273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3324 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3324  integrase catalytic region  100 
 
 
578 aa  1179    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00187829  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5024  integrase catalytic region  42.47 
 
 
577 aa  399  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5252  integrase catalytic region  42.47 
 
 
577 aa  399  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.56302  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5058  hypothetical protein  39.45 
 
 
281 aa  207  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.168337  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5221  hypothetical protein  39.45 
 
 
281 aa  207  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5057  LuxR family transcriptional regulator  40.5 
 
 
294 aa  135  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.601105  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5220  LuxR family transcriptional regulator  40.5 
 
 
294 aa  135  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2634  IS3 family transposase B  27.86 
 
 
279 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000161209  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4519  IS3 family transposase B  27.86 
 
 
279 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000685336  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2592  integrase catalytic subunit  27.7 
 
 
276 aa  60.5  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000687739  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1540  transposase  28.74 
 
 
239 aa  60.1  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1105  integrase catalytic subunit  23.84 
 
 
426 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0473204  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2563  integrase catalytic region  29.71 
 
 
290 aa  58.9  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0034021  hitchhiker  0.0000085301 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2575  integrase catalytic region  29.71 
 
 
290 aa  58.9  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196257  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0585  integrase catalytic subunit  25.53 
 
 
278 aa  58.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0591  integrase catalytic subunit  25.53 
 
 
278 aa  58.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.418555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0919  integrase catalytic subunit  25.53 
 
 
278 aa  58.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1656  integrase catalytic subunit  25.53 
 
 
278 aa  58.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.629851  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1661  integrase catalytic subunit  25.53 
 
 
278 aa  58.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1674  integrase catalytic subunit  25.53 
 
 
278 aa  58.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1676  integrase catalytic subunit  25.53 
 
 
278 aa  58.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1683  integrase catalytic subunit  25.53 
 
 
278 aa  58.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1687  integrase catalytic subunit  25.53 
 
 
278 aa  58.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1691  integrase catalytic subunit  25.53 
 
 
278 aa  58.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.139812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1881  integrase catalytic subunit  25.53 
 
 
278 aa  58.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1976  integrase catalytic subunit  25.53 
 
 
278 aa  58.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0994913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1993  integrase catalytic subunit  25.53 
 
 
278 aa  58.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2000  integrase catalytic subunit  25.53 
 
 
278 aa  58.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.887951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2012  integrase catalytic subunit  25.53 
 
 
278 aa  58.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00348364  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2135  integrase catalytic subunit  25.53 
 
 
278 aa  58.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2773  integrase catalytic subunit  25.53 
 
 
278 aa  58.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0144895  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1886  integrase catalytic subunit  25.53 
 
 
278 aa  57.8  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2308  integrase catalytic region  26.61 
 
 
395 aa  57.4  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.349393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2452  integrase catalytic region  26.61 
 
 
395 aa  57.4  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128502  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1567  integrase catalytic region  26.61 
 
 
395 aa  57.4  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210525  normal  0.165207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0954  integrase catalytic region  26.61 
 
 
395 aa  57.4  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3168  integrase catalytic region  26.61 
 
 
395 aa  57.4  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0686485  hitchhiker  0.0000277573 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0236  integrase catalytic subunit  24.52 
 
 
275 aa  56.6  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0886  integrase catalytic region  28.37 
 
 
395 aa  56.6  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4864  integrase catalytic subunit  25 
 
 
279 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05621  hypothetical protein  28.78 
 
 
233 aa  55.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3301  integrase catalytic subunit  25 
 
 
279 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05650  integrase  28.26 
 
 
233 aa  55.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0294  integrase catalytic subunit  25 
 
 
279 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1761  Integrase catalytic region  22.26 
 
 
407 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1602  Integrase catalytic region  28.66 
 
 
607 aa  55.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.090134  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01092  hypothetical protein  28.26 
 
 
233 aa  55.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0277  Integrase catalytic region  27.27 
 
 
289 aa  55.1  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.213887  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0539  putative transposase  24.17 
 
