More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2199 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2199  divalent cation transporter  100 
 
 
465 aa  914    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3406  magnesium transporter  73.15 
 
 
447 aa  621  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200177  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5582  magnesium transporter  60.96 
 
 
444 aa  524  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33110  Mg2+ transporter MgtE  62.33 
 
 
446 aa  467  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.237395  normal  0.754036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3240  magnesium transporter  59.18 
 
 
451 aa  463  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0666949 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3316  magnesium transporter  52.26 
 
 
473 aa  394  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.685446  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01460  Mg2+ transporter MgtE  46.06 
 
 
452 aa  371  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1159  magnesium transporter  43.02 
 
 
450 aa  353  2.9999999999999997e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4176  magnesium transporter  48.44 
 
 
452 aa  342  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.987951  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  40.36 
 
 
463 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  42.31 
 
 
462 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  42.31 
 
 
462 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  36.55 
 
 
456 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1907  magnesium transporter  42.43 
 
 
445 aa  313  4.999999999999999e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  39 
 
 
466 aa  312  6.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  39.55 
 
 
465 aa  302  7.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  37.27 
 
 
468 aa  302  7.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  39.51 
 
 
463 aa  302  1e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  34.23 
 
 
446 aa  301  2e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  39.05 
 
 
469 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  39.05 
 
 
469 aa  300  4e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  37.17 
 
 
469 aa  293  5e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  32.96 
 
 
449 aa  293  7e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  34.23 
 
 
446 aa  291  1e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  37.14 
 
 
468 aa  290  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04510  Mg2+ transporter MgtE  42 
 
 
450 aa  289  9e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  35.42 
 
 
449 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  36.77 
 
 
468 aa  287  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  31.96 
 
 
444 aa  283  6.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  36.1 
 
 
468 aa  283  7.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1454  magnesium transporter  34.69 
 
 
447 aa  279  9e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192338  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0138  divalent cation transporter  37.75 
 
 
486 aa  277  3e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1801  divalent cation transporter  35.57 
 
 
460 aa  275  9e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  33.68 
 
 
460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  35.57 
 
 
458 aa  274  3e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  34.13 
 
 
443 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0891  magnesium transporter  37.59 
 
 
449 aa  273  5.000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182098 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  33.56 
 
 
452 aa  271  1e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17571  Mg2+ transporter  38.03 
 
 
471 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.161452  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0320  divalent cation transporter  35.78 
 
 
460 aa  266  7e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0139413 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6729  magnesium transporter  37.19 
 
 
463 aa  265  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143213  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0914  magnesium transporter  37.61 
 
 
460 aa  264  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2099  magnesium transporter  33.83 
 
 
460 aa  261  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.168721  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0092  magnesium transporter  37.56 
 
 
486 aa  260  4e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1890  magnesium transporter  31.72 
 
 
460 aa  259  8e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1318  magnesium transporter  34.15 
 
 
458 aa  258  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  34.93 
 
 
449 aa  256  6e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0419  magnesium transporter  32.27 
 
 
455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  35.14 
 
 
454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1342  divalent cation transporter  33.03 
 
 
447 aa  253  6e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.09733  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0382  magnesium transporter  29.56 
 
 
454 aa  251  2e-65  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2058  magnesium transporter  35.4 
 
 
460 aa  251  3e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2441  magnesium transporter  34.3 
 
 
460 aa  250  4e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2002  magnesium transporter  33.55 
 
 
458 aa  249  9e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.493999  normal  0.0929187 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30070  Mg2+ transporter MgtE  37.59 
 
 
461 aa  248  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01631  Mg2+ transporter  38.03 
 
 
473 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1523  magnesium transporter  33.03 
 
 
447 aa  248  2e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  33.79 
 
 
450 aa  247  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1082  divalent cation transporter  34.78 
 
 
447 aa  246  8e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2520  magnesium transporter  37.22 
 
 
454 aa  244  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2363  magnesium transporter  31.35 
 
 
454 aa  240  5e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  32.27 
 
 
451 aa  233  4.0000000000000004e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  34.55 
 
 
463 aa  233  5e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  34.62 
 
 
453 aa  230  5e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10367  Mg2+ transport transmembrane protein mgtE  37.31 
 
 
460 aa  229  9e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.54721 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1471  magnesium transporter  33.88 
 
 
449 aa  227  3e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2496  magnesium transporter  31.03 
 
 
442 aa  225  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  31.76 
 
 
442 aa  225  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0412  magnesium transporter  34.19 
 
 
461 aa  224  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  36.41 
 
 
450 aa  223  8e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25770  Mg2+ transporter MgtE  33.17 
 
 
462 aa  219  8.999999999999998e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1785  divalent cation transporter  33.73 
 
 
447 aa  218  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1068  magnesium transporter  30 
 
 
441 aa  218  2e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1691  magnesium transporter  32.94 
 
 
452 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0276763 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  32.62 
 
 
451 aa  216  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0080  magnesium transporter  35.7 
 
 
438 aa  216  8e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3303  magnesium transporter  34.15 
 
 
461 aa  215  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2001  magnesium transporter  34.17 
 
 
447 aa  213  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0051  magnesium transporter  37.09 
 
 
458 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.242688 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3944  magnesium transporter  34.12 
 
 
441 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4087  magnesium transporter  33.81 
 
 
441 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4054  magnesium transporter  33.81 
 
 
441 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0876  magnesium transporter  34.15 
 
 
465 aa  208  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0507  hypothetical protein  30.84 
 
 
463 aa  208  2e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.593937 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0822  magnesium transporter  34.15 
 
 
465 aa  208  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3524  magnesium transporter  34.35 
 
 
454 aa  208  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5457  magnesium transporter  35.32 
 
 
456 aa  207  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.169675 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  29.48 
 
 
461 aa  207  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  29.48 
 
 
461 aa  207  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  33.11 
 
 
453 aa  206  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0946  magnesium transporter  35.1 
 
 
457 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4147  magnesium transporter  35.11 
 
 
454 aa  205  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.235845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4800  magnesium transporter  32.41 
 
 
456 aa  205  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.832783  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2728  divalent cation transporter  33.57 
 
 
456 aa  203  6e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3903  magnesium transporter  33.88 
 
 
456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508399  normal  0.721995 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2531  MgtE integral membrane region  37.62 
 
 
339 aa  201  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.540183  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0337  MgtE integral membrane region  35.94 
 
 
351 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1980  magnesium transporter  29.16 
 
 
451 aa  198  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1260  magnesium transporter  37.85 
 
 
451 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1690  magnesium transporter  32.51 
 
 
452 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0394876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>