 
 
 		 469 aa  200  5e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  32.43 
 
 		 469 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0382  magnesium transporter  27.21 
 
 		 454 aa  199  1.0000000000000001e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  32.05 
 
 		 468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2935  magnesium transporter  33.25 
 
 		 457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4176  magnesium transporter  32.88 
 
 		 452 aa  196  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.987951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  28.8 
 
 		 445 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1145  magnesium transporter  33.08 
 
 		 457 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  30.85 
 
 		 443 aa  194  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0419  magnesium transporter  30.14 
 
 		 455 aa  192  8e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0971  magnesium transporter  32.4 
 
 		 457 aa  192  8e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2363  magnesium transporter  28.91 
 
 		 454 aa  192  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0051  magnesium transporter  33.76 
 
 		 458 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6844  magnesium transporter  35.58 
 
 		 454 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1056  magnesium transporter  33.08 
 
 		 457 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0801577  hitchhiker  0.0000813528 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3396  magnesium transporter  32.82 
 
 		 457 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3521  magnesium transporter  33.08 
 
 		 457 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3300  magnesium transporter  32.3 
 
 		 457 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2187  magnesium transporter  32.61 
 
 		 461 aa  190  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183067  normal  0.0149882 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  30.69 
 
 		 461 aa  189  7e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0412  magnesium transporter  32.4 
 
 		 461 aa  189  9e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1722  magnesium transporter  31.94 
 
 		 462 aa  189  9e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0681  transcriptional regulator  30.57 
 
 		 454 aa  187  4e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  31.64 
 
 		 461 aa  186  6e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  31.64 
 
 		 461 aa  186  6e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5582  magnesium transporter  32.32 
 
 		 444 aa  186  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10367  Mg2+ transport transmembrane protein mgtE  31.44 
 
 		 460 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.54721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>