64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4364 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0662  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  63.91 
 
 		 681 aa  840    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0104064  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4364  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  100 
 
 		 691 aa  1406    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103685  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1617  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  63.58 
 
 		 685 aa  888    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1330  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  62.63 
 
 		 685 aa  875    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.372745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2483  dehydrogenase-like protein  48.74 
 
 		 728 aa  612  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0417165  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2362  dehydrogenase-like protein  48.14 
 
 		 728 aa  602  1e-170  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.221453 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1964  putative dehydrogenase  37.83 
 
 		 710 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2305  dehydrogenase-like  40.44 
 
 		 720 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1644  dehydrogenase-like protein  40.85 
 
 		 707 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1566  dehydrogenase-like protein  40.85 
 
 		 707 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1668  putative dehydrogenase  39.59 
 
 		 689 aa  436  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0410472  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1059  dehydrogenase-like  38.81 
 
 		 684 aa  435  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1649  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  44.81 
 
 		 359 aa  319  1e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0249  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  43.59 
 
 		 370 aa  300  4e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00032725  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0808  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  42.31 
 
 		 362 aa  300  8e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000170863  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0173  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  41.76 
 
 		 357 aa  289  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696733  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0129  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  41.58 
 
 		 371 aa  285  3.0000000000000004e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000445979  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0150  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  42.74 
 
 		 360 aa  281  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00730  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  40.44 
 
 		 362 aa  267  5.999999999999999e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000274075  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0115  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  39.12 
 
 		 364 aa  259  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000323099  hitchhiker  0.00167749 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0149  hypothetical protein  39.14 
 
 		 300 aa  190  9e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0567257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0114  hypothetical protein  34.1 
 
 		 302 aa  178  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0358289  hitchhiker  0.00078389 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0475  hypothetical protein  39.13 
 
 		 299 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0492  hypothetical protein  36.6 
 
 		 334 aa  175  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2695  hypothetical protein  32.69 
 
 		 317 aa  171  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0807  hypothetical protein  32.67 
 
 		 302 aa  169  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00370253  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0112  hypothetical protein  33.55 
 
 		 304 aa  168  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000282861  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3630  dehydrogenase-like protein  31.85 
 
 		 312 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.496684  normal  0.352042 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00720  hypothetical protein  30.97 
 
 		 305 aa  167  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000877673  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1830  hypothetical protein  35.43 
 
 		 304 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.290615 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0587  hypothetical protein  29.47 
 
 		 303 aa  163  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0873705  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2025  hypothetical protein  34.77 
 
 		 299 aa  163  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0375526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1511  hypothetical protein  33.44 
 
 		 301 aa  157  7e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.850305  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1254  protein of unknown function DUF205  31.81 
 
 		 574 aa  152  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9558  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  30.63 
 
 		 955 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0989  hypothetical protein  30.45 
 
 		 556 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.39207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1012  hypothetical protein  31.68 
 
 		 560 aa  131  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0262179  hitchhiker  0.000000557566 
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  26.88 
 
 		 845 aa  124  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5680  hypothetical protein  25.89 
 
 		 366 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0387198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0440  putative class-III aminotransferase  25.78 
 
 		 891 aa  105  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2946  aminotransferase class-III  28.77 
 
 		 957 aa  92  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.818635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2973  aminotransferase class-III  24.84 
 
 		 956 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2782  pyridoxalphosphate dependent aminotransferase, class III  24.84 
 
 		 959 aa  90.9  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05591  dehydrogenase  25.16 
 
 		 346 aa  89.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0872  dehydrogenase like protein  24.83 
 
 		 340 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0898  dehydrogenase-like protein  24.83 
 
 		 340 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0157574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05971  dehydrogenase  24.84 
 
 		 346 aa  87.8  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0533  hypothetical protein  25.16 
 
 		 346 aa  87.4  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2534  hypothetical protein  23.55 
 
 		 339 aa  86.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05891  dehydrogenase  22.67 
 
 		 346 aa  87  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0334693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05891  dehydrogenase  24.52 
 
 		 346 aa  86.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.735878  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.41 
 
 		 339 aa  85.9  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.121651  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1864  dehydrogenase  22.36 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05361  dehydrogenase  25 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1594  hypothetical protein  25.59 
 
 		 341 aa  84  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.293919 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2279  hypothetical protein  24.36 
 
 		 339 aa  79.7  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0399  hypothetical protein  23.47 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247515  normal  0.582942 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1634  hypothetical protein  24.84 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.509196  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0729  hypothetical protein  23.68 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3031  amino acid adenylation domain protein  25.12 
 
 		 1466 aa  50.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3090  amino acid adenylation domain protein  24.65 
 
 		 1466 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07811  hypothetical protein  23.66 
 
 		 191 aa  48.5  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  23.36 
 
 		 4101 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02850  glutamyl-tRNA reductase  33.61 
 
 		 443 aa  46.2  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.766325  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>