 
293 aa  55.1  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1486  Integrase catalytic region  27.27 
 
 
289 aa  55.1  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.000219526  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3361  transposase  25.24 
 
 
245 aa  54.7  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4098  Integrase catalytic region  22.26 
 
 
399 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0068  Integrase catalytic region  27.27 
 
 
289 aa  55.1  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0447  Integrase catalytic region  27.27 
 
 
289 aa  55.1  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0510  Integrase catalytic region  27.27 
 
 
289 aa  55.1  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.384785  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0662  Integrase catalytic region  27.27 
 
 
289 aa  55.1  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0673  Integrase catalytic region  27.27 
 
 
289 aa  55.1  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.791289  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0691  Integrase catalytic region  27.27 
 
 
289 aa  55.1  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.428791  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0221  Integrase catalytic region  22.39 
 
 
285 aa  54.7  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3290  Integrase catalytic region  22.39 
 
 
285 aa  54.7  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3025  integrase catalytic subunit  24.6 
 
 
364 aa  54.3  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01946  hypothetical protein  28.78 
 
 
233 aa  54.3  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01864  hypothetical protein  28.78 
 
 
233 aa  54.3  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06183  integrase  28.78 
 
 
233 aa  54.3  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06014  hypothetical protein  28.78 
 
 
233 aa  54.3  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05750  integrase  28.78 
 
 
233 aa  54.3  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06080  hypothetical protein  28.78 
 
 
233 aa  54.3  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08185  integrase, catalytic region  28.78 
 
 
233 aa  54.3  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.000000144763  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02813  hypothetical protein  28.78 
 
 
233 aa  54.3  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02438  hypothetical protein  28.78 
 
 
233 aa  54.3  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02412  hypothetical protein  28.78 
 
 
233 aa  54.3  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02886  hypothetical protein  28.78 
 
 
233 aa  54.3  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05658  integrase  28.78 
 
 
233 aa  54.3  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01503  hypothetical protein  28.78 
 
 
233 aa  54.3  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01668  hypothetical protein  28.78 
 
 
233 aa  54.3  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06561  integrase  28.78 
 
 
233 aa  53.9  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0735  integrase catalytic subunit  25.21 
 
 
391 aa  53.9  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05742  hypothetical protein  28.37 
 
 
208 aa  53.5  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02327  hypothetical protein  28.37 
 
 
172 aa  53.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2293  hypothetical protein  22.83 
 
 
362 aa  53.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3411  hypothetical protein  23.1 
 
 
374 aa  53.5  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.042682  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3237  hypothetical protein  23.1 
 
 
374 aa  53.5  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0336824  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3275  transcriptional regulator, GntR family  23.1 
 
 
374 aa  53.5  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000360291  normal  0.033149 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3374  hypothetical protein  23.1 
 
 
374 aa  53.5  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1294  Integrase catalytic region  23.71 
 
 
306 aa  53.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1333  transposase  27.54 
 
 
209 aa  53.1  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3049  transposase IS3/IS911 family protein  23.1 
 
 
374 aa  53.5  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_65  transposase  27.54 
 
 
209 aa  53.1  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0678  transposase IS3/IS911 family protein  23.1 
 
 
374 aa  53.5  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.505807  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  25.25 
 
 
277 aa  53.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3515  hypothetical protein  23.1 
 
 
374 aa  53.5  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0940  Integrase catalytic region  23.28 
 
 
306 aa  52.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1214  integrase core domain protein  24.86 
 
 
294 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000600847  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2522  Integrase catalytic region  28.57 
 
 
153 aa  52.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.898977  normal  0.732387 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  27.54 
 
 
271 aa  52.8  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1895  Integrase catalytic region  23.28 
 
 
306 aa  52.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1902  Integrase catalytic region  23.28 
 
 
307 aa  52.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.484439  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  27.54 
 
 
267 aa  52.8  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  28.26 
 
 
276 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  25.45 
 
 
338 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>