More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1456 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  100 
 
 
405 aa  805    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0186  Ion transport protein  35.46 
 
 
513 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  30.79 
 
 
509 aa  128  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  25.69 
 
 
531 aa  106  7e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  25.49 
 
 
517 aa  100  5e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  32.87 
 
 
344 aa  95.5  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  30.92 
 
 
330 aa  91.3  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  29.6 
 
 
430 aa  90.1  6e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  30.21 
 
 
337 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  30.21 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  28.12 
 
 
330 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  29.17 
 
 
330 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  31.25 
 
 
393 aa  79  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2854  TrkA-N domain protein  30.88 
 
 
331 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  28.12 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  28.12 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  28.12 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  26.39 
 
 
368 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4718  Ion transport 2 domain-containing protein  27.27 
 
 
331 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0856432  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  29.86 
 
 
325 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0205  hypothetical protein  27.65 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000989873  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5028  hypothetical protein  27.75 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  29.35 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  26.79 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2916  TrkA-N domain protein  26.6 
 
 
477 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.380494  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  24.34 
 
 
419 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5040  hypothetical protein  26.79 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00727764  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  30.45 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3000  Ion transport 2 domain protein  26.67 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  27.6 
 
 
364 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  27.6 
 
 
364 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  27.6 
 
 
364 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  26.03 
 
 
364 aa  67  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  27.6 
 
 
364 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  27.6 
 
 
364 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  31.85 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1267  Ion transport protein  28.57 
 
 
305 aa  67  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.905498  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  29.53 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  29.53 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  32.85 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4765  hypothetical protein  26.73 
 
 
331 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.641012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4605  potassium channel protein  26.73 
 
 
331 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4627  potassium channel protein  26.73 
 
 
331 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5128  hypothetical protein  26.73 
 
 
331 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5547  Ion transport 2 domain protein  29.47 
 
 
351 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.723458 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5008  hypothetical protein  26.73 
 
 
331 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  27.06 
 
 
388 aa  65.9  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  23.51 
 
 
386 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  32.88 
 
 
302 aa  65.1  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  24.35 
 
 
269 aa  65.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  33.33 
 
 
279 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  28.84 
 
 
335 aa  64.7  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1424  Ion transport 2 domain protein  29.69 
 
 
253 aa  63.5  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.287794  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  30.06 
 
 
271 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  25.46 
 
 
346 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  25.97 
 
 
269 aa  63.5  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1898  Ion transport protein  24.14 
 
 
308 aa  63.5  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000138161 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  26.2 
 
 
346 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  32.34 
 
 
228 aa  63.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2771  Ion transport protein  24.54 
 
 
292 aa  63.2  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.415569  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5275  Ion transport 2 domain protein  30.15 
 
 
344 aa  63.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300116  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  33.57 
 
 
240 aa  62.4  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  24.11 
 
 
272 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  29.48 
 
 
269 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  32.77 
 
 
263 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01615  hypothetical protein  29.29 
 
 
347 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  23.91 
 
 
269 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2564  Ion transport 2 domain-containing protein  34.56 
 
 
268 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108416  decreased coverage  0.00000252987 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  29.7 
 
 
341 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  31.65 
 
 
272 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3507  Ion transport 2 domain-containing protein  26.61 
 
 
331 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00681097  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  29.49 
 
 
277 aa  62.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0167  Ion transport protein  26.7 
 
 
273 aa  62.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.177755  normal  0.634812 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0542  TrkA domain-containing protein  25.22 
 
 
326 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  25.22 
 
 
326 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2540  TrkA domain-containing protein  24.07 
 
 
369 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1286  putative potassium channel protein  24.07 
 
 
369 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3453  Ion transport 2 domain-containing protein  25 
 
 
274 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.837221  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1025  putative potassium channel protein  25.22 
 
 
326 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1810  Ion transport 2 domain protein  24 
 
 
345 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.236415  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.19 
 
 
408 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0694  Ion transport 2  30.08 
 
 
276 aa  62  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  25.22 
 
 
326 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  26.02 
 
 
265 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  27.87 
 
 
341 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0909  Ion transport 2 domain protein  25 
 
 
274 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497907  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0919  Ion transport 2 domain-containing protein  25 
 
 
274 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0885  Ion transport 2 domain-containing protein  25 
 
 
274 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.543733  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  27.67 
 
 
417 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  27.67 
 
 
417 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  27.67 
 
 
402 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  27.67 
 
 
417 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1364  TrkA domain-containing protein  25.19 
 
 
369 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  27.67 
 
 
417 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  25.18 
 
 
277 aa  61.2  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2923  Ion transport protein  23.62 
 
 
271 aa  61.2  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  25.22 
 
 
310 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  23.47 
 
 
231 aa  61.2  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  27.67 
 
 
417 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  27.67 
 
 
402 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0139159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>