More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1260 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1260  magnesium transporter  100 
 
 
451 aa  912    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2531  MgtE integral membrane region  55.03 
 
 
339 aa  343  4e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.540183  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30070  Mg2+ transporter MgtE  42.14 
 
 
461 aa  335  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10367  Mg2+ transport transmembrane protein mgtE  44.98 
 
 
460 aa  317  4e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.54721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0051  magnesium transporter  46 
 
 
458 aa  316  6e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.242688 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2496  magnesium transporter  37.19 
 
 
442 aa  273  6e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0726  magnesium transporter  41.05 
 
 
442 aa  227  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.376481  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2520  magnesium transporter  33.33 
 
 
454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  32.11 
 
 
456 aa  212  9e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  36.29 
 
 
463 aa  203  5e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5582  magnesium transporter  38.24 
 
 
444 aa  202  7e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01460  Mg2+ transporter MgtE  32.81 
 
 
452 aa  202  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  34.69 
 
 
443 aa  196  9e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2199  divalent cation transporter  37.85 
 
 
465 aa  195  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1801  divalent cation transporter  33.23 
 
 
460 aa  195  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  31.06 
 
 
452 aa  194  2e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  30.65 
 
 
453 aa  193  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  29.31 
 
 
460 aa  193  6e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1318  magnesium transporter  30.13 
 
 
458 aa  193  6e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2002  magnesium transporter  33.05 
 
 
458 aa  193  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.493999  normal  0.0929187 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  32.82 
 
 
449 aa  192  9e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1890  magnesium transporter  32.93 
 
 
460 aa  191  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0971  magnesium transporter  30.75 
 
 
457 aa  190  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  29.3 
 
 
442 aa  189  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2935  magnesium transporter  32.52 
 
 
457 aa  189  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0320  divalent cation transporter  33.53 
 
 
460 aa  188  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0139413 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0080  magnesium transporter  32.12 
 
 
438 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6729  magnesium transporter  35.15 
 
 
463 aa  186  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143213  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1145  magnesium transporter  30.19 
 
 
457 aa  186  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  29.78 
 
 
444 aa  186  7e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1159  magnesium transporter  34.16 
 
 
450 aa  186  8e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3300  magnesium transporter  28.31 
 
 
457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1056  magnesium transporter  28.31 
 
 
457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0801577  hitchhiker  0.0000813528 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2058  magnesium transporter  33.23 
 
 
460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3396  magnesium transporter  28.08 
 
 
457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3521  magnesium transporter  28.31 
 
 
457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2269  magnesium transporter  32.85 
 
 
454 aa  184  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0532952  hitchhiker  0.0000374811 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3240  magnesium transporter  37.87 
 
 
451 aa  183  5.0000000000000004e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0666949 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1785  divalent cation transporter  29.78 
 
 
447 aa  183  7e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0914  magnesium transporter  31.41 
 
 
460 aa  182  9.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  29.78 
 
 
463 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1342  divalent cation transporter  31.45 
 
 
447 aa  179  8e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.09733  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3944  magnesium transporter  32.64 
 
 
441 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  32.43 
 
 
466 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  29.02 
 
 
446 aa  178  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3903  magnesium transporter  39.04 
 
 
456 aa  178  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508399  normal  0.721995 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2099  magnesium transporter  33.04 
 
 
460 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.168721  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0891  magnesium transporter  30.28 
 
 
449 aa  177  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3406  magnesium transporter  35.71 
 
 
447 aa  177  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200177  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  33.93 
 
 
465 aa  176  7e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1095  magnesium transporter  28.8 
 
 
457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.20606  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1068  magnesium transporter  27.17 
 
 
441 aa  173  5e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  27.07 
 
 
446 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4087  magnesium transporter  31.95 
 
 
441 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  29.95 
 
 
451 aa  172  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4054  magnesium transporter  31.95 
 
 
441 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  28.36 
 
 
454 aa  172  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0382  magnesium transporter  26.3 
 
 
454 aa  171  2e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02891  magnesium transporter  36.69 
 
 
455 aa  171  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  28.76 
 
 
468 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  28.87 
 
 
468 aa  171  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2001  magnesium transporter  32.92 
 
 
447 aa  171  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2441  magnesium transporter  32.63 
 
 
460 aa  170  5e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6844  magnesium transporter  34.63 
 
 
454 aa  170  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04510  Mg2+ transporter MgtE  33.6 
 
 
450 aa  170  6e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4176  magnesium transporter  31.16 
 
 
452 aa  169  8e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.987951  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0337  MgtE integral membrane region  31.06 
 
 
351 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  28.5 
 
 
468 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1907  magnesium transporter  32.54 
 
 
445 aa  169  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  28.03 
 
 
449 aa  169  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  26.91 
 
 
445 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  27.2 
 
 
445 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  28.76 
 
 
468 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3303  magnesium transporter  28.31 
 
 
461 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  28.7 
 
 
458 aa  167  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1690  magnesium transporter  27.75 
 
 
452 aa  167  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0394876 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  30.58 
 
 
469 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  31.87 
 
 
463 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0876  magnesium transporter  27.82 
 
 
465 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0946  magnesium transporter  27.66 
 
 
457 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  28 
 
 
449 aa  164  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0822  magnesium transporter  27.82 
 
 
465 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0419  magnesium transporter  28.41 
 
 
455 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  28.98 
 
 
451 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4616  magnesium transporter  28.43 
 
 
456 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  decreased coverage  0.00267397 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0331  magnesium transporter  27.61 
 
 
458 aa  162  1e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1454  magnesium transporter  26.52 
 
 
447 aa  161  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192338  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  27.29 
 
 
450 aa  160  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1082  divalent cation transporter  32.62 
 
 
447 aa  161  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2363  magnesium transporter  28.4 
 
 
454 aa  160  4e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4800  magnesium transporter  32.94 
 
 
456 aa  160  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.832783  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2728  divalent cation transporter  35.61 
 
 
456 aa  160  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3524  magnesium transporter  31.93 
 
 
454 aa  160  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5457  magnesium transporter  30.32 
 
 
456 aa  160  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.169675 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4147  magnesium transporter  30.33 
 
 
454 aa  159  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.235845 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  29.36 
 
 
469 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0138  divalent cation transporter  29.38 
 
 
486 aa  157  4e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1691  magnesium transporter  28.5 
 
 
452 aa  157  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0276763 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1703  magnesium transporter  29.37 
 
 
445 aa  156  6e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  29.36 
 
 
469 aa  156  6e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>