88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5057 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009973  Haur_5220  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 294 aa  593  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5057  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 294 aa  593  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.601105  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5252  integrase catalytic region  57.14 
 
 		 577 aa  318  7e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.56302  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5024  integrase catalytic region  57.14 
 
 		 577 aa  318  7e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3324  integrase catalytic region  39.93 
 
 		 578 aa  146  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00187829  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0375  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 431 aa  53.9  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0006  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 385 aa  53.9  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000397696  normal  0.219937 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3080  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 371 aa  53.9  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2964  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 356 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2485  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 364 aa  53.9  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.151437 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1815  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 383 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2449  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 390 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.708832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0721  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 360 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208316  decreased coverage  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1853  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 385 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.657807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1690  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 358 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1178  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 379 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2869  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 359 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.513593  normal  0.876471 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2305  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 386 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.96472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1352  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 379 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3325  hypothetical protein  36.52 
 
 		 361 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.683157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1366  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 361 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000904408  decreased coverage  0.0000712993 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0896  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 359 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.366884  normal  0.0325311 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0118  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 411 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3091  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 358 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0808941 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2491  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 378 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0709755 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1779  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 378 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1702  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 364 aa  53.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.431472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1564  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 378 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1238  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 378 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0115541  normal  0.0835857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1541  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 356 aa  53.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000437148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1497  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 355 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  hitchhiker  0.000449962 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1978  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 360 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.392869  normal  0.284491 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1990  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 360 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0292285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2429  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 366 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1152  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 378 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2677  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 371 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000537558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2691  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 390 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2714  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 362 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal  0.786621 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2719  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 356 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00913617  normal  0.77965 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2732  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 378 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3016  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 356 aa  53.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3104  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 356 aa  53.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.350781  normal  0.299563 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3167  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 373 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.179309  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3181  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 362 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.299267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3369  TROVE domain protein  36.52 
 
 		 359 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3500  hypothetical protein  36.52 
 
 		 364 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000943241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3517  hypothetical protein  36.52 
 
 		 362 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573832 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1071  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 369 aa  53.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000428907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0779  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 409 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.89745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0729  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 378 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00154402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0321  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 373 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1159  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 358 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.565735  decreased coverage  0.00186464 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0711  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 359 aa  53.1  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000332452  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3514  hypothetical protein  36.52 
 
 		 310 aa  52.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0359697 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0088  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 364 aa  53.1  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2198  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 364 aa  53.1  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2064  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 365 aa  53.1  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0171  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 374 aa  53.1  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0455  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 371 aa  53.1  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.664001 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0748  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 390 aa  52.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000105818  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0876  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 367 aa  53.1  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.506232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1394  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 376 aa  53.1  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.295612  normal  0.0489416 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2762  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 381 aa  53.1  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0891  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 379 aa  52.8  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.233948  normal  0.0447709 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1806  Integrase catalytic region  36.52 
 
 		 336 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.842149 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3937  integrase catalytic subunit  35.58 
 
 		 333 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2546  integrase catalytic subunit  35.58 
 
 		 333 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2591  integrase catalytic subunit  35.58 
 
 		 333 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4011  integrase catalytic subunit  35.58 
 
 		 333 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1534  integrase catalytic subunit  35.58 
 
 		 341 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1511  integrase catalytic subunit  35.58 
 
 		 341 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14260  transposase  33.07 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00196593  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5614  putative transposase  30.97 
 
 		 208 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.147736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3720  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 333 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158828  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0527  Integrase catalytic region  40.71 
 
 		 349 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3793  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 321 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338369  normal  0.128891 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1602  Integrase catalytic region  35.78 
 
 		 607 aa  46.2  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.090134  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05300  transposase  32.28 
 
 		 335 aa  45.8  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.374446  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21500  transposase  30.71 
 
 		 335 aa  44.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03170  transposase  31.71 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3733  Integrase catalytic region  32.67 
 
 		 330 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167687  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0788  Integrase catalytic region  32.67 
 
 		 347 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3083  Integrase catalytic region  32.67 
 
 		 330 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428734  hitchhiker  0.0000289484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4853  Integrase catalytic region  32.67 
 
 		 330 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5264  Integrase catalytic region  32.67 
 
 		 330 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  31.96 
 
 		 597 aa  43.1  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2370  transposase  37.66 
 
 		 103 aa  43.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00301314  normal  0.336671 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10770  transposase  39.13 
 
 		 61 aa  42.7  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